LOC120569357 (LOC103369896,LOC102289365,LOC102197623,LOC101484406)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120569357
gene name LOC103369896,LOC102289365,LOC102197623,LOC101484406
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053123.1
NCBI id CM020920.1
chromosome length 39440604
location 19968360 ~ 19993324 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU168804
TTGCTATGTGATGTTCTGTGAAGCAAAGAGCTGATCTTGTGTTTTAGTGATCTGTAGTAGTGTTACATATTTCTAAGCAGCTTGTTCAGGCTGCAGGCTCATATGGGATGGACAGGGATGAAGGGTTAGAGAAGCATACAAGGGCACATTTAGATCTACTCGAACGGTCACAATGGCCAGGCCACCATTGCCTTAAGTGTGTTTTGAGTGTACAgtatctgtatgtctgtgtatgtgtgtgtatacatgagTCACTGTTGTTTCACGCAAAACGAGAGCTGGAGATGAAAGCATTTGGCGGCCTTGTTTACCCATCCATAGAAAAGACGTATACAGAGTTTATGCTTTGACTATTGtcctttctgaaacggaaacgAAAAAATTGCTGATGTGGTTTTCTTGGCTGCTGTCCACGCTGTTATCTTGACAAGTGTGTTTGTGCTGCTATGACGCTATAAGGCCTTTAGTGGTTACTTGTGGTTTGGAATGTGTAGTAGTCCGTTCTGGTTTATGCTCAAGATGGAGGAGGTGCAACAGGTCTACCTCCCTTATGACAGCGCAGATTTATTGCTATTATGGTTGTCATTACAGACACTATTTGTTGTTTCTGACTTGGCAGACAGAAGGGATTTGCTATCTCCCTGCATGAGGATCATCTGGATAGCATTTGTGTATTTAAGTAtgaaaagtgtgtgtctgtgagtgtgtcagaCAAGGAGCCAGGATCATAAAGTAGACGCCGATTCTGTGCCATTTGTTACATGTGATCTTTGAGATTTGATTCTGGCTGCTGT
>XM_039817229.1
TCTCAGCTCCATGCGGTTTACTTGGCAAAGGCGCAGCATTGCGCCGcgctccttctctctcctgctgCGCACCGATCCATAATTAACGCGTGTAATGCCAAGTGAGACACATCTACAGCAAAGGTGGAAAAATAAACGAAAAAGAAGTAAACgacagttttttgtttgttctagaGGTTGGAAAGCGACAATTTGCCTCGGTCTCAAGTGTGATGGACTATGGATTGCCGAGTGTAGGGGTTTTACTACTTTAGAGGCTCAGACGAAAATTGACGAAACGTCTAAGTCGAACTTTGTGTAACCTTAGAGACaacattaaatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatggatctCTATGCACGAAATGAGACATTTACATCCCCTGAGTGCGTCGGATCGCAGACTGATGCAGTGCAGAACGGAGCCGGTAACGGGAGCGAGACATCAAACATCACCTGCGGCAACGTTTCCACACTGTTCATACCTCAGCTTGTGAGGTACAAAGATGACGACCACACACTGCGGATCCTTCTCTACTCACTCATCTTCTTCCTGAGCGTGTTTGGAAACCTGCTAATCATTGTGGTGCTGACGGTCAATAAGCGCATGCGCACTGTGACCAACACCTTCCTGCTGTCGCTCGCCATCAGTGACCTGATGATGGCTGTCTTCTGCATGCCCTTCACACTCATCCCCAGCATCCTCAAGGACTTCATCTTTGGAGCCGCCATGTGCAAGATTGTGTCCTACTTCATGGGAATATCAGTGAGCATCTCCACATTTAGCCTGGTTGCCATAGCGATAGAGCGCTACAGTGCCATCTGTAACCCCCTGAAGTCACGGGTGTGGCAGACCCGTTCCCATGCCTATCGGGTGATTGCTGCTACGTGGGTGCTAGCCTTCGTCATCATGATCCCCTATCCAATTATCAGTCACTTGGAGTCTTTTCCGCGTCCTGACAACACCACTGCTCACCAGTGTCGCCACATGTGGCCCCTCGCAACAGCAGAACAGGCCTGGTACATTCTGCTTCTGCTCGTGCTGTTTGCAGTCCCAGGGTTGGTGATGATTGCGGCCTATGGACTCATCTCCAGGGAACTTTATAGAGGCATCCAGTTTGAGATGGGCCACAAAAAAGACTCTACCGATGTGAAGAATGGACTGACCTCCACTGTGTCTACTGGCAGTGATGATGGCGATGGTTGCTATGTTAATGTTGTCCAGCGGCCGCACTCAATGGAGATGACCAACGTGGCTGCATCCAGCAGGGCAATCAAGGCGGAAAGACCACGCAGCAACACATCTGAGGCCAAGCTGGAGGCCAAGAAGCGAGTCATCCGCATGCTGGTGGTCATTGTTGTCCTATTCTTTCTCTGCTGGATGCCACTGTATTGTGCCAACACCTGGCGGGCTTTTGACGACCTCTCTGCCAAACACGCCCTCTCAGGGGCACCCATCGCTTTCATCCATTTGTTGTGCTACACCTCTGCCTGCGTCAACCCGATTATTTACTGCTTCATGAACACACGTTTTCGCAAAGCTCTGCTAGCCACCTTCTCGTGCTGTGCTGCACCTTGCCATCATCGCCGCCATCGTGGGCTACGGGACAACGAAGAGGATGTAATGGCAACAGGAGCGTCCATGTCCAAGTTCAGTTACACTACAGTCAGCACCATGGGAACCTGCTAAGGCAGATGGATGCAGGCACAGTCCAGAAGAGACAGTTACTACGGCAACACAGCACCCCACATCCTTTGTTTTTAGGCCAATTCTATACTCATAGTGACAATAATGTGGAGTGGAAAAAACAGGCCATAGATTGTAGCAGAATAGAAGCTTCACCCTGTGCGTAAAGTTATGTAGAGATCATTTAATGAAACACAGTCTTACAGTGTAAATACCTCCataacattattgaaaaaagcaaGTACATTTATCGCTTGTCACAGTGGACCAAGGCATATTGTTTGCTTCGATGTTTACGGCGGggcaggtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtggtggGCTGTATGATATGTGAGGGATgaattttaataatttagtaGTCATTATGTAGCTATAAAAATAGGAAGACCGCAATCTGTTAATCTGTGTTAATGACGCTAATTGCAATTGCCTTGTGGACTAAGTGCCTGGTTCTACATACTATGTTATGTTTGTCAACTGTTGATTTGTCTCATTCATAACAGGCACCATAAACACAGACAAATTGTAAACTGAAGGGTTGTGAAAGTGGAGTTTAAAGACTCAACAAACTGAAAATCCTCAGAAGATAGGAATGTCCTATAGAAGATAGGAGTAGGTTGTGAGTTCTACATGGCTCCACGGTTCACAGAAAACCCGTAAGTGGTATAAACAGTTTAGACGGGAAGTGGTGATGCCTTGTGTTGTGGTTGTAAATTGTAATGCAAGCTGCGTTTGTGTTTTTGAGCTTTTAGACACAGAATTGTCTGTATGTTGTAAACATTGTATACTGcaatgtttgtttgtattttgtccTTGCAGGTGAACACAGTAGCAAATGTGAGAAGGGTGAATTGACactttgtattgtgtttttttctcatattaGGGCTCTAGTTTGAGGGCATTACAAAATTGGTGGATAAGTATCCATCACTTTGTGGAGAACATCTGGATAGGAATCAGGGTTATTTAAGAGACTATTTAACAGTTTCTACATTATTATATTTCTGATACCATATTAGAACACAGGAGAAACTATATAATGAACTTTGATGAAAACATCAGGAGTATACAAATAGTAAATGCTACTAATATGTTATATGTGTTacaatatatttactgtatggcAGCATGAAagggtgattttttttatgaacaatAAGTCCACTGCAGCCTTACAGTAAAGGAGGTAAACCAAGGATAAATtaactataatatatacacatttatgAGTTCAGTGATTAAGTGACTTGCAGTCCCTGTTGAGCTCACCTGCAGGCTACAACATGGCAGCCAGGTTTCAGAGGTCTCTGTTTGTCAGGCCCTGTCAAGCGTGCCTGACTCTGGCTCCCCCGTTCACCTCGCACTAATTGTGTTACAACCTCAACCCTGCCAGGTTGAACGCCTGAGCATATTTCACTGAGTGCACCAAAGCACAATGCTGTCAGCCTCTCATCTAATAGATGTATGGCCTGCCTTTGTGAGCATTTTTTGGAAGATTGGCCTGCAGCTTTAGCAGTTTATCGTGTACACCGTTCCCTTTGTGTTTAAAATATGAATCTAGTGAAGCATTTCTGTGAGACTAAactacagaaagaaagagaatatTTCTCTACACTGACTAAGACAACCTTACCTTCACGTGTGTCCAGTTAATGTCAAGAAGAGGTCAAATTGACTGCTAGAACATTACCTTGACCTTCCCCTTGTCTCACTGTACAGACTCAGGCCCCATCAACTTTGAAACACATTCATCAAGCTGATGACATTCGTCTATGGCCTTGATGGCCCTGTGCTGATTACCGCAGGGGCATCAGGCCTCTGTATGTATGGCTGTGATCTTATACAATGAAGTCAAAGTGATATCATAGTAGATAAAGTGTGTTCTCAAATGAAAATGCCCATCTGatctaaaaaaagaagaaaatcctGTTGAAACCTTGGAAAAGCAGTAAACAGTAGACAGGAGGTATTTACGTGTCTGCTAGTAgcatttccaagatagaaaaaTACTGTAACgccaccgtctgtgttgttgtttatgtgACACTTGGaaagtgttttgttttcatgtaGAGGCTGAATTCCCTGCAGTGTCATAGAGGACGTTATGATTTGTTCCCCAATCCACCCCACCTCATCCAGTCgccacaagtacacacacacttaatctGGTTATGATGCACTTGCTCACAACTAATTACAGGCAGATGCCAATAAATAGTTATTTCCTTCTTTTACAAAATTAATACTGGCCatgaaaattaaagctcagtaTGAAAGTAACTGTGATGACAAATATGCAGTGGGTAGAGATTAGATCTCTAATTAGCATATTTCACTTATgcataagtaaaagtaaatatgCGAATAAGTACTAAAGGTTACTGTAAATGCAGTCCTGTAAATGCAGTCCTTCAGTCCTCTGTTTAACAATGTTGGTGATCTTATTTTCAAGCTTCTTATTATTTGTAGCATGTATTCTTCAATCAGAAATGGTAATGGTAAATCTATCCTGCACAATATCTACAGACAGGTGTTGCCCACAGgctaaagctgcactaattaacatgttttatataACCAACAGATCAAACTCCGATGTGTAATGTAAAAGGGGTCGGACATAatgatgaacacacacataattGCCACCCATCATTGCAGTTCCCCCTGGCTTCACAGTGTTTTTGCCTATTTTGgatcttttttgtttgtttttccagcccaTAACTCTGTTCTCATCAATCAGCCACAGCAATCAGCTGTTTTGAGAGGAGAACCTGCTCTAAGACCCAGAtttttccctcaggagttggtgaagaccaaaacagagctaaagtgaatattggacttaaatACATTGGGTGACCACAAACATAACTCCAAGTGTTTCTGCTTTATGTGTAAATCGACAGGTTGTTAACATGTTAGCCATAATAACTTTATAAGGTGGTactatgtcagtgttgtgtttcaaGCTTGTTCCGCTGCCCCCAAGAGGTCAAAACATAAATTACTGAAGATTTAGGGTTAGGGATGAAATATGAGCTGAGAATATCAATCTTGCAGAAGTTTAAATGAGGTAAATGATAAGTTCAGGTAAGAGTACAGATATGCCAATTTAAATGTCTCCTATTATCATGAATACTATTGAGTGTTAATATACAACAAGAGGGGTACACCTGTTCACTGATTACTATCAGGGATCcttttcacattcacacaagTAATCAATCATGTTCAGTCAAGACAATGAGGTGCCCTTTATAA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Function

NR:

description
PREDICTED: cholecystokinin receptor-like

GO: NA

KEGG:

id description
K04194 CCKAR; cholecystokinin A receptor

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU168804 False 794 lncRNA 0.43 1 19992364 19993157
XM_039817229.1 True 7206 mRNA 0.42 5 19968360 19993324

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch73-390b10.2 LOC102224404,LOC103392127,LOC106959393,LOC103369897,LOC103459619,LOC107099852,LOC100701210 coding upstream 15162 19944868 ~ 19953198 (+)
si:ch211-214p13.8 NA coding upstream 39414 19924998 ~ 19928946 (+)
si:ch211-214p13.9 NA coding upstream 47940 19916092 ~ 19920420 (+)
gsk3ba gsk3b coding upstream 71072 19853302 ~ 19897288 (+)
gpr156 gpr156,LOC103373478 coding upstream 117385 19839064 ~ 19850975 (+)
abhd13 abhd13 coding downstream 143980 20137304 ~ 20142499 (+)
tnfsf13b NA coding downstream 151759 20145083 ~ 20149050 (+)
col4a2 col4a2,LOC107557913 coding downstream 396194 20389518 ~ 20471524 (+)
naxd naxd,LOC102782328 coding downstream 485387 20478711 ~ 20485061 (+)
ing1 ing1 coding downstream 491902 20485226 ~ 20490509 (+)
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G125369 NA non-coding upstream 154092 19748066 ~ 19814268 (+)
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G125504 NA non-coding downstream 30939 20024263 ~ 20027981 (+)
G125547 NA non-coding downstream 235404 20228728 ~ 20269128 (+)
G125577 NA non-coding downstream 337063 20330387 ~ 20330659 (+)
G125626 NA non-coding downstream 498337 20491661 ~ 20492159 (+)
igsf3 LOC103352919,LOC104967650 other upstream 509086 19388015 ~ 19459274 (+)
tmsb4x NA other upstream 877575 19089418 ~ 19090785 (+)
LOC120570507 NA other upstream 1140813 18818753 ~ 18827547 (+)
G125079 NA other upstream 1263832 18703028 ~ 18704528 (+)
hnrnpa3 hnrnpa3 other upstream 1950947 18010757 ~ 18017413 (+)
myo16 myo16,LOC103372229 other downstream 160531 20153855 ~ 20265590 (+)
G125627 LOC108259060,LOC105016494,LOC108266561,LOC104955100 other downstream 498854 20492178 ~ 20521274 (+)
mpc2b mpc2 other downstream 859765 20853089 ~ 20858916 (+)
G125757 rpl24 other downstream 866828 20860152 ~ 20865442 (+)
sox1a LOC103372296,LOC101481640,LOC100691128 other downstream 1626024 21619348 ~ 21634757 (+)

Expression


Co-expression Network