XLOC_020869 (CABZ01077220.3)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_020869
gene name CABZ01077220.3
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 8239451 ~ 8250080 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00041087
TGACCAgccgggagccttgggctcatctatcactCTCacggttctctcctgggacagcatgccaaacttgcttaaatagtcaagcattatctaagtgtgaattcttgaaataaggcaggtgtaaaaacacccttagttttttttttttacccagacatttaaaaagaacatgtgTTAGAGCAGTAATCGCAATATTGTTAAACCATGTTATTTTTATCCAATGTTATCATAACGTCAGAATCTTTTACCGGCCCATGTCTAGTCAAAAAACAGAAAACTGTCTGCTTGAGCTAATGCCAACCTTTTCTTTCTCTGTTTTCTGTGCTGCTGTAACACATAAAGAGGAGGAGAAAATGCTAGTGAGTCATGGACATTCTGTCATTCTTAAGGCTGATGCTGAAGTACAGAGAGATGATGATGTACAGTGGCTGTTTGGAGATACAAATGACCTGATTGCTAAAATGACTGGAAACACCAGAGAGATAACATATCCTGATGAGAGATTCAGAGACACACTGAAGATGGACGAGAAGACTGGATCTCTGACAATCAGTAACATCGGACCTGAACATGGTGGATTTTATAAACTGAAGATCATCAGCAGAGGAGAAGCCACATACAAGACATTCAACATTTGCTTTGAAGAGATGTTTATTGTCGGGAAGATAGAAGGATCTGTCACACTAAAGCCTGATACtgaaatacaaagaaataatGAAATACAGTGGATGATTGGAGATCAAGACCGTCTGATTGCTAAAATGACCAGAGGAGCTAGAAAGATAACATACCACGAGGAGAGGATCAGAAACAGACTAGTGCTGGACGAGaggactggatctctgaccatcaacaaCATCACTATTGAAGACATAAAAAGATATAAGCTGAAGATCATCAGCAGCAGTGGAACCACTGTAAAGAAATTCAGTGTTCTTATTAAAGGGGAGGTACAAACATACATGGAGGGAGATAGAGCTGTTCTACAGTGTGCTGCAGAGATACAGACTGATGAGATCGAATGGAAGTTTGAAAGTGAGGAGTCTCCCATAGCTGAAGTGAAAGGTGGACAGATCTTTCCATATAATGGTCCTAATAGGAGATTCAGAGACGGACTGGAGGTTGATGAAAGAACTGGATCACTGATCATCAAGAACATCAGACATGAGCATGAGGGCCTTTATCAACTAATGAAAAAGAGTTTTAGCACAGGAGACAGTGTCAAAGCATTCAATGTTATGGTCAGAGGTTGTTATGGAAATCGATTGAAGGATCCAGTGACACGACATGAAGTTGTATGAGAGAGAATGGGAAGGAGAAAGAGAGGATGAGTTCACTTTAATGAGAGAAGACATGCCCACCCACTAGTGTCAATCACTGTATCATCAATATTTAAAGGTGACATATAGTGAATTGATTCAATAAGTTAAAttattctctgatatctacatagtagttTTGTGGCTTTGGTGAGTTCAAAAgtggaaaaaatgttttatatacacatttattgaCTCAAAACATATTCCTCCAATCAGAAGCTCCATATTTAATCGTTGTGATTATTAACGAGCTCTGCTCTGATGTTCTGCAGCTTAGAACCTGGaccgttttcaaaataaaagttccacACACATTATAAGCTTAATATAAGCTTACATAAACTTTAAAATTACGATAAAAGTCTGTGTTTTGGCTGCCAAAGTTCTTATGACTTGGCTGCTCAAGCAGGTCCAGCTAAAGAAGAACGTGACCTAAATTACATGCAAATGTTGCGGGTGTGCTAGCTAACTAATGGTCCCATGTGCAGCATAACAGTCTGTGTTTTGTTCTGATacagggtgtccgtggggtcttaaaaagtataaaaagttgataaatcaattatgagaaaataaggcccttaaaaggtattaaaaagacTTAATCaggtttttacgaggtcttaaattttgttcaagcattgttCAAAGTGTTTGAccccaaaaaagcataaatatatttatttttctcctaatattaacaatggtGTGCTCGATCCACACAATTGGTCTAGCCATACGCATCTATCAGGATGATGTCACGTAATTCGCGATAAAcgtgggaaggtgatgtgacgctctccacatgtagcgatTTCTTccaagcttatctgagttctttTGCATGGTTGTGGTACATTGATTTTACTAGTGTTTATTAACAGCTGTTTATTAGCAACTGTTTATTAAggtaaaggtttgatactgattagaacttgtggcgatgaggtcttaaaatattctgaataAGTCTTTAAAAAggcttaaaaaggtattgaaattaccttttcCTGCATATATCCTGTAATAGACCCGTTTTCACTGGGTTTTACACTCAGGAGATTTTCATGAAAACAaggaaactattatgtttgacgTTGTGGCAGTTTCCATGTACGAGCAATTATTATGTACGAGCAATTATAGCTATGGCTTAGGTGTATTCAGATTTTCTTTATATGGCACTTTTAAAGCTCCAGGTATGAACAGATAATAATTTTTCTGAATCTAGAATCCGTCCAGTGAAGTAAAAAATTTATCAGCCCTTAAACTCATGTGTAATAAGATTTTAGATGAAGATGGAAACGTGTTAATTAAAACACTTTCTGAATGTTACACATCATTCTGTATCTGTTACTCTGTTTTAGTTTGGTTCTCATAGCTTTGATTTTGTGTGAAAGTTAATCAGCTCACTTTTGTTTACGGTATTCTACTTTTCATTTGAGCTTCAAACGTGTTGCTGTTATACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaaggtattgaaattaccttttcctgcatataccctgtaatAGACCCGTTTTCACTGGGTTCTACACACTTTTCATGAAAACAaggaaactattatgtttgatgTTGTGGCAGTTTCCATGTACGAGCAATTATAGCTATGGCTTAGGTGTATTCAGATTTTCTTTATATGGCACTTTTAAAGCTCCAGGTATGAACAGATAATAATTTTTCTGAATCTAAAATCCGTCCAGTGAAGTAAAAAATTGATCAGCCGTTAAACTCATGTGTAAAAAGATTTTAGATGAAGATGGAAACTTGTTAATTAAAACACTTTCTGAATGTTACACATCATTCTGTATCTGTTACTCTGTTTTAGTTTGGTTCTCATAGCTTTGATTTTGTGTGAAAGTTAATCAGCTAACTTTTGTTTACGGTATTCAACTTTTCATTTGAGCTTTAAACGTGTTGCTGTTATACTTCATTTATCACCATTGAGCCTATTATTTTATCATGCTTTATCATTTGTTGGCCAATGAcatgttttgaagtgaatttgtttcttttatctAAATCTGATTTATATTTACACAATTTAAGTGCTTCAGCATGAATGCAAATGTCTATGCATTCATGCTGATGCTCTTAAACTAATCATTTACAAAAAGTCAGAAGCTTTTATTCAATGCTTGCGCCTTTCTTTTGATTCTTTTgattcaagtcagaattattagcccccctgaattattagcccccatgcttattttttccccaatttccgtttaacagagagatttttttagcacatttctaaacataatagttttaataactcttttctaataactattttattttatctttgccatgatgacagtaaataatatgtggctagatatttttcaagactcttctatacagcttaaagggacatttaaaggcttaattaggttaattagggtaactagtaaagttattgtataatgatggtttattctgtagactatcgaaaacaaattagcttaaaggggctaataattttgaccctaaaatgttttaaaaaaaaaaaaaataaaatacttttattcaagccgaaataaaacaagtaaaactttctctagaggaaaaaatattatcagacattctgtgaaaatttccttgctctattgaacataatttgggaaatatttaaaaaaaaataagaaaaatcaaatgggggttaataattcagacttcaactgtatataatgtttTGACGTGTGTTCCTAATGAATACATGTAAAACACTTAGTATGCATTTCAAATGCATATTTCAACTGGataaaagtattttgtatttctatttgatGGGGTTTGAATATGACTTGAATCAAACTACTTTAgggttttgtatttttgtagattTCTGATAATGGACTATTCTTTGTAAAAAGTTTATGATGACATCTTTAAAATAGGGCCTCTGAATGGTGCTTTCTCTGTAGTTTGACTTGGCTTAAGATCAGAAcagatcatttatttatattggaGAAGGTGGTCAATGTTTGAATTGATTGTTTGGAAAGTAAAAAAGAGATGGCAGTGCTAGATTTGGAAGCAAGTCCACAATCATTGAAAAGAGGGTACTGTGCAATACCAGTAATAGACTATGACAGTATAGTGTACAATATGGCATCAGCATGTTTGCTAAAGAAATTAGATGGAATAAAATTTCAGTCCTTAGTAACATAATGTGGAGCCTTTAGAGTAGGGCTTCTCAAAACCCAGACCCACCCCTGTTTCATATTTCAAGAGGCCAAATTTTGTGTAAGGGCTTAAAAGTGTGGATTTACTAGTCTGAAAACAGGTGGTAAACTTGTGCACCTTGTGAGTGTCTTTCAGATGATggtttgaaataaattaaaatttgttttagtcattttcagaAATCACTTCTCTCAGTATTAGATTTACTTTAGATTTATGCACACAcctctgaatgtttttaaaaattggaTATCGTTTATCATAGTGTCTTAATATAATTGGTTCGTGtgcagtgatgtgtgtgtgtgtgtgtgcacttgttttaacaattgattatggtttatattactttttatttgtaaatctgTCCTATGCTGCCTATCTT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Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000116833

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00041087 True 5738 mRNA 0.34 4 8239451 8250080

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020868 si:ch73-44m9.3 coding downstream 65207 8157374 ~ 8174244 (-)
XLOC_020867 NA coding downstream 86052 8140611 ~ 8153399 (-)
XLOC_020866 NA coding downstream 113396 8124928 ~ 8126055 (-)
XLOC_020865 CABZ01034698.2 coding downstream 165239 7971101 ~ 8074212 (-)
XLOC_020864 sc:d217 coding downstream 233109 7896072 ~ 8006342 (-)
XLOC_020870 NA coding upstream 34854 8284934 ~ 8292299 (-)
XLOC_020871 CABZ01077218.1 coding upstream 45017 8295097 ~ 8306743 (-)
XLOC_020872 CABZ01061495.1 coding upstream 87619 8337699 ~ 8353386 (-)
XLOC_020873 CABZ01061495.2 coding upstream 95995 8346075 ~ 8346200 (-)
XLOC_020874 CABZ01061498.1 coding upstream 130635 8380715 ~ 8388678 (-)
XLOC_020860 NA non-coding downstream 587599 7649019 ~ 7651852 (-)
XLOC_020857 NA non-coding downstream 617048 7612004 ~ 7622403 (-)
XLOC_020875 NA non-coding upstream 155081 8405161 ~ 8409081 (-)
XLOC_020876 NA non-coding upstream 177855 8427935 ~ 8494949 (-)
XLOC_020877 NA non-coding upstream 189739 8439819 ~ 8444311 (-)

Expression



Co-expression Network