G1814375


Basic Information

Item Value
gene id G1814375
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 44436030 ~ 44441556 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2075703
CAGTCGTTTATTCGTCGGTCCAACTGTACATGATGCAGTGTTGATAGGGACACGAGATGATGACTAACATGGAGTTTTACACAATGCCAGTGCTATGGCAGCACTTGGAACACACCAACTGTCTGTCAGCTGAGCTGGAAACTAAAGTCCTGGAAAAGTAACCTGTTGAGGCTTCGgcacatacagtatgtcagattTGGAATAGTCATTTTTTAGATAGGttgaaaaacacacaaaatatatattttcttcgATTCCACAAATGTAAAAGGATGCTCTTTCGCTTTTCACTTGGACACGTTGATTCAATTATGCACATTGTCATTCTTTATTTCAGTACTTTGAAGCGAAATGAAATGAGATGTGGGAATAGCTGAATACAAAATGTTGGCTGGATTCGCAGAGGTTTTTATTCCATGTTTATACTGATATCATTATTTCATGTAATAACCCCATAAGTTTGTGCAATATCTTTCTTTGCatagaaataaaatgtaaatattttgTTTGTTGACATGCACCTATCTTTAGCAGCATATTTTATCTTGCGGATGTGGGACTCCCTTGTAGAATTATAAGCCCACTATATAGTGTGAATACATGCAGCGTACCAGCAGAGATGAACTTGATTTCTAGTAAGAGTTTATGAGAGCACAAGCCAGCCAGTATAGTGGGTGTTGATGAGGACTGTTAAATAGTGGCACCACCTGATCAGACAGGTGGAACTAGTCTGCAGGGAcacactgtgtgtctgtctgcagcactgtgagagagaggaacagactatGGGGAAAGTGCTCTGTGTGCGACAACATCCAAACATTCCACGTGATTGATTCTTTTGGATTTTGAGTCACTGCTGGAAGTACTTAAGGAACCCGATGACGTCATTGACTGTGTCATGTATCATTATCACTATGCCCTGACCTTTAGAGAAGACACTGTATACCCCTAAATCTGACCTCTAGAGAAGCACCCCTAAATCTGACCTCTGGAGAAGCACCCCTAAATCTGACCTCTGGAGAAGACACCCCTAAATCTGACCTCCGGAGAAGACACCCCTAAATCTGACCTCTGCTCTGTCCCATGTATACTGACCCTGACCCTTGACCTCTATATTGGATAAATACAGTGTGTAACGAGTGATAACTTTGCTGAACACCTAATAGGTAGATCATTACATTCTCTGGTTATCCATAGCATTTTGGACCAAATCATAATTCCGTTACTGTTTTTTTCATTAACATTACCATAAACACCCGCTATACAACATGCTTAAAATAAACCCAAAGCAGAAATGATATGTTATAATTCAGAAGCTGGACCCTTGTTCCTCTTTTATGTACAATCTTGCCCAATGTATATATTTCCATTTATTGAATGTGGTCTGTATTTCCCATTTTTATGAGGCGATCTCTTCCATTTGATGATTCAGTAGATCTCTCTTTTTGCTGTGTGCTGTTCATAGCTTTGCCATGCAGTTCTTCGCATGCCAGGGCCAGCGAGCTGCACACTCTGTGAGGGAAATCATGCCTGGTGAACCACTGTGGACTGGCGATCAGAAGAGAGGAGTTCTGTGGCTATAGATATCAGGGTGGTGATGTTAGATGGTTGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTTGTTCGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGTTAGATTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTATTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGCTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGCTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGGTGCTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGATTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGCTGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTGAGGTTGTTAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTGGTTGGGGTTGTTAGGTGGGTTGTTAGGGTTGAAAAAGGCTACATCTCTACATGACTAAAATGGATAATGTTAAATTGTCCTCTATGTATTTTTCAAGTAAATCTAATGCCCAAAAAATCCTCCGCAGTTAAGTGCAGTCCAGCTGTAGAGTACTAAGGAAGCCCAGAAGGTTTCCTCTGTGCCCGCTGACCTCTCCTCCAACCTTATATGGCGCTGGCGTTGGGGTCGTACTTTCGCTTCTTCACA
>TU2075704
CAGTCGTTTATTCGTCGGTCCAACTGTACATGATGCAGTGTTGATAGGGACACGAGATGATGACTAACATGGAGTTTTACACAATGCCAGTGCTATGGCAGCACTTGGAACACACCAACTGTCTGTCAGCTGAGCTGGAAACTAAAGTCCTGGAAAAGTAACCTGTTGAGGCTTCGgcacatacagtatgtcagattTGGAATAGTCATTTTTTAGATAGGttgaaaaacacacaaaatatatattttcttcgATTCCACAAATGTAAAAGGATGCTCTTTCGCTTTTCACTTGGACACGTTGATTCAATTATGCACATTGTCATTCTTTATTTCAGTACTTTGAAGCGAAATGAAATGAGATGTGGGAATAGCTGAATACAAAATGTTGGCTGGATTCGCAGAGGTTTTTATTCCATGTTTATACTGATATCATTATTTCATGTAATAACCCCATAAGTTTGTGCAATATCTTTCTTTGCatagaaataaaatgtaaatattttgTTTGTTGACATGCACCTATCTTTAGCAGCATATTTTATCTTGCGGATGTGGGACTCCCTTGTAGAATTATAAGCCCACTATATAGTGTGAATACATGCAGCGTACCAGCAGAGATGAACTTGATTTCTAGTAAGAGTTTATGAGAGCACAAGCCAGCCAGTATAGTGGGTGTTGATGAGGACTGTTAAATAGTGGCACCACCTGATCAGACAGGTGGAACTAGTCTGCAGGGAcacactgtgtgtctgtctgcagcactgtgagagagaggaacagactatGGGGAAAGTGCTCTGTGTGCGACAACATCCAAACATTCCACGTGATTGATTCTTTTGGATTTTGAGTCACTGCTGGAAGTACTTAAGGAACCCGATGACGTCATTGACTGTGTCATGTATCATTATCACTATGCCCTGACCTTTAGAGAAGACACTGTATACCCCTAAATCTGACCTCTAGAGAAGCACCCCTAAATCTGACCTCTGGAGAAGCACCCCTAAATCTGACCTCTGGAGAAGACACCCCTAAATCTGACCTCCGGAGAAGACACCCCTAAATCTGACCTCTGCTCTGTCCCATGTATACTGACCCTGACCCTTGACCTCTATATTGGATAAATACAGTGTGTAACGAGTGATAACTTTGCTGAACACCTAATAGGTAGATCATTACATTCTCTGGTTATCCATAGCATTTTGGACCAAATCATAATTCCGTTACTGTTTTTTTCATTAACATTACCATAAACACCCGCTATACAACATGCTTAAAATAAACCCAAAGCAGAAATGATATGTTATAATTCAGAAGCTGGACCCTTGTTCCTCTTTTATGTACAATCTTGCCCAATGTATATATTTCCATTTATTGAATGTGGTCTGTATTTCCCATTTTTATGAGGCGATCTCTTCCATTTGATGATTCAGTAGATCTCTCTTTTTGCTGTGTGCTGTTCATAGCTTTGCCATGCAGTTCTTCGCATGCCAGGGCCAGCGAGCTGCACACTCTGTGAGGGAAATCATGCCTGGTGAACCACTGTGGACTGGCGATCAGAAGAGAGGAGTTCTGTGGCTATAGATATCAGGGTGGTGATGTTAGATGGTTGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTTGTTCGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGTTAGATTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTATTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGCTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGTTGCTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGATTGTTGGGGTGCTAGGTAGGTGGGTTGTTAGGAAGGTGGgttgttattttttattaaaaaaatgtactttttttcgccccaatttcgtggtatccaattggtagtagttacagtcttgtctcatcgctgcaactcccatacggactcgggagaggcaaaggtcgagagccatgcgtccatccgaaacacaacccaaccaagccgcactgcttcttgacacaacgcacatTCAACCTatatgtgtcggaggaaacaccgtacacctggcgacctggtcaatATGCACTGCgccctgccacaggagtcgctagtgcgcgatgagacaagaatatccctgccggccaaaccctccctaacccggacaacgctgtgcatcgccccatggacctcccggtcgtggccggctgcgacagagcctgggcttgaacccagaatctctggtggcactgtGATGCTAGTTGGGTTGTTAGGTAAGTGTGTGGGGTTGTTAGGAAGGTGGGTGGGGTTGTTAGGTGGTGTGTTTgttaggtgggtgggtggggttgtTAGATGGGATGTTAGGTAGGTGGGTGGGGTTGTTAGGTGGGTTGTTAGGTGGGTGGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTGGGGTTGTTAGGTAGGTGAGTGGGGTTTTAGGTAGGTGAGTGGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTGTGGTTGTTAGGTGAGCGGGGTTGTTAGGTGGGTGGGTGTGGTTGTTAGGTGGGTTGTTCAGTAGGTGGGTGGGACTGTTAGGTGGATTGTTAGGTAGGTTGGTGGGGTTGTTAGCTGGGTTGTTAGGTAGGTGGGTGAGGTTGTTAGGTGGGTTGTTAGGTAGGTGGTTGGGGTTGTTAGGTGGGTTGTTAGGGTTGAAAAAGGCTACATCTCTACATGACTAAAATGGATAATGTTAAATTGTCCTCTATGTATTTTTCAAGTAAATCTAATGCCCAAAAAATCCTCCGCAGTTAAGTGCAGTCCAGCTGTAGAGTACTAAGGAAGCCCAGAAGGTTTCCTCTGTGCCCGCTGACCTCTCCTCCAACCTTATATGGCGCTGGCGTTGGGGTCGTACTTTCGCTTCTTCACA

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2075703 False 2367 lncRNA 0.43 2 44436030 44441556
TU2075704 True 3097 lncRNA 0.45 4 44436030 44441556

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110501914 LOC106582459 coding downstream 48329 44376582 ~ 44387701 (-)
LOC110501913 LOC106582458 coding downstream 67021 44355163 ~ 44369009 (-)
LOC118936581 NA coding downstream 417458 44014413 ~ 44018572 (-)
LOC118943594 LOC106576908 coding downstream 426855 44007225 ~ 44009175 (-)
LOC110502166 LOC106576908 coding downstream 480516 43953651 ~ 43955514 (-)
LOC110502171 LOC106582464 coding upstream 33162 44473683 ~ 44553607 (-)
rbm45 LOC106582466 coding upstream 116575 44558131 ~ 44562475 (-)
LOC110501919 LOC106582468 coding upstream 156798 44598354 ~ 44632193 (-)
LOC110502136 NA coding upstream 193328 44634884 ~ 44636332 (-)
LOC110501923 LOC106582471 coding upstream 218013 44659569 ~ 44664863 (-)
G1814379 NA non-coding downstream 4433 44430612 ~ 44431597 (-)
G1814377 NA non-coding downstream 5512 44429066 ~ 44430518 (-)
G1814365 NA non-coding downstream 26942 44405549 ~ 44409088 (-)
G1814309 NA non-coding downstream 144547 44288753 ~ 44291483 (-)
G1814228 NA non-coding downstream 244647 44156761 ~ 44191383 (-)
G1814384 NA non-coding upstream 1606 44443162 ~ 44443762 (-)
G1814349 NA non-coding upstream 55017 44496573 ~ 44573918 (-)
G1814423 NA non-coding upstream 91874 44533430 ~ 44533695 (-)
G1814437 NA non-coding upstream 97692 44539248 ~ 44541620 (-)
G1812404 NA other downstream 1758270 42677257 ~ 42677760 (-)
LOC110502155 psd12 other downstream 1831010 42603998 ~ 42605768 (-)
G1812079 LOC106582433 other downstream 2046757 42386822 ~ 42389273 (-)
G1811042 NA other downstream 2830799 41604974 ~ 41605231 (-)
LOC110501886 rhg15 other downstream 2970383 41447899 ~ 41523764 (-)
G1814480 NA other upstream 231891 44673447 ~ 44673888 (-)
G1815615 LOC106582489 other upstream 1397194 45838750 ~ 45840982 (-)
G1816841 NA other upstream 2783995 47225551 ~ 47226646 (-)
G1816929 NA other upstream 2959566 47400985 ~ 47402047 (-)

Expression


Co-expression Network