XLOC_020872 (CABZ01061495.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020872
gene name CABZ01061495.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 8337699 ~ 8353386 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00041089
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000074844

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00041089 True 6477 mRNA 0.38 7 8337699 8353386

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020871 CABZ01077218.1 coding downstream 30956 8295097 ~ 8306743 (-)
XLOC_020870 NA coding downstream 45400 8284934 ~ 8292299 (-)
XLOC_020869 CABZ01077220.3 coding downstream 87619 8239451 ~ 8250080 (-)
XLOC_020868 si:ch73-44m9.3 coding downstream 163455 8157374 ~ 8174244 (-)
XLOC_020867 NA coding downstream 184300 8140611 ~ 8153399 (-)
XLOC_020874 CABZ01061498.1 coding upstream 27329 8380715 ~ 8388678 (-)
XLOC_020875 NA coding upstream 51775 8405161 ~ 8409081 (-)
XLOC_020876 NA coding upstream 74549 8427935 ~ 8494949 (-)
XLOC_020877 NA coding upstream 86433 8439819 ~ 8444311 (-)
XLOC_020878 CABZ01061508.1 coding upstream 93394 8446780 ~ 8455462 (-)
XLOC_020866 NA non-coding downstream 211644 8124928 ~ 8126055 (-)
XLOC_020860 NA non-coding downstream 685847 7649019 ~ 7651852 (-)
XLOC_020858 BX511034.3 non-coding downstream 719708 7614672 ~ 7617991 (-)
XLOC_020881 CR974475.1 non-coding upstream 164271 8517657 ~ 8546430 (-)
XLOC_020886 CR450686.3 non-coding upstream 437257 8790643 ~ 8797226 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000299_05988564_06002758 NA coding CI01000299 null 5988095 ~ 6003021 (+)