G1929724


Basic Information

Item Value
gene id G1929724
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 39720872 ~ 39723196 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2206981
atgggacacacagatgatatactaggatatgggacacacagatgatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacagaTGATCTAATTGGATATGGGACACAGATGATCTAAttggatatgggacacacagatgagctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacacagatgatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacaaaTATGatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacacagattgtatactaggatatgggacacacagattatatactaggatatgggacacacagatgatctactaggatatgggacacacagatgatatactaggatatgggacacacagatgatgatatactaagatatgggacacacagatgatgatatactaggatatgggacacacagatgatgatatactaggatatgggacacacagatgatctactaggatatgggacacacagatgatatactaggatatgggacacacagatgatatactaggatatgggacacacagatgatgatatactaggatatgggacacacagatgatgatatactaggatatgggacacac
>TU2206982
atgggacacacagatgatatactaggatatgggacacacagatgatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacagaTGATCTAATTGGATATGGGACACAGATGATCTAAttggatatgggacacacagatgagctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacacagatgatctactaggatatgggacacatattatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacagatgatctactaggatatgggacacagatgatatactaggatatgggacacacagattgtatactaggatatgggacacac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2206981 False 656 lncRNA 0.40 3 39720872 39722023
TU2206982 True 385 lncRNA 0.41 4 39720872 39723196

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110503201 NA coding upstream 88493 39630663 ~ 39632379 (+)
LOC110503405 NA coding upstream 91661 39396023 ~ 39629211 (+)
LOC110516717 LOC106581405 coding upstream 370491 39238180 ~ 39350381 (+)
LOC110503192 LOC106613220 coding upstream 485833 39207177 ~ 39235039 (+)
LOC110503486 LOC106613381 coding upstream 624160 39091519 ~ 39096712 (+)
trnat-agu-148 NA coding downstream 41463 39764659 ~ 39764732 (+)
LOC110503199 LOC106613203 coding downstream 77541 39800737 ~ 39809748 (+)
LOC110503406 LOC106581179 coding downstream 720574 40443770 ~ 40535727 (+)
LOC110503211 LOC106613213 coding downstream 1086982 40810178 ~ 40837501 (+)
LOC110503202 LOC106613212 coding downstream 1239246 40962442 ~ 40972379 (+)
G1929710 NA non-coding upstream 41308 39679289 ~ 39679564 (+)
G1929706 NA non-coding upstream 50280 39669607 ~ 39670592 (+)
G1929705 NA non-coding upstream 51702 39666138 ~ 39669170 (+)
G1929698 NA non-coding upstream 83538 39636766 ~ 39637334 (+)
G1929697 NA non-coding upstream 86108 39634547 ~ 39634764 (+)
G1929726 NA non-coding downstream 62 39723258 ~ 39725950 (+)
G1929727 NA non-coding downstream 4435 39727631 ~ 39727961 (+)
G1929753 NA non-coding downstream 55948 39779144 ~ 39779519 (+)
G1929758 NA non-coding downstream 88994 39812190 ~ 39814400 (+)
G1929809 NA non-coding downstream 149995 39873191 ~ 39925528 (+)
G1929664 NA other upstream 171092 39547812 ~ 39549780 (+)
spred3 spred3 other upstream 672179 39020800 ~ 39049676 (+)
bicra LOC106613370 other upstream 788323 38845482 ~ 38932575 (+)
ppp1r13l ppp1r13l other upstream 1085480 38590146 ~ 38653011 (+)
G1929196 NA other upstream 1207767 38509846 ~ 38513105 (+)
G1929808 NA other downstream 151082 39874278 ~ 39877275 (+)
G1929816 NA other downstream 165131 39888327 ~ 39889155 (+)
G1929891 NA other downstream 302739 40025935 ~ 40028517 (+)
G1929901 NA other downstream 326168 40049364 ~ 40082173 (+)
G1929909 NA other downstream 353280 40076476 ~ 40078332 (+)

Expression


Co-expression Network