XLOC_031010 (si:dkey-114c15.5)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_031010
gene name si:dkey-114c15.5
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 23176493 ~ 23179335 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00060251
GCGGAGAGCGTTGTCATGGAAACGAAGCAACGACACGACACCTGACCGTCAACAGCACTTCTCTCATGCGGCAGTTTTCACTcatttcaggagtgaCAAAATTACCCCTACAACAGAAGAGAAGAGCCAAGATGAAGGGAGCTAATCACAGAGCTGGAGGAAACACATATTTTGGATCGTCCTCCACTCACTCTACCACTTTGTTTTTCATTGCCAGACTTCATTTAAGAAGCCTGCTACAAGAGAGACAGCGGAAGGGAGCCTCAAAGACATTTTTATTAGGATCTGCTAATCATGAGGGGGCAGACAAAAGAACctgcattttccttcagcttaatatcaggggttgccacagcgtaagGAACTGGATAttactttggcatatgttttacacagccttccagctgcaacccagcactgtgaaacacccatacactctcgtatTCACAGACACTTCTACACTATtttcaaattcacctatagcacaagtgtttggactgtggtggaaacccacaccaaaacagggagaacatgcaaactccacacagaaatggcagcggacccagccgggactcataccagcaacctttttgctgtgaggtgacagtctgagccactgtgctgccccagtGTAGTTATTAATAACCTCCAGATGTTTTAGTttgattttgtaataataatgcacgtttacatttattgtaatatgtatgttaatatttatccacaatgtaatttatttttatgttatttataataacGTTAAATGTCATAAGGatgttataatttaatataatattataataaataattataataatgttaaaatataaataatacaagattatttatgtttttaatagtttatttttataatgagaaGTCTCAaagtttttctttattatagaaaACTCATTGTTGAATGGCtaccactttaaaataaggttgtatgaaatagttaatttatttactaacataataaacaatacatttactacagtatttattcatctttgctaaTGTTGGTGAATGGTAAAAAGTTGTTaattgttaattcatgttaacttgcaatgtattaactaatgttaacaagcatgactgattttattaatgcattagtaaatgctgtacatAAATTATGCTGTACAGGTATTGTTCTTATTAGTTCACATTTAAACCATTAACATTACTTATAAAACCACTGTAAAATGTAACTGTTGTATgtatgttgttatattatatttgtatgtattttatatgtattttgttatatttgttaacgtatgtgtttttgaaacatttcattaTAATCtaagtgtttaatgtatgttctttatgctgtattataaataaatgttgtaatgATTAA
>TCONS_00060252
CCATTCAAGCACTGCAGCGGAGAGCGTTGTCATGGAAACGAAGCAACGACACGACACCTGACCGTCAACAGCACTTCTCTCATGCGGCAGTTTTCACTcatttcaggagtgaCAAAATTACCCCTACAACAGAAGAGAAGAGCCAAGATGAAGGGAGCTAATCACAGAGCTGGAGGAAACACATATTTTGGATCGTCCTCCACTCACTCTACCACTTTGTTTTTCATTGCCAGACTTCATTTAAGGATAAGAAAGAAGCCTGCTACAAGAGAGACAGCGGAAGGGAGCCTCAAAGACATTTTTATTAGGATCTGCTAATCATGAGGGGGCAGACAAAAGAACctgcattttccttcagcttaatatcaggggttgccacagcgtaagGAACTGGATAttactttggcatatgttttacacagccttccagctgcaacccagcactgtgaaacacccatacactctcgtatTCACAGACACTTCTACACTATtttcaaattcacctatagcacaagtgtttggactgtggtggaaacccacaccaaaacagggagaacatgcaaactccacacagaaatggcagcggacccagccgggactcataccagcaacctttttgctgtgaggtgacagtctgagccactgtgctgccccagtGTAGTTATTAATAACCTCCAGATGTTTTAGTttgattttgtaataataatgcacgtttacatttattgtaatatgtatgttaatatttatccacaatgtaatttatttttatgttatttataataacGTTAAATGTCATAAGGatgttataatttaatataatattataataaataattataataatgttaaaatataaataatacaagattatttatgtttttaatagtttatttttataatgagaaGTCTCAaagtttttctttattatagaaaACTCATTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095150

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00060251 False 1366 mRNA 0.33 4 23176493 23179319
TCONS_00060252 True 941 mRNA 0.38 4 23176944 23179335

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_031009 uprt coding downstream 58203 23107804 ~ 23118290 (-)
XLOC_031008 NA coding downstream 201852 22956895 ~ 22974641 (-)
XLOC_031007 si:ch211-26b3.4 coding downstream 224337 22871718 ~ 22952156 (-)
XLOC_031006 apool coding downstream 307843 22851857 ~ 22868650 (-)
XLOC_031005 zgc:113208 coding downstream 555076 22605530 ~ 22621417 (-)
XLOC_031011 iqcd coding upstream 16732 23196067 ~ 23200880 (-)
XLOC_031012 BX640521.1 coding upstream 43366 23222701 ~ 23222819 (-)
XLOC_031013 plp1b coding upstream 88786 23268121 ~ 23280098 (-)
XLOC_031014 nlgn3b coding upstream 104555 23283890 ~ 23317477 (-)
XLOC_031015 CT025748.1 coding upstream 151818 23331153 ~ 23341623 (-)
XLOC_031001 NA non-coding downstream 666429 22506445 ~ 22510064 (-)
XLOC_030999 NA non-coding downstream 719204 22455566 ~ 22457289 (-)
XLOC_030998 NA non-coding downstream 720499 22453830 ~ 22455994 (-)
XLOC_030997 BX546499.2 non-coding downstream 737898 22435786 ~ 22438595 (-)
XLOC_031017 NA non-coding upstream 266909 23446244 ~ 23456234 (-)
XLOC_031029 BX957257.2 non-coding upstream 578598 23757933 ~ 23758587 (-)
XLOC_031030 BX957257.1 non-coding upstream 589042 23768377 ~ 23770557 (-)

Expression


Co-expression Network