XLOC_015527



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_015527
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 30329405 ~ 30334513 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00033554
gtgtataaaaGTATGGAAGGTGTCATGTGTATTTCTATGGAGTGCTTcaaaagtgtatatgtatagggtgtatcATGTTTGAATATGGTTGTAGtgaatcatgtgtgtatatgtatatgtatatagagtatattgtgtgcatatgtatatagtgtagAGTGTATTGTGTGAATATGTATAGGGTGTATCGTGTGTGAAAGTATGGAAGTTGTCATGTGTATTTGTATGGAGTGTTTCATGTGTGCATATGGTTGTAGTGTTTCATGTGTATATGTGCacggtgtgtgtatgtatagagtgtataataAGATACTATACTGTATCATTCATCTTCCAATAGCTCAGTGGTAATCACCGGTCACCTGTCAtgccagagacccaggttctatcaTGTGTACTTATGTATAGAGTGTCAAGTGTGAATATCTAAAGTGTATAAAGTTTACCTTGTGTGTATATGAGAGTGTTTCATGTGTGTCTATGTAAAGTGTGAatatatagagtgtatcatgtgtgtaaaaGTATGGAAGGTGTCATGTGTATTTGTATGGAGTGTTtcatgtgtctatatgtatggagtgttttatgtgtg

Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033554 True 592 lncRNA 0.35 2 30329405 30334513

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015526 si:dkey-82k12.13 coding upstream 43156 30281444 ~ 30286249 (+)
XLOC_015525 CR788254.3 coding upstream 48901 30277334 ~ 30280504 (+)
XLOC_015524 CR788254.1 coding upstream 52343 30276217 ~ 30277062 (+)
XLOC_015523 CR788254.2 coding upstream 59242 30269306 ~ 30270163 (+)
XLOC_015522 tmem70 coding upstream 77058 30249977 ~ 30252347 (+)
XLOC_015528 NA coding downstream 31288 30365801 ~ 31460329 (+)
XLOC_015529 pi15b coding downstream 34287 30368800 ~ 30376396 (+)
XLOC_015530 crispld1b coding downstream 45137 30379650 ~ 30395993 (+)
XLOC_015531 socs6b coding downstream 88915 30423428 ~ 30430345 (+)
XLOC_015532 neto1 coding downstream 129312 30463825 ~ 30480455 (+)
XLOC_015521 NA non-coding upstream 131664 30197370 ~ 30197741 (+)
XLOC_015518 BX510360.1 non-coding upstream 202469 30126414 ~ 30126936 (+)
XLOC_015544 NA non-coding downstream 741063 31075576 ~ 31084080 (+)
XLOC_015545 CT955962.3 non-coding downstream 765931 31100444 ~ 31217778 (+)
XLOC_015546 CT955962.2 non-coding downstream 766575 31101088 ~ 31101573 (+)
XLOC_015547 CT955962.1 non-coding downstream 773416 31107929 ~ 31108414 (+)

Expression



Co-expression Network