G1808367


Basic Information

Item Value
gene id G1808367
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 39108339 ~ 39123554 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2069005
tccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctttatctctacttctctgtcctttcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatcctcctctccttccaccccttctctgtcctgtcctacatccttccctctatctttaCCTCTTTGTCCTATCATACATCCTTCCCTTTATCTATACTTCTCTGTCCAATCCTccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccgtccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccttccctctatcgctacctctctgtcctttactccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccattTTTCactctatctctacttctctgtcctatcttctatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatcgctacttctctgtcctatcccacatccttccctctatctctacttctctgtcctatactccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctctctacttctctgtcctatcctacatcctcctctccttccaccccttctctgtcctgtcctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctttatctctacttctctgtcctatcctccatcctcctctccttccaccccttctctgtcctgtcctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctatatctctacttctctgtcctaacctacatccttccctctatctctacttctctgtcatatcctccatcctgccctctatctctacttttctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttatctgtcctatcctacatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctatCCTACATCCTTCCCTCTAGCTCTACCTCTCTGTCCAATCCTACTTCCTTCCCTCTagctctacttctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctatcctacatccttccctctagctgtacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacttctctatcctatcctcaatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatcctgccctctatctctaccactctgtcctatcatccatccttccctctatctctacttctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctatcctccatcctcctctccttccatcccttctctgtcctatcctccatcctgCCGTCTATCTCTACgtctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacgtctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacttctctatcctatcctccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatCCTGCCCTCTATCTATACTTCTCTGTCCTTtcttccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcccacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcccacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctctatcattccctctatctctacttctctgtcctatcctccatctttccctctatctctacttctctgtcctatcttccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctaatTCTCTGTCCTATCtcacatccttccctctatctctacttctctgtcctatactccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatcttcctctccttccatcccttctTTGTCCTATCATCCATCCTGCCCTCAATCTCTACCTCTTTGTCcaatcctccatcctcctctccttccaccccttctctgtcctatcctccatcctgccctctatctctacctctgtcctatcctccatcctcctctccttccatcccttctctgtcctatcatccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacctctctatcctttgctccatcctgccctctatctctacctctctgtcctatcatccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctaactctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctatcctccatcctcctcttcttccatcccttctctgtcctatcctccatcctaccctctatctctacctctctgtcctatcctccaccctcctctccttccatcccttctctgtcctatcctccatcctgccctctatctctacctctctatcctatcctccatcctcctctccttccatcccttctCTGTCTTATCCTCCATCctgccctctatctctacctctctgtcctatcctccatcctcctctgctTCCATCCCTTCTCTATCCTGTCCTCCATCCTGCCCTCTAGCTCTACCTCTGTCCTATcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctctaTTTTTCactctatctctacttctctgtcctatcttccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctttatctctacttctctgtcctttcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatcctcctctccttccaccccttctctgtcctgtcctacatccttccctctatctttaCCTCTTTGTCCTATCATACATCCTTCCCtttatctctacttctctgtccaaTCCTACAACCTTCCCTCTAtttctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacctctctgtcctatcatccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccacCCTTCCCTCTATCTCCACCTTTCTGTCCTttgctccatccttccctctatctctacttctctgtcctattctccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatcttcctctccttccatcccttctTTGTCCTATCATCCATCCTGCCCTCAATCTCTACCTCTTTGTCcaatcctccatcctcctctccttccaccccttctctgtcctatcctccatcctgccctctatctctacctctgtcctatcctccatcctcctctccttccatcccttctctgtcctatcatccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacctctctatcctttgctccatcctgccctctatctctacctctctgtcctatcatccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctaactctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccttccctctatctctacctctctgtcctatcctccatcctcctctccttccatcccttctctgtcctatcctccatcctaccctctatctctacctctctgtcctatcctccaccctcctctccttccatcccttctctgtcctatcctccatcctgccctctatctctacctctctatcctatcctccatcctcctctccttccatcccttctCTGTCTTATCCTCCATCctgccctctatctctacctctctgtcctatcctccatcctcctctgctTCCATCccttctctgtcctgtcctccatCCTGCCCTCTAGCTCTACCTCTGTCCTATcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacctctctgtcctatCATCCATCCTTCCccctatctctacttctctgtcctatcctccatccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatcctgccctctatctctacttctctgtcctatcctccgtccttccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccgtccctctatctctacctctctgtcctttgctccatccttccctctatcgctacctctctgtcctttactccatccttccctctatctctacttctctgtcctatcctacatccttccctct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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2069005 True 7296 lncRNA 0.48 7 39108339 39123554

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118943609 NA coding downstream 128313 38975839 ~ 38989602 (-)
LOC110501854 LOC106582380 coding downstream 178598 38899484 ~ 38929741 (-)
LOC118943608 NA coding downstream 194794 38911464 ~ 38913545 (-)
ccnyl1 LOC106582379 coding downstream 215598 38874414 ~ 38892741 (-)
LOC110502145 LOC106586333 coding downstream 381743 38520872 ~ 38726596 (-)
LOC110502146 LOC106582388 coding upstream 306118 39429672 ~ 39436466 (-)
LOC118943588 NA coding upstream 313645 39437199 ~ 39441516 (-)
ramp1 LOC106582391 coding upstream 466475 39590029 ~ 39680169 (-)
LOC110501861 LOC106582392 coding upstream 559666 39683220 ~ 39731114 (-)
LOC110502147 LOC106582393 coding upstream 612875 39736429 ~ 39847997 (-)
G1808362 NA non-coding downstream 13762 39092747 ~ 39094577 (-)
G1808353 NA non-coding downstream 21510 39081824 ~ 39086829 (-)
G1808352 NA non-coding downstream 33565 39071813 ~ 39074774 (-)
G1808343 NA non-coding downstream 48903 39059103 ~ 39059436 (-)
G1808385 NA non-coding upstream 42866 39166420 ~ 39229856 (-)
G1808451 NA non-coding upstream 186703 39310257 ~ 39310489 (-)
G1808482 NA non-coding upstream 222287 39345841 ~ 39346042 (-)
G1808510 NA non-coding upstream 249614 39373168 ~ 39373373 (-)
G1808627 NA non-coding upstream 328012 39451566 ~ 39452483 (-)
G1808299 NA other downstream 163809 38944136 ~ 38944530 (-)
G1807731 NA other downstream 895152 38208790 ~ 38241273 (-)
G1807750 LOC106582372 other downstream 913243 38193422 ~ 38195096 (-)
G1807020 LOC105030512 other downstream 1348091 37759971 ~ 37760248 (-)
LOC110501878 LOC106582406 other upstream 1613094 40736648 ~ 40813437 (-)
LOC110501886 rhg15 other upstream 2324345 41447899 ~ 41523764 (-)
G1811042 NA other upstream 2481420 41604974 ~ 41605231 (-)
G1812079 LOC106582433 other upstream 3263268 42386822 ~ 42389273 (-)
LOC110502155 psd12 other upstream 3481149 42603998 ~ 42605768 (-)

Expression


Co-expression Network