G125480


Basic Information

Item Value
gene id G125480
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053123.1
NCBI id CM020920.1
chromosome length 39440604
location 19930932 ~ 19937248 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU168789
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>TU168790
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Function

NR:

description
PREDICTED: ras GTPase-activating protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU168789 True 4068 lncRNA 0.39 3 19930932 19936281
TU168790 False 3635 lncRNA 0.39 2 19930932 19937248

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-214p13.8 NA coding upstream 1986 19924998 ~ 19928946 (+)
si:ch211-214p13.9 NA coding upstream 10512 19916092 ~ 19920420 (+)
gsk3ba gsk3b coding upstream 33644 19853302 ~ 19897288 (+)
gpr156 gpr156,LOC103373478 coding upstream 79957 19839064 ~ 19850975 (+)
LOC120569649 LOC104952805 coding upstream 85990 19842231 ~ 19844942 (+)
si:ch73-390b10.2 LOC102224404,LOC103392127,LOC106959393,LOC103369897,LOC103459619,LOC107099852,LOC100701210 coding downstream 7620 19944868 ~ 19953198 (+)
abhd13 abhd13 coding downstream 200056 20137304 ~ 20142499 (+)
tnfsf13b NA coding downstream 207835 20145083 ~ 20149050 (+)
col4a2 col4a2,LOC107557913 coding downstream 452270 20389518 ~ 20471524 (+)
naxd naxd,LOC102782328 coding downstream 541463 20478711 ~ 20485061 (+)
G125465 NA non-coding upstream 23110 19907587 ~ 19907822 (+)
G125397 NA non-coding upstream 31495 19899234 ~ 19899437 (+)
G125369 NA non-coding upstream 116664 19748066 ~ 19814268 (+)
LOC120570225 NA non-coding upstream 128974 19792009 ~ 19801958 (+)
G125267 NA non-coding upstream 344277 19491538 ~ 19586655 (+)
G125482 NA non-coding downstream 4982 19942230 ~ 19942847 (+)
G125501 NA non-coding downstream 78773 20016021 ~ 20016254 (+)
G125504 NA non-coding downstream 87015 20024263 ~ 20027981 (+)
G125547 NA non-coding downstream 291480 20228728 ~ 20269128 (+)
G125577 NA non-coding downstream 393139 20330387 ~ 20330659 (+)
igsf3 LOC103352919,LOC104967650 other upstream 471658 19388015 ~ 19459274 (+)
tmsb4x NA other upstream 840147 19089418 ~ 19090785 (+)
LOC120570507 NA other upstream 1103385 18818753 ~ 18827547 (+)
G125079 NA other upstream 1226404 18703028 ~ 18704528 (+)
hnrnpa3 hnrnpa3 other upstream 1913519 18010757 ~ 18017413 (+)
LOC120569357 LOC103369896,LOC102289365,LOC102197623,LOC101484406 other downstream 31112 19968360 ~ 19993324 (+)
myo16 myo16,LOC103372229 other downstream 216607 20153855 ~ 20265590 (+)
G125627 LOC108259060,LOC105016494,LOC108266561,LOC104955100 other downstream 554930 20492178 ~ 20521274 (+)
mpc2b mpc2 other downstream 915841 20853089 ~ 20858916 (+)
G125757 rpl24 other downstream 922904 20860152 ~ 20865442 (+)

Expression


Co-expression Network