XLOC_022211


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022211
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 14574498 ~ 14583539 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00044972
cttttCAATccttagtttaataataataatattacagtaGAACAATAAACACACAACCCAGTCATAAGGTGCAActttattaaaaaagtaaaaacaaatatttatacgAATGACTTTTTTTGTTGTATAGAAAAACATTACAATCTTTTTGCACAGAATATTACTAAACAGATTTTaggttagtttttttgtttgtttttttatacaccATACTCTGTGTTACACTTTTTGGGTGGACCACACATAAAGTCGATTAAGCCAAGGACATATGCTGGGGAAGCCGTGTTACTATACGCACACACTTCACAACATACAACCTACACAGCAGAAGTAGAAacctttctttaaaacattaacacCAGAGcgtttcttttttaataataataatatacttatGTTGCATTGCAGTATGCTCTATATACATGCGATTTGGTCTGTCTCGTTACGATAGAACATCCGTTTCTTTTAAAGCGTCACCGAATCGATAAACGTCTGTTGAATGCAAGCAGATGGAGTTTATTCGAGATTGTATTTacacataaatataatatacttCGGGCATGACATTTCTCAGCCTCTTTCAAAAGGAACAAGCATTGTCAGGAAAAACCAATAAACTCTTGTTCAATCTGTACAAGTCACACCCTGAAAGTCTTGTTTCCACTAAAACAATGTGCACGACAGGACCATTGGTTCTCTCTCTCAGAAGCGACAACATCAAAAACGCCGATCCGCCCCACTATACAAAGCGAGCCCTGTGCTAGAAGAACAGAAAGGAACCGCCGAGCCAACGCTAAAGTGGAGCACACTTCCTCCCTCAATATGGCAAACGTCAAGGACACAATTTAATAACAGCGGGGAGTTGTTCCGCGACCAGATCCCTGCCGTTTTGGAGGAATtgaggtcaagttggttttatattcaacaTTGACAACTTATGAAATGCTTCCTATATTGTTTTccacgctactttgaatattcgatctgaaatcgcatgtaagaatgacttttattgacattagcACCATTTATTGACTGTGatcaatgctgtactttgatagtcattagctgctaatatgatttccctatttagaatacTTTACCAAAATTatttaaggagaaagtcagaatgtgcgaatataaaaccaattgtACCACAATTTTGAATGAGTCCTGGACCAGATATGTGCTTTGTGCTCCCTGAGAAGATCCGTAACCTCTCAGTGGCGTCCCATTTGGTGacctgtattgtttttttttggcacTATGTCTTACAGCGTGAGGCACGGGtataaattaaacattatatCTGAGAGGATAAAGACGGAAAAAAGCGCAGTAGCATGCATCGCAAGCAAGGAAATCGTTGCAGCCTACTTGAACACAACACGTGAATGGCAGTGATAGTAGCTTTTGGAACACGTCGCTACGAGTGGAGTCAATTTTATAAGAAAATAGAGTGCCGTAAAAATCTTTCATCTTtactatgtatatttatatatatgtatatattaaaaccCAACGTTTCTCACTGGAGGTTGTGTATGTGACAGGAACAGTATCTTGGTTTGTTTACCCTTAATGACCTCTTATCTATCCATCCCTGAGCTAATCATCTTGGCCCAAGTCTCAAATCCCAAAATCGCTTTCCTGTAGATTTGTAGTAAAATCAAGCACGCTTTTTAGAGTAGTATTATTTCAAACCCCTTGCTTCGTGCTATTCTTTTCTCCCATAATGCATGTGGGAAAGGCATTGTTTACAATAGGATCAAGTCACGCGGACGGGCCCAGAATATGAGACGTCCTTCCAAAAGACATTTGCTAGCAACCCTAAGCCTTGCGCTGTGTTTTCCTTGGACACTGTCTTCATGGAGGGTTGAGCCAGCCGGAGGCCCAGTGAGCCGGGGAGCAGTGCTGGCACACACTGACCTGAGATCTGTGGATCGAGAGTGGTCGCTGGCCCAACTGGAAGCCTTAATTGCCCTCTTTACTCACACCACAATTTTCCAGCACACCAATGCCTCATAATACTCGGATGTTAACAATGCCCATTGAAATCGACATGTTAACTAGCTAGGATGAGGCATCCAGAgaagtgttttgttgttgtttttctcccTACTTTCTGTTCTGTTAATATTGCAAAGTTTGTGAAATCTTGTGAGAAGTGAGTAGTATTTCGCTAAAAACTACCGGAAACGTACACGATTGGGTGGAAGAAGCATGCTTGACAGAATAAGAGAAAAATAAAGGAAATTTAAGAACTAATGCACTTAAACAGCCATAAAGTGACCTTTAAGctggcccacatggaatctgcacacaaacacacaccaaaaaaatTCCCAcagaaaatatgtaaataaaataaaatatatatctggccactttattaggtacaccttactacacAGTATTAGGTTGgaccccccttttgccttcagaactgccttaatccttcatggcatagattaaacaaggtactggaaatattccttaaagattttggtctatattgacatgatagcataagGCAGTTGCCGCAGATTTGTagaccaggcaacgtttttttccaatcttcaattattcaattttggtgagctagTTTCCtactcttagctgacaggagtggcacctggtgtggccttctgctgctgtagcttatctgcctcaaggttggacgtgttgtgcattcagagatgcttttctgcatactgCCTACTTCGGTTGtatcaagtggttatttgagttactgttgtctttctatcagctggaaccagtctggccagtctcctctgacctctggcattaacaaggcatttgcacccaaagaactgcccctcactggatactttctctttttcagaccattctctgtaaacccaagagatggttgtgcgtgaaaatcccagtaaatcagcagtttctaaaattcTCAGATCAGcacgtctggcatcaacaaccatgccacgttcaaagcctcttaaatgacctttcttccccattctgatgatctgattgaactgcagcagatcatcttgaccatgtctgcattaAGTTGCTTCCACGCGATTGGCTAAttcgaaatttgcgttaatgaggagttggacaggtataccttataaagtggcacatgagcgtatatatttattgcattgttgtaATATTTAGATATATGCTACCACTGAAGTCATTGCTTTTTATTCATCAAAGTTTTACGTATTAACACGTAAGTCATTACAATGTTACTAAATAatgtttcaactttttttaaatttcttttaatgatgttttagGTAAGGTTGAAATGACTTGTTAaggtaatttattcattcattcattttattttcggcttagtccttttattaatctagggtcgccacagcggaatgaactgcctaagGTAAATTAAGTCAACGtaaaatttaaattcatttttgtaCAGTGTAAATATTTGTATTACTTGCAAAAATATCTCTCGaataaatgttactttttttattacattgaaattgctattgatattttttttaaatataaagcaacaaactttttaatgaaaaatgttttttgaaaataaaatcagcatattagaatattTGCTGACTCAAGTGACACTAAAGTATATGAGTAATGATCAGCATACATctgaaaatctatttaaatagaAAACTAGATCTATAAATTGTATTATCATTTTACAATACTACTAATTTGCTGTAGTATTATAATGAAAATCTTCTGTTAGAGAgcataaaagataataaaaaaagctttctaaaatacaaattgtaaaatctTACAGAATTTGATCATATAAAGCAATACTAATTTCAAATGTGTTTGGTTAGCCAGCTTGCCCTCAATTCCATTTATTCACTTGAAATCCATAAAAACAACCCTGCAgaatttttctcaaaataagtaattgcaaacaataaataaaaaaaatttaaaaatcagcAGATTCCATCTGGGCCTTGCTGTAATTAGTACTGAAAAGACGACCACACATACCATATGTACACCACCTAAATTGTCACACTTCATACAAAATGCCTAACGTGTAAAAAAGGAGAAGTTaacttgttttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttaagctaAACTAACACTGTGGTGCTGGCTGGCAGTCTCCAGCTGAGAGAACCAGTCGGGTGTGTTTAAGGTTAAGCTGACGTCTCATGTGATCCCTGTGTCAATGTGCAGGTAAAACTCACACGGCAGAGAGATTgaacaacagtgtgtgtgtgtgtgtgtgaatcctgATCCAAGCTCTGCTACAGTGGgtttatacagttaaagtgaTTTGAACCCTGCTTTttcattacactgcaaaaatgcttattttactaCCTACACTCAAAGAAATGTCcttttctgtttgttcaaactgcttattgaAAATGAGCTCAAACAATTTTTGAGTCATTTGGGaaaactgaattgttttatgttcaatcgaaaaaaaaaacaaaaaaactttcaaaTCAACTtattttcttcatgttgtcccaacacaaatcatttgTGTGGATCGATACGTCTttacttaaattaatattttggcttgcttttacaaaacaaatatctAAACTTTCTGAAATTGAGGTACATTTATTTGAAAAGGAAACTTCTTAAAGTCAGCTTAAAATGGACAGTGGTATCAGTTTTTTCTGGCTACTCAAACAAGACAACATGTCGGGCAGGGCTTAGATTTGATTGTCAGGAATTGATTGAATGGTTGGAAAGTGGCAGTTTGCTATTGGTGAATCTCATATAATTGACAGGTTGTTCAAGTCAGTAAACACGACATATGATAATAAAATGATATCACAAGTCAATCTCACACCAACTCataacgttttgatttagtgcCTCATTCcaattaatttgtaattttagtactatttgctcatcccccaataagGGGTAAGGTTAAATATTGGGTTTGATGgaacacctccttttaaaaaaacg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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00044972 True 8673 lncRNA 0.36 2 14574498 14583539

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022210 CR388373.2 coding downstream 159285 14407888 ~ 14415213 (-)
XLOC_022209 nkain4 coding downstream 170559 14265122 ~ 14403939 (-)
XLOC_022208 ddx23 coding downstream 357992 14193547 ~ 14216506 (-)
XLOC_022206 adcy6a coding downstream 515413 13940958 ~ 14059085 (-)
XLOC_022207 BX897727.1 coding downstream 585016 13989364 ~ 13989482 (-)
XLOC_022212 NA coding upstream 151796 14735335 ~ 14738386 (-)
XLOC_022213 gss coding upstream 159548 14743087 ~ 14769523 (-)
XLOC_022214 sla2 coding upstream 224682 14808221 ~ 14990921 (-)
XLOC_022215 phf20b coding upstream 409261 14992800 ~ 15036789 (-)
XLOC_022216 si:ch211-218g4.2 coding upstream 463005 15046544 ~ 15090782 (-)
XLOC_022203 NA non-coding downstream 750306 13818507 ~ 13824192 (-)
XLOC_022202 NA non-coding downstream 764901 13806359 ~ 13809597 (-)
XLOC_022201 CU929459.1 non-coding downstream 859998 13714386 ~ 13714500 (-)
XLOC_022217 BX537335.1 non-coding upstream 524309 15107848 ~ 15107962 (-)
XLOC_022219 NA non-coding upstream 848874 15432413 ~ 15563597 (-)
XLOC_022220 NA non-coding upstream 1106992 15690531 ~ 15697049 (-)
XLOC_022221 NA non-coding upstream 1112988 15696527 ~ 15764318 (-)

Expression


Co-expression Network