XLOC_015418


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015418
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 23406453 ~ 23479246 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00033526
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>TCONS_00033528
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>TCONS_00033527
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>TCONS_00033531
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Function

GO:

id name namespace
GO:0046034 ATP metabolic process biological_process
GO:0009060 aerobic respiration biological_process
GO:0006119 oxidative phosphorylation biological_process
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GO:0009141 nucleoside triphosphate metabolic process biological_process
GO:0009144 purine nucleoside triphosphate metabolic process biological_process
GO:0009161 ribonucleoside monophosphate metabolic process biological_process
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GO:0009205 purine ribonucleoside triphosphate metabolic process biological_process
GO:0045333 cellular respiration biological_process
GO:0005743 mitochondrial inner membrane cellular_component
GO:0005753 mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex cellular_component
GO:0043005 neuron projection cellular_component
GO:0044455 obsolete mitochondrial membrane part cellular_component
GO:0045259 proton-transporting ATP synthase complex cellular_component
GO:0150034 distal axon cellular_component
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GO:0098800 inner mitochondrial membrane protein complex cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033526 False 4396 lncRNA 0.33 1 23406453 23410848
TCONS_00033528 False 2152 lncRNA 0.44 8 23406453 23442528
TCONS_00033527 False 2191 lncRNA 0.44 8 23406453 23442528
TCONS_00033531 True 580 lncRNA 0.51 3 23440077 23479246

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015417 rnf2 coding upstream 44520 23351454 ~ 23361933 (+)
XLOC_015415 kifap3b coding upstream 112952 23222939 ~ 23293501 (+)
XLOC_015416 BX548024.3 coding upstream 148556 23257777 ~ 23257897 (+)
XLOC_015414 NA coding upstream 221649 23156012 ~ 23184804 (+)
XLOC_015413 si:dkey-218h11.6 coding upstream 274319 23130389 ~ 23132134 (+)
XLOC_015421 BX470197.1 coding downstream 3552 23482798 ~ 23484348 (+)
XLOC_015422 NA coding downstream 62481 23541727 ~ 23609276 (+)
XLOC_015423 NA coding downstream 70940 23550186 ~ 23557515 (+)
XLOC_015424 rpp40 coding downstream 133794 23613040 ~ 23620223 (+)
XLOC_015425 oxsr1a coding downstream 197933 23677179 ~ 23726605 (+)
XLOC_015410 NA non-coding upstream 379475 23025321 ~ 23026978 (+)
XLOC_015408 NA non-coding upstream 414424 22985130 ~ 22992029 (+)
XLOC_015407 NA non-coding upstream 490069 22911192 ~ 22916384 (+)
XLOC_015426 BX649335.1 non-coding downstream 200627 23679873 ~ 23679989 (+)
XLOC_015428 NA non-coding downstream 293672 23772918 ~ 23779429 (+)
XLOC_015432 NA non-coding downstream 457289 23936535 ~ 23940330 (+)

Expression


Co-expression Network