XLOC_030760 (CABZ01076744.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_030760
gene name CABZ01076744.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 3258123 ~ 3266117 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00059886
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>TCONS_00059885
ATGGTCAATCagatgttcatgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgttttgatgttcTGTCTCCACAGGCTCAGCTATTTGCTAAAAGAGAGCATGAAAATGTGGTGCAGGTGCTGGAGAGCACACTGGACTGCATGCAGgcaAAAGTGCGCGAGCTGGAGGACAAATGCCGCAGTCAGAGTCAGCAGTTCGGGATGCTGTCGCAGGAGCTGGATAAATTCAGACTTCAGGCCTCGAAGATCGACCTATCAGAGGCCGCTTTACTGTGCGGCGCCACCCTGAGTCAGCTGACCAATGGGGTTGGCCTACCCGGAGACACCGGTACGTTAAAACTATCATTACACACAGATTACACAGACGGGTTgagaaataaaagtttgatgtAAGGTTTATGATAAGCCACTGTGAGTTTGGAAGTTTAACTGACGGCTCTGTGTGATGCATTTGCATGTGAAGGGGAGTCAGATTTTCATACCACTTTCCGTCACCTCCTCTAGCCAGTGGCTCAAATTTTGTCAACCCGCCAATGCCATTTTTTAGctgcacaatcaaattcaaaaccgcccaatctggcaacactgaataCGAGTTTCTTTGCATTTGCTGGATTTATTAGGTGTGGgtcaaatgttaatatttgtttattaatacattttaataaatgtctttaacgtttatttatttatttt
>TCONS_00061506
CATAGATAAGTTATTTAGTCTAATCATTAATCtgtgtataattataataatagattattcatctagattaatctcactgtaatcttggaatgaATCTAGATTGAAATAGCTCATGTGAGGCAGTCAGATTACTTGTGCTAAGTCTcaagaacgggtttctcaagccaggtggcgcattagaccaggggctcatctcctgtttccaaaatgcatcacaaactgcttgagaaactgttctgctgtgataattggtgatgaaaatcgCCAAATGCaggagtttttttctttccatttggcgtgcgttattaaattccacaaCACTGTCATCAGTCCTTACTCATTATTTGCGTCTAattggcatgaatgaaatgttcatgggtGAAAGGGAATAGGGGCAACTGTTCATTTTGGGTCTGTATTGTTGGAGTGTAGGGTTTGAGCACATTCAGCAGTGATGCGGCTCTACAGGTCCTGGTCTGCAGCAGTGATAATCTCAGCTAATATCTGCtgtatggagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcaaacgcATGATCTCTCCTCTCTTTGTTTCTgtcttttgtttgtgttttggttGGCTGCTAATCAGAGCACACTGGACTGCATGCAGGTATCagaaacacacacgcaaacagcCCTCTTAGCACccatttggtgtgtgtgtgtttgtttatctgtCTTCGTGTGTTCGGTTTGTTGGTCGGTTGGTttgtccatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtttgtgtttatgctTGTGTTAGTTTGTTTATAAGTATGTGTGTGCGCAAATGTGTGTGTTcctgcgtatgtgtgtgtgtgtttgtttgtctttatgcttttgttagtttgtttataagtctttgtgtgtgcgcatatgtgtgtgttttcgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtatgtgtgtttgtctttATGCTTGTGTTAGTTTGCTTATAAGTctttgtgtgtgcgcatatgtgtgtgttctcgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctttaaacttgtattagtttgtttataagtctttgtgtgtgcgcatatgtgtgtgttctcgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtttgtttgtctttatgcttgtgttagtttgtttataagtctttgtgtgtgcgcatatgtgtgtgttctcgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctttaaACTTGTGTTAGTTTGTTTATAAGTctttgtgtgtgcgcatatgtgtgtgtgttgtcgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtatgtgtgtttgtctttatgcttgtgttagtttgtttataagtctttgtgtgtgcgcatatgtgtgtgttcttgtgtatgtgtgtgtgcacatgtgtgtgtggtTTTGAGTGCGTCTTAAAGGTTATTCAGGCCACTGTAGACTGCAGGTTTTCACAGCCGCTCTCATACACTCCTCAAACACTGTTCAGTTATTTCTCTCACAGTTTCAGCTCACAGACAACTTTTAGAAATGACCTGCAGCGCTGCAAATAAACATTCATCATCAATCCTTTACAGGAAAATACACTTTAATCTTTCTACTTCCCAAAGTTTGATTCATACTACACTATATACTATCATGCTGTACTCTTATTAG

Function

GO:

id name namespace
GO:0032787 monocarboxylic acid metabolic process biological_process

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117274

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00059886 False 665 lncRNA 0.44 2 3258123 3266117
TCONS_00059885 False 686 lncRNA 0.44 3 3258123 3266117
TCONS_00061506 True 1734 lncRNA 0.40 2 3261173 3263750

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_030759 CABZ01076737.1 coding downstream 48778 3184755 ~ 3209345 (-)
XLOC_030758 NA coding downstream 89098 3167199 ~ 3169025 (-)
XLOC_030757 hsf5 coding downstream 139777 3094981 ~ 3118346 (-)
XLOC_030756 NA coding downstream 168660 3087231 ~ 3089463 (-)
XLOC_030755 FQ323163.1 coding downstream 482651 2772289 ~ 2775472 (-)
XLOC_030761 CABZ01084961.1 coding upstream 44891 3311008 ~ 3430355 (-)
XLOC_030762 NA coding upstream 85991 3352108 ~ 3354567 (-)
XLOC_030763 NA coding upstream 207748 3473865 ~ 3501835 (-)
XLOC_030764 NA coding upstream 287483 3553600 ~ 3554809 (-)
XLOC_030765 hspb1 coding upstream 301899 3568016 ~ 3584815 (-)
XLOC_030748 CR931815.1 non-coding downstream 1045335 2212672 ~ 2212788 (-)
XLOC_030746 NA non-coding downstream 1258630 1997764 ~ 1999493 (-)
XLOC_030767 FO704648.2 non-coding upstream 394541 3660658 ~ 3670238 (-)

Expression


Co-expression Network