LOC118942957


Basic Information

Item Value
gene id LOC118942957
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 58029260 ~ 58035943 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036958277.1
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>TU2011854
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>TU2011855
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Function

NR:

description
PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: RNA-directed DNA polymerase from mobile element jockey-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036958277.1 False 4125 mRNA 0.42 2 58031011 58035943
TU2011854 False 2147 lncRNA 0.40 2 58029260 58032414
TU2011855 True 1806 lncRNA 0.40 2 58030179 58032414

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rell1 LOC106608524 coding downstream 71715 57904754 ~ 57959296 (-)
zmp:0000000660 arap2 coding downstream 494227 57279508 ~ 57536784 (-)
LOC118942954 NA coding downstream 1738336 56291672 ~ 56292747 (-)
LOC118942811 NA coding downstream 1799969 56230477 ~ 56231042 (-)
LOC118942810 NA coding downstream 1930140 56100143 ~ 56100871 (-)
paqr9 paqr9 coding upstream 555 58036498 ~ 58040363 (-)
LOC110500948 zmynd15 coding upstream 7713 58043656 ~ 58052984 (-)
LOC110500947 zmynd15 coding upstream 17182 58053125 ~ 58056083 (-)
LOC110500946 fbxo24 coding upstream 20604 58056547 ~ 58068333 (-)
adam19a LOC106608525 coding upstream 133248 58169191 ~ 58391025 (-)
G1757127 NA non-coding downstream 5550 58023747 ~ 58025461 (-)
G1757123 NA non-coding downstream 12653 58017511 ~ 58018358 (-)
G1757116 NA non-coding downstream 28186 58002393 ~ 58002825 (-)
G1757095 NA non-coding downstream 34160 57962797 ~ 57996851 (-)
G1757111 NA non-coding downstream 34619 57993629 ~ 57996392 (-)
G1757130 NA non-coding upstream 6707 58042650 ~ 58043057 (-)
G1757162 NA non-coding upstream 67883 58103826 ~ 58104805 (-)
G1757169 NA non-coding upstream 74372 58110315 ~ 58111026 (-)
G1757139 NA non-coding upstream 143968 58179911 ~ 58180455 (-)
G1757217 NA non-coding upstream 214746 58250689 ~ 58254043 (-)
G1757074 NA other downstream 121877 57908139 ~ 57909134 (-)
G1757073 NA other downstream 128418 57902086 ~ 57902593 (-)
G1755322 NA other downstream 1623693 56406582 ~ 56407318 (-)
G1755310 NA other downstream 1640445 56390057 ~ 56390566 (-)
G1754243 NA other downstream 2757062 55272218 ~ 55273949 (-)
G1757692 NA other upstream 764231 58800174 ~ 58805825 (-)
G1758095 NA other upstream 1156489 59192432 ~ 59195490 (-)
G1758845 NA other upstream 1987824 60023767 ~ 60024903 (-)
G1758890 NA other upstream 2086599 60122542 ~ 60123364 (-)

Expression


Co-expression Network