G48640


Basic Information

Item Value
gene id G48640
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 10614031 ~ 10750428 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU64954
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>TU64964
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>TU64965
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>TU64968
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>TU64973
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU64954 False 1415 lncRNA 0.38 3 10623891 10703381
TU64964 False 2418 TUCP 0.41 8 10614031 10703381
TU64965 False 2352 lncRNA 0.41 2 10637607 10672020
TU64968 False 1402 lncRNA 0.38 3 10623891 10703381
TU64973 True 3559 lncRNA 0.42 7 10614207 10750428

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120559192 NA coding upstream 30502 10574601 ~ 10583529 (+)
LOC120559190 LOC103365742 coding upstream 73679 10530663 ~ 10540352 (+)
magi3a magi3 coding upstream 87697 10326748 ~ 10526334 (+)
tmem269 LOC103365731,LOC102791044,LOC104928629,LOC100689985,LOC100710458,LOC108237576,LOC101473555 coding upstream 297395 10303395 ~ 10316636 (+)
hspg2 hspg2 coding upstream 325891 10163002 ~ 10288140 (+)
LOC120558407 NA coding downstream 7969 10758397 ~ 10811552 (+)
LOC120558497 NA coding downstream 567002 11317430 ~ 11328619 (+)
rapgef3 LOC103365870 coding downstream 602186 11352614 ~ 11382149 (+)
dazap2 dazap2 coding downstream 748444 11498872 ~ 11503554 (+)
si:ch211-210c8.6 LOC103365959,LOC103139179,LOC106936181,LOC105935261,LOC100690432,LOC102797068,LOC102213155 coding downstream 766216 11516644 ~ 11520131 (+)
G48639 NA non-coding upstream 27488 10586159 ~ 10586543 (+)
LOC120559193 NA non-coding upstream 53791 10544009 ~ 10560240 (+)
G48602 NA non-coding upstream 71105 10511822 ~ 10542926 (+)
G48594 NA non-coding upstream 209272 10404052 ~ 10404759 (+)
G48507 NA non-coding upstream 599648 10010836 ~ 10014383 (+)
G48670 NA non-coding downstream 105074 10855502 ~ 10899132 (+)
G48671 LOC103365835,LOC104948831,LOC100710642 non-coding downstream 117430 10867858 ~ 10871077 (+)
G48680 NA non-coding downstream 156932 10907360 ~ 10960482 (+)
G48679 NA non-coding downstream 159715 10910143 ~ 10912072 (+)
G48755 NA non-coding downstream 457859 11208287 ~ 11208634 (+)
agmat agmat,LOC102790280 other upstream 462780 10139598 ~ 10151251 (+)
ubxn10 NA other upstream 688950 9922600 ~ 9925081 (+)
G48347 NA other upstream 1184084 9404224 ~ 9429947 (+)
LOC120559255 tshz2 other upstream 1492119 8990487 ~ 9121912 (+)
G48162 NA other upstream 1887479 8716767 ~ 8726552 (+)
G48752 NA other downstream 422167 11172595 ~ 11173654 (+)
G48765 NA other downstream 564234 11314662 ~ 11315992 (+)
xkr5l xkr7,LOC103354446,LOC100690518 other downstream 1334024 12084452 ~ 12090773 (+)
LOC120559364 cables2,LOC103354454,LOC100695798 other downstream 1342351 12092779 ~ 12103899 (+)
nol4la LOC103354513,LOC100696587 other downstream 1431781 12182209 ~ 12210409 (+)

Expression


Co-expression Network