G46156


Basic Information

Item Value
gene id G46156
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 920244 ~ 961803 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU61776
TTCATTTAAAGGAATGCTTTATTGATATCCAAACATATACAACAaaaccaaatttttttttttttattaattcaccATAGTCTTCCAAATTGGATCCCTTTTGATACTCTACATGAGCTAGGCCCAGGGCCTAAATAAAGCTACGAGTACTCTGTCCTCTGCAGCAGCTGGCACCCAAAACAACAGTACATTATCATATCATATCCATCCATCAGTCCCCCAAAACGGACTGCAGCTTTAAACAGGCGACCgctacactgcaaaaaaaaaaagtccatctTAATAAGTCATTTAATTCAGTATTCAAAATTGTATTCTTCTCATACAGAGTGAGATAATTGCCCTACAAAAAGCATGTAAGTATGAGGGAGTGTATCCACtttgtgtaagaaaaaaaaatcagattttaGGATTGTAGAGTAAATGAGTTGAGAATAATATTTCTTGTAGTGTGGTGAAGCAGAAAGCCAGAGACTTTGTGAGATTCAGAGACAGTATGAGAGTGAGCATTTTGTAACAGATATTGCAATATTGgcaacttattttttaaactgatgGCAAATTATTTGTACAAATAAATCCTCTAAAAAAAAGTCCACCTC
>TU61777
TTCATTTAAAGGAATGCTTTATTGATATCCAAACATATACAACAaaaccaaatttttttttttttattaattcaccATAGTCTTCCAAATTGGATCCCTTTTGATACTCTACATGAGCTAGGCCCAGGGCCTAAATAAAGCTACGAGTACTCTGTCCTCTGCAGCAGCTGGCACCCAAAACAACAGTACATTATCATATCATATCCATCCATCAGTCCCCCAAAACGGACTGCAGCTTTAAACAGGCGACCgctacactgcaaaaaaaaaaagtccatctTAATAAGTCATTTAATTCAGTATTCAAAATTGTATTCTTCTCATACAGAGTGAGATAATTGCCCTACAAAAAGCATGTAAGTATGAGGGAGTGTATCCACtttgtgtaagaaaaaaaaatcagattttaGGATTGTAGAGTAAATGAGTTGAGAATAATATTTCTTGTAGTGTGGTGAAGCAGAAAGCCAGAGACTTTGTGAGATTCAGAGACAGTATGAGAGTGAGCATTTTGTAACAGATATTGCAATATTGgcaacttattttttaaactgatgGCAAATTATTTGTACAAATAAATCCTCTAAAAAAAGTCCACCTCTTCTTGCAGAAGGAAAcccaaagaaaacaacaaattcACCTAACAGGAATATATTAAATACCAAAATGATCAACacgacaacacaaagaaaaaaaacaagaaaatgcaCGTCCGATACCCTGGCAGCAGTTTGGAAGCCGGGATGTTGTTTCCAAGCGCTGCGTATCGGTCATTTCATGTTTGTTCACTAAAGGCCCAGCTCCGTCACCTAGAGCTCCTTCTCATTTATTGTACTCCTGCTCTTTGTTTTGGTCTAGTCTGTCGGGAGGTTTGGGCTTAGATTGGCAAATGATTCTGAAAATATTTAAGGTATACAAGAACTCTTTGATGATGATTTTGCGACATTGCGCTGACGCTGAGCCAGGAAACAAGAGCAACGCGTTGTAGCTGCAATAGAAAAGATTTTTGGCAACATTAATACACCTTCAGTGCCTTGACAAAATCGACTATGATCAGCCTCAACAAACAGTTCAAGACTGACCCAACGTTTTTGGCAATTGGTCAAAGAGTTGccctgtatatttgtttttctctggGAAATTTTGCAGTTAAATTGGGGAGAAAAGTGACGTTAACGGTCACCGTTTGTAAGAGCGTCGGTTTTTATCAGTACAAGCTCACAACAGTAAGAGCTACAGTGAtttggtacaaaaaaaaaaaagggggttagTTTGGCCTcgtgcagtgcatgtgtgtgtgtgctatcaGCACATTTAGTAGCATGTGTGTATGCAGCAAGGGGTTGTTGGCAacgggttttttttgtgttattttaatgGCAACAAGAGGTTTTCCATGACGCATTTGTGGCCCGTCGGACTATCACAATCTGAATATCTCAATGCTATCTCCTCTTTGATCAAACCAGTCTATACAACTTAAAAGAAAaggaacaaagaaaaaaaaacagccatggtgtttggtgttttaagcgcCCCCccccttccaggcagcgcggcaatTGTTATATTCAAGGTTAAGGTGAGgtttagctgcctggaaggagacgttggaggcttaaaacgcCATATCGAGCAACAGCCACTGCTTTTCTGCCAGCTAAATTCCAATAGGTGAAGCATTTAAGGTGATTAAGGCCGATAGAGAAGGCGTGGACATTCACCGGGGTAGTGTACAAAGCAGCGCGTCGTCTAACGCTGACTCCTGTGTGCTAACGGGAAGGGAACACCAGTCGAACCGGGGTGAAAAAGAAGCATGGTCAAAGTGGTCTCGACACGTATTCAACCCTCAGGAGAGGGGTTTAGTTTGACATGCTGCAGCAGCACATCGGAGATCCAGTCTGTTAAATGAAACCAGTTTGATTCGGTTCCTTCTTGTCCAAAACAAAAACGACCGCGGCTCCTTAACGAGTCAGGttcacaaacattttaaaaggtcccatggcatgaaaatgtcactttgaggtttttttaacattactatgcgttcccccagcctgcctatggccccccagtggctagaagcggtgataggtgtaaactgagccctgggtatcctgctctgcctttgagaaaatgaaagctcaggaatcttccctttatgacatcataaggggaaatgttacctcccctttctctgctttgcccgcccagagaatttggtccacccatgagagagagacatcatggcatgaaaacaagtgaatcatggcaagctggtcaaggccacaccccaccctccaccttgccccccccccgcctcaatatataaaagcatccaaaaagcagcatgtcatgggacctttaatatattttagaaCACAGATGTACTTTCGACTGATAATCTCCTGACAGAAAGGAAGTCGTGTCTGTGAAACTGACCCATAGTTTCTTCTGAAGTTTGTTTAGCCTCGCCCCTCTTTctcttaaccccccccccacaaccgATTACTACCGTTTGGCAGCATCAGTGACTAGATTTATTAGATttcataatatatatttatacatattgATAAAAGTTATGTAAAAACATTATGCAAAGCAGTGTAAAATAGTTTGTAATACAAAATGGTTTGAgggttgttttattttctccGTTTTTACATCCTGGGGGTGTTTTTAGGGCGTTACGCGAGACCTCGGTCTTCTTTGCATGGTTGCTATGGTACAACTGAGATGAGATATGCACATGCATGTAGCAGTAGAAGGTCTAAGAGGGGTGAGATGTGCTAGACCCCTCCCCCAGTCAAACCACTAAGCTCTAACCTGCAGGTGTAGCCTGCGTTCACACGGCGGGCATCCGCAGAGCTGTCAAGAGAACTCTGAAGAGAAGTTTGAGGGGGAAAAACCTGGGGATACGGTGGTGACACTAGTATGTGGTCACAGTGCGAATGCGACAGCAGTCAGAAAACAAGAAGCCAGAAACAGTAGTAGTTATAGACCACCATCTTGCTTATGCCCGTCAAATGCTCCTCCGCCCTCGGTCTGCAGAGATCCTGGTTCCTAAACTCGGGAGTTGGGGCCCAAAAAAATGCACCTGCAGAGTTACCTTTTGATGCGTCACTGCAGGGCTTATCCTAACAAACACCCAATCCCACAATTAAATGTGAAAATTCTCATTTAGACTTCTTAATCATGCCTTGTAGCCTTCTCTTTAGCCAGGCGACTGGCTGAAAACAGCAGCTCCCTGCTTAAAGAAAGGCCTGTGAAGAGGGCAGGAGACGACCCTCGACTCATTTGGACTAACGACGACGTCTAACggggggggggctgtaaatTATTCAGGTTTAGACATCAACAAAACATGTTTCCTTTTTCCTGGACAGCGAGGCAGAGGAGTGGAGGCCGTGGGACCAGCAGCGACCCCAAACCCACCAGTCCTTCACCCCCCATCTGCTTCTACAGACCTCGGGGCAACTGAGTGGTGGCGAGTCAGTGAGGTGATAACAGTACAGTCTCAGGTCGTGAGGAAGGTGgcggtgaggaggaggaggaagaggtgggggggggggggatgcgtTCAGAAAGGTGGGTTCTCCTGAGTGGGGGTGGTGTCAGTGGGGGAGGTGACGGCCTCTCCGTTCCCTTTGGGGCCCACGACCTTGTACTGAGGAGAGGAcacgatagatagatagatagatagagagatagagagatagagagatagagagagagagagagagagagagatagagagagagagagagagagaggctttaACACAGACTCATCACAGTTTAGGTTTCCTGCATTTAAAAACCATCAGCGTGTACCATAATCATTAATACATGCCCTAATAAACCTACGCTAAAACAGTACACTATGATGATTAGCATGTAGCATCAGCTGTGTAGAGTTAGTATGTAGTATGGATGTGGGCTGCACCTCTTGTGAAATGATATAAATAGTCAAACAAAAAGGTGTACATGTTATTGGGGATGGAACCAGGGCTAGCCACTGTGGCTAGTGGGTTTCCAAAAGCTACTAGCCCACTCGGCATTTTCACTAGCCAcgattacattttatttgaatgAAGTGGACTACAGTGTGCTACAATTAACTTCATTCTGTtctgacctttttaagaccattatgaattaTATTTTAGACCTATTtcgcgaaaaaaaaaaagaagtaattgTCTGAAACAATTCCCTGATTTCCTCGTTGGCATTATAGGACCGGTGTCTCGATTTGGCTGCTAAATAAACTGCACATTGGTATCATTTGTAGTCCTAATACAGCACAGAATTAAAAACAACCATTTTAAAGCACTGTGGGAACATTTCaaagagcattagaggtagcgttacatTGACATAGAACAATTAAGACCTGTTGAACATTAtgtaagacctagaacacaataagTCAGCGAATTTAAGACTATGGGGGATATTTTGTGGGTTCGTGGGCGGGCgctaatgtcaagccctggACGGAACAATACATGATCTGGATCGAGTCAGTGATCAACGATCCAACATCATTGATGCAAAGTGACAATACAATAcaggatatctttaagaaaagaaatgtaataatacatttaagaaataaaattgtcaaatcatattttagttgcttttcgTGAGTTGGTATATATGGAACTGATTGTGATAAATAAGCATTGATATTGTCTTAGATAATTgtggcagactttgtgatatcagCAAATATCACATCGTTGTCCAAAGTATTGCTATATCAAATCTTGACAAAACTTATGATTTGCATGCCTACATGTTATTCTATAGCCCTTTAGATTTGTACATGTGGTCTTAGGTGTCCTATGGTTATCTTATAAAGGGTTAAAGTCAACTTGGTAATAATCTGACATTAAATGCTACttgtagttcatttaaaaatgattatAGAATAAAATCCTCTTTCAATAAACATGGAAAGAAGGAAACCTTTAACTCAACAATCAAACA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU61776 False 602 lncRNA 0.35 2 920244 961803
TU61777 True 7293 lncRNA 0.41 2 920244 927594

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptk6b NA coding upstream 72622 825255 ~ 847622 (+)
zgc:194282 srms,LOC103385165 coding upstream 99064 782791 ~ 821180 (+)
LOC120558328 nol4l,LOC103385166,LOC103361530 coding upstream 149188 558217 ~ 771056 (+)
commd7 commd7,LOC102794680 coding upstream 434349 476464 ~ 485895 (+)
vps13d vps13d coding upstream 710507 74750 ~ 209737 (+)
trim101 NA coding downstream 22366 984169 ~ 1010837 (+)
LOC120558589 LOC103356004 coding downstream 53585 1015388 ~ 1045239 (+)
adrm1 NA coding downstream 87169 1048972 ~ 1053010 (+)
LOC120558473 LOC103372586 coding downstream 606492 1568295 ~ 1608445 (+)
LOC120559387 NA coding downstream 1451768 2413571 ~ 2420858 (+)
G46154 NA non-coding upstream 1910 918092 ~ 918334 (+)
G46134 LOC104947167 non-coding upstream 13116 903558 ~ 907128 (+)
G46133 NA non-coding upstream 16774 902816 ~ 903470 (+)
G46132 NA non-coding upstream 17566 902439 ~ 902678 (+)
G46078 NA non-coding upstream 49005 862191 ~ 871239 (+)
G46160 NA non-coding downstream 33571 995374 ~ 1054320 (+)
G46227 NA non-coding downstream 237207 1199010 ~ 1199211 (+)
G46249 NA non-coding downstream 354797 1316600 ~ 1317598 (+)
G46252 NA non-coding downstream 372673 1334476 ~ 1334791 (+)
LOC120558411 NA non-coding downstream 389927 1351730 ~ 1352130 (+)
G46066 ppdpf,LOC106937393,LOC103148182,LOC103356003 other upstream 19948 793902 ~ 900296 (+)
LOC120559832 rps21 other downstream 274512 1236315 ~ 1247771 (+)
G46238 NA other downstream 315485 1277288 ~ 1284379 (+)
G46305 NA other downstream 560882 1522685 ~ 1523231 (+)
G46328 NA other downstream 674145 1635948 ~ 1638170 (+)
LOC120559409 NA other downstream 1243538 2205341 ~ 2232659 (+)

Expression


Co-expression Network