LOC120559404


Basic Information

Item Value
gene id LOC120559404
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 3448104 ~ 3514758 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU62501
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>TU62506
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>XM_039801101.1
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>XM_039801102.1
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>XM_039801103.1
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>XR_005639245.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU62501 False 1571 lncRNA 0.43 4 3503887 3513570
TU62506 False 1307 lncRNA 0.35 2 3448104 3514758
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XM_039801101.1 False 1498 mRNA 0.43 3 3503855 3513600
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XM_039801104.1 False 1399 mRNA 0.44 3 3500322 3513600
XR_005639245.1 False 352 transcript 0.48 3 3505308 3512484

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120559389 NA coding upstream 262924 3178297 ~ 3185180 (+)
LOC120558536 NA coding upstream 621392 2825257 ~ 2826712 (+)
LOC120558526 NA coding upstream 691057 2753513 ~ 2757047 (+)
LOC120559413 NA coding upstream 785762 2661572 ~ 2662342 (+)
LOC120558523 NA coding upstream 800637 2645892 ~ 2647467 (+)
LOC120559447 lactbl1,LOC103362248,LOC100707689,LOC101473793,LOC102312186 coding downstream 211203 3725961 ~ 3734391 (+)
LOC120558400 NA coding downstream 443798 3958556 ~ 3982281 (+)
LOC120558402 LOC103357835,LOC104954328 coding downstream 490507 4005265 ~ 4014601 (+)
mfn2 mfn2 coding downstream 515765 4030523 ~ 4059713 (+)
LOC120559787 LOC103357833 coding downstream 569936 4084694 ~ 4180336 (+)
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LOC120559446 NA non-coding downstream 191847 3706605 ~ 3719155 (+)
G46996 NA non-coding downstream 352393 3867151 ~ 3870238 (+)
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G47006 NA non-coding downstream 364034 3878792 ~ 3881000 (+)
LOC120559414 NA other upstream 143467 3279361 ~ 3304637 (+)
LOC120559392 NA other upstream 160015 3146481 ~ 3288089 (+)
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gpr173 LOC104932793,LOC101475032,LOC100694027,LOC104957049 other downstream 328306 3843064 ~ 3865798 (+)
LOC120559501 NA other downstream 1258174 4772932 ~ 4775358 (+)
G47444 NA other downstream 2684288 6199046 ~ 6200594 (+)
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G47903 LOC104965021 other downstream 4597683 8112441 ~ 8116228 (+)

Expression


Co-expression Network