G1934215


Basic Information

Item Value
gene id G1934215
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 43453672 ~ 43457714 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2212680
ggatttattgtgacggtgtaggtagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagggagactatattacatggatttattgtgatggtgtagactattacatggatttattgtgacggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgacggtgtagggagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtgaaggtgtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgacggtgtagactattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattttgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacttGGATTTATTGTGGtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgaaggtgtagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtggcggtgtagactatattacatggatttattgtggcggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgacggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattgcaTGGATTTATTGttatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtt
>TU2212682
ggatttattgtgacggtgtaggtagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagggagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgacggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtagactattacatggatttattgtggcggtgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggtagactatattacatggatttattgtggcggtgtagactatattacatggatttattgtggtgatgtaggtagactatattacatggatttattgtgatggtgtaggt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2212680 False 913 lncRNA 0.33 3 43453672 43457714
TU2212682 True 566 lncRNA 0.34 3 43453672 43454794

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
bcl9l LOC106613392 coding upstream 33197 43299528 ~ 43420475 (+)
cdon LOC106613390 coding upstream 240960 43066287 ~ 43212712 (+)
prdm10 prdm10 coding upstream 668512 42723531 ~ 42785160 (+)
LOC110503413 LOC106613251 coding upstream 1118202 42140069 ~ 42335470 (+)
LOC110512028 neus coding upstream 1374942 42023482 ~ 42078730 (+)
treh treh coding downstream 15010 43472724 ~ 43491902 (+)
G1934210 NA non-coding upstream 8567 43443281 ~ 43445105 (+)
G1934203 NA non-coding upstream 23153 43423780 ~ 43430519 (+)
G1934192 NA non-coding upstream 44362 43409043 ~ 43409310 (+)
G1934152 NA non-coding upstream 129699 43323347 ~ 43323973 (+)
G1934142 NA non-coding upstream 146996 43305996 ~ 43306676 (+)
G1934195 NA non-coding downstream 11809 43469523 ~ 43471503 (+)
G1934242 NA non-coding downstream 118961 43576675 ~ 43579791 (+)
G1934245 NA non-coding downstream 129027 43586741 ~ 43587197 (+)
G1934400 NA non-coding downstream 157314 43615028 ~ 43615230 (+)
G1934407 NA non-coding downstream 182495 43640209 ~ 43642077 (+)
G1934201 NA other upstream 18320 43433448 ~ 43435352 (+)
G1933999 NA other upstream 295106 43158103 ~ 43158566 (+)
G1933574 NA other upstream 918689 42531718 ~ 42534983 (+)
G1933563 st14 other upstream 952682 42495580 ~ 42500990 (+)
G1933255 NA other upstream 1063411 42389427 ~ 42390261 (+)
G1935694 NA other downstream 1642588 45100302 ~ 45103958 (+)
G1935696 NA other downstream 1646418 45104132 ~ 45104500 (+)
G1935897 NA other downstream 1830796 45288510 ~ 45289135 (+)
G1936028 NA other downstream 2027629 45485343 ~ 45492999 (+)
G1936029 NA other downstream 2028022 45485736 ~ 45487871 (+)

Expression


Co-expression Network