XLOC_030177


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_030177
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 30780430 ~ 30974079 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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RNA

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TCONS_00061723 False 629 lncRNA 0.47 5 30780430 30916825
TCONS_00061724 False 937 lncRNA 0.45 5 30780430 30921998
TCONS_00061725 False 1307 lncRNA 0.42 6 30780430 30974079
TCONS_00061726 False 930 lncRNA 0.46 6 30780564 30828980
TCONS_00061727 False 33984 lncRNA 0.36 1 30780587 30814570
TCONS_00059006 True 412 processed_transcript 0.47 4 30780600 30826892

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_030176 ruvbl2 coding upstream 9623 30759232 ~ 30770807 (+)
XLOC_030175 ftr83 coding upstream 27263 30741730 ~ 30753167 (+)
XLOC_030174 BX276103.2 coding upstream 52782 30723129 ~ 30727648 (+)
XLOC_030173 atp5l coding upstream 78539 30699260 ~ 30701891 (+)
XLOC_030172 pdzd3b coding upstream 82522 30680804 ~ 30697908 (+)
XLOC_030179 ube2g1a coding downstream 12433 30986512 ~ 30995108 (+)
XLOC_030180 ankfy1 coding downstream 22243 30996322 ~ 31030840 (+)
XLOC_030181 zzef1 coding downstream 62832 31036911 ~ 31109968 (+)
XLOC_030182 atp2a3 coding downstream 194017 31168096 ~ 31269354 (+)
XLOC_030183 camkk1a coding downstream 309497 31283576 ~ 31432727 (+)
XLOC_030164 BX897688.1 non-coding upstream 613858 30166456 ~ 30166572 (+)
XLOC_030162 dre-mir-125b-2 non-coding upstream 781583 29998762 ~ 29998847 (+)
XLOC_030161 dre-let-7a-4 non-coding upstream 789886 29990452 ~ 29990544 (+)
XLOC_030160 mir100-2 non-coding upstream 790209 29990147 ~ 29990221 (+)
XLOC_030185 CR759893.1 non-coding downstream 574233 31548312 ~ 31548787 (+)
XLOC_030191 NA non-coding downstream 930768 31904847 ~ 31912078 (+)
XLOC_030192 NA non-coding downstream 936924 31911003 ~ 31918136 (+)
XLOC_030198 NA non-coding downstream 1109650 32083729 ~ 32086577 (+)
XLOC_030204 NA non-coding downstream 1286084 32260163 ~ 32264060 (+)

Expression


Co-expression Network