LOC118944042 (LOC106590898)


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944042
gene name LOC106590898
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 39087111 ~ 39091233 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036961567.1
tatttaaccaggtaggctaattgagaacaagttGGCCATTgacaaatcaaatactttattgGAAATGTTTTAAATGAAATCTCAAACCATATTTGGTTCTTTATGTTTTATGTTTCTTGTGAACACTGTAATAGCAAACACATGCAATATTCAGATCATTTTACCGGTTGCAATtattcatttttaaaaacatCTTTAACTGCATTCGTTGTAGTTGAATTTTCACTCTGCACTGATCAAGAAAGGGCTGGCTCACAAAAGCTCTTACTGCTCTCTACGGTATTTTCATCAGAAACACTCCAGTCTCCACCTCCACTGAGGCTTATCAGATTGTCAGAGTACAGAAGGCTGTATAGCAGGTAGGGAGATTTGCATTGTGGCTGGGGAAATGGAGAGAACAGGTGGAGGTGTGGAGAACTCTGGAGCTGACAGCAGCTTGGTCGTCTGGTCTCTACTGACCTTCTGTCTTCTGTCTGGTCCTGCCACAGGTGACCAACATGCCCACTGCTCTGAGTTCCTCTGTCTCAGCCCTCCCTCTCTTCTGGTGAGGCTCCTCAGCTTCTCCTCTGAGCAGGGTCCCTGTGGTTACCCCTTAGATCTCCCTCCTTCAGGCCTCCCATCTGGCCAGGGCCTCCCTCCACTTCCACCAGGCTTCCCAGGACTGGCCCCTGGTCCTGTGGCCTGGAGCCCCCTCAGCCCCACAGTTGTGATTGTCCCGGGCAGGAGGCCAGCCAGGCTGCAGCCCAGCTGGGCGAGGGTGATGGCGGGGGAGCTGTTAGAGGCAGGGCTGGTTAATGTCCTGGTAGCTGATTGGCTGCTGCCCCCAGAGCAGGAGATCACAGAAGGAGCCAGGCAGGTGGGAGAGAGGCTGGCACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGATACACAGACCATACACACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTATACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACCCAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACCCAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACACTACTGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACTCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACACTACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACACTACAGACCCTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCACACAGACCCTACTGGTGGGTAAACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCACACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACCATACAGACACTACTGGTGGGTACACAGACACTACTGGTGGGGAAACTGGCCCAAATTGAACATGAGTAA

Function

NR:

description
PREDICTED: glutamine-rich protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036961567.1 True 3082 mRNA 0.51 4 39087111 39091233

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
spred3 spred3 coding upstream 37435 39020800 ~ 39049676 (+)
psmd8 psmd8 coding upstream 96842 38983607 ~ 38990269 (+)
ehd2b LOC106613377 coding upstream 109367 38943424 ~ 38977744 (+)
bicra LOC106613370 coding upstream 154536 38845482 ~ 38932575 (+)
bckdha bckdha coding upstream 293641 38770840 ~ 38793470 (+)
LOC110503486 LOC106613381 coding downstream 286 39091519 ~ 39096712 (+)
LOC110503192 LOC106613220 coding downstream 115944 39207177 ~ 39235039 (+)
LOC110516717 LOC106581405 coding downstream 146947 39238180 ~ 39350381 (+)
LOC110503405 NA coding downstream 304790 39396023 ~ 39629211 (+)
LOC110503201 NA coding downstream 539430 39630663 ~ 39632379 (+)
G1929453 NA non-coding upstream 3837 39082698 ~ 39083274 (+)
G1929447 dhx34 non-coding upstream 16200 39069510 ~ 39070911 (+)
G1929443 NA non-coding upstream 23630 39062353 ~ 39063481 (+)
G1929438 NA non-coding upstream 35145 39051136 ~ 39051966 (+)
G1929432 NA non-coding upstream 40293 39045419 ~ 39046818 (+)
G1929456 NA non-coding downstream 5652 39096885 ~ 39098231 (+)
G1929462 NA non-coding downstream 15534 39106767 ~ 39107963 (+)
G1929467 NA non-coding downstream 51396 39142629 ~ 39143259 (+)
G1929468 NA non-coding downstream 56392 39147625 ~ 39147875 (+)
G1929493 NA non-coding downstream 111448 39202681 ~ 39202938 (+)
ppp1r13l ppp1r13l other upstream 451719 38590146 ~ 38653011 (+)
G1929196 NA other upstream 574006 38509846 ~ 38513105 (+)
G1929037 NA other upstream 888587 38197898 ~ 38198524 (+)
G1929664 NA other downstream 456579 39547812 ~ 39549780 (+)
G1929808 NA other downstream 783045 39874278 ~ 39877275 (+)
G1929816 NA other downstream 797094 39888327 ~ 39889155 (+)
G1929891 NA other downstream 934702 40025935 ~ 40028517 (+)
G1929901 NA other downstream 958131 40049364 ~ 40082173 (+)

Expression


Co-expression Network