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Basic Information


Item Value
gene id tmem269
gene name LOC103365731,LOC102791044,LOC104928629,LOC100689985,LOC100710458,LOC108237576,LOC101473555
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 10303395 ~ 10316636 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>XM_039799834.1
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>XM_039799835.1
GTCAACGATAACCATTGGTAACGTCATCTCCGGTGGAATATTCCAGCGGATCTATCCTTGGTCTTTAAAAGGACGCGCTGAAAACGCTGCTGTGATATTGACAGCTGATGTTCTTTGACCCAGAGACAATCATGATCCTCCTGACTCCCTCTTCTGGTCTCTTCCGGTGTACCAACAAGCTCTTTCTGAGTGATGAAGCCACCGGACTCCAGATCAAGGAGTTTGCACGTAAAAATGCAGCTAATGCTCTTTCAATGTGCAACATGGTCATGGGCATGGCCTCCATTCTCAGCAGTCTAAATGGGCACCATCATGCTGCATGTTGGCTGGTTCTGATTGGCTACCTGCTGGATTTGGCAGATGGAGCAGTTGCCAGGCGACTCGGTGCCTGTTCTGCACTGGGTGCAAAGCTCGATGATTTTGCTGACTTCACGACATTCGGGATTGCCACGTCATTGCTCCTAAGGACGACCGACCTGATGGACAACATCCTGTGCGTGTGTTACgtcttgtctgtgtttgtccgCCTCTGTTTCTTCACGAGCGGGATCCCATTCATGTACCGCGGCCTGCCCTGCATCTACTCCTCAGGCATCCTGGCCagtgtctctctgctgtctggGGGGAACCTGGTCGTGCTGCGGGTCATTGCGGCAGCCATGATCTTCTTCATGATCAGCCAGAGCTTCTACCCCCATGACAAAGTGCTGGAGTCCCAGGCCTGGAAGAAAGTTGTCTATGCTGGAGgaGTCATCATGGTGTTTTGCTCTTCCTTCCCCCCTGCATGTGTCTACTACCTGCTGTGGTCAGTCTCCTACATTTTGTTCCCAACATCCCTTTGGAGCAGTAAAGTGTAAAATGGGTATTGGCTTTATCCAAAACTCCCATATAGGTTTACCTCTGGCCCACCCGGGTGAACTGAGGCTTCCAGACTGCTGCTGCTCCCTACTGCCATGGAGGATCCAAGCTGAACATGCTCATGCTCCACAGGCAAATCACTCGCTCTATTTGACCTTTTTATTTTGACGCAACACCTCTAAAACAAAACCCAGATTGAAGAGAGTTAGAGTGAGGGATAAGAATGAGATTTTAATGTCGCTGGTAAGGACTAACCTTCATGCTGTCTTGTGTCTTTGTTGCATTTTCACTGAAACCGGGAGTTGGATGGCTTGTtccatgatttttttattttttttaatcaggtttATCTCCTGTGGAATCCCCCTACTTCAATATTAATCTTTCATCAATGTTGTGAACACGCAGCAGCAGTCGATATAAAAAAGCAATTATTTCAAATTTAAATAAGCACACAAATTTCTAATATACTTTGGCCTCAAATTTGggttttttaaatatgtttaattGTGTAATCACACTGGATCGTAACTCTTATTATGATGTCCACAGTGTTGAGCATAGCCTAATGAGTAACTGTTTTAGTGCTACAGTATGTAGGAAGCGCCTTTAATCAATGAATATACAACATGATTTCTGAGCAGCATTTTCGAGGTTCAAAATTCCAAGTTCTTTCGGGTTTATCTATAACACAGTAATGGGAATTCGTAAAGGCACTATGACCATGTCTTGTGTTAACTGACTGTCTGTTAACTGACTGTCTGTTAATGTTTGTATCCGGGTTGAGGTCACTTCACTTTCATAGTGTTCAGAGTgggaaatttactttttttccattttgtagGCGTCTCAAATCCAGTGAATATTTGTAAGAAGCTTTCATTTCAATTATTAGATTTGCTGTTTTATAAATAAGTTCAGTTGAAAGTCAGCTGACCACAACTCTGGCATCTGTGAATGTGGAGACTTTCAGACTTTTTACAAAGTTGTGGCTCTGTCCAATAAATGATGTGTTAGATTTCCATATTTCTTCTAAGTGTGTTCTTATTTGCTAATTGTATGTGTTTACCTCTGTTTTAAGAGGCATTGCAGTTTTAATAGTAAATCCACACTGGATCACATAAACATCTCGTAGTACTGCTCTGGCCACAGCTCAATCGGTAACATCAGTGATTTTTAGGTGGAGTCAGGAATGCAACATGAGTGGGCGGCGCCGCCCATAAATGGCAAAGCAGCAGCAGGTTTCTGCCTTGTCATTCAGTGTGAATTTACCCTTAAAGAGCAACAACACGCAGGCTGCGAATTCTGCTTTTTCCTCACCACGCTGCAAGTTTTGCCTCCACCTTAAAGGTGTTGTAACATTGCACTATAGTCCATGTTGGCTGTGCTCACAAATGCACCAAACCACTACTAGTGGTGGAGCAGCATGGAAACATTAAACCCACAAGGAAGGAGAGTTTAAGTGTGTTGTTAATCTTTAACTTGGCCGGCATTCAGTCAGGGGgacatcattattttttttttttgtagactgtgtttcacaatgtgtgtatttgcgCCTCTCTGCATCGTGTGTGGCAAATGGGGAGATTATACAGTATGCCCATGTTTAAATTTGGACTCTGGAGCTTGTAATCGGAGGTGTCGAAATAAATGGTATGACATCACTCACCATTTTAGTtcagtgtttttaatgttaattGTAATGATTTGGAACCCTCTTACAAGCAATATCAGAGCCCGAAGAAGGAAAACCTAAAGCAGAGTTTCAAGAAAACGAAGACCCGAGGTGTCCGTCTTCAGGTTCTGATATTGGTCTGAACCCACTGGGGTTCTTGACATGGTTACAGtaaccaatgttgtaaagaaaatcCACAGTGAAAAGTGCACACACAAGACTAAACACAAATCTACTCTATTACATTCAGCTTTCCTGTGTGGGTGTTTTGGTTTTCAAACTGTGAAGTCACAGTGATGTATGCATGCCTAGAGCATTACAGATACAAAAACTGTACTTtgcccaataaaaaaaaaaaaaaagatcttaatGATAAGATCtgtgcttttacttttactgtCTGTACATTTTTGACAATAAAGAGGCAATAATGAAATGAC
>XM_039799836.1
TTACAGCTGATGTTCTTTGACCCAGAGACAATCATGATCCTCCTGACTCCCTCTTCTGATGAAGAGTCTCTTGAACTCGCCTGGCTTTGGAATCACAGGAAGTTCAGGGTCTCTTCCGGTGTACCAACAAGCTCTTTCTGAGTGATGAAGCCACCGGACTCCAGATCAAGGAGTTTGCACGTAAAAATGCAGCTAATGCTCTTTCAATGTGCAACATGGTCATGGGCATGGCCTCCATTCTCAGCAGTCTAAATGGGCACCATCATGCTGCATGTTGGCTGGTTCTGATTGGCTACCTGCTGGATTTGGCAGATGGAGCAGTTGCCAGGCGACTCGGTGCCTGTTCTGCACTGGGTGCAAAGCTCGATGATTTTGCTGACTTCACGACATTCGGGATTGCCACGTCATTGCTCCTAAGGACGACCGACCTGATGGACAACATCCTGTGCGTGTGTTACgtcttgtctgtgtttgtccgCCTCTGTTTCTTCACGAGCGGGATCCCATTCATGTACCGCGGCCTGCCCTGCATCTACTCCTCAGGCATCCTGGCCagtgtctctctgctgtctggGGGGAACCTGGTCGTGCTGCGGGTCATTGCGGCAGCCATGATCTTCTTCATGATCAGCCAGAGCTTCTACCCCCATGACAAAGTGCTGGAGTCCCAGGCCTGGAAGAAAGTTGTCTATGCTGGAGgaGTCATCATGGTGTTTTGCTCTTCCTTCCCCCCTGCATGTGTCTACTACCTGCTGTGGTCAGTCTCCTACATTTTGTTCCCAACATCCCTTTGGAGCAGTAAAGTGTAAAATGGGTATTGGCTTTATCCAAAACTCCCATATAGGTTTACCTCTGGCCCACCCGGGTGAACTGAGGCTTCCAGACTGCTGCTGCTCCCTACTGCCATGGAGGATCCAAGCTGAACATGCTCATGCTCCACAGGCAAATCACTCGCTCTATTTGACCTTTTTATTTTGACGCAACACCTCTAAAACAAAACCCAGATTGAAGAGAGTTAGAGTGAGGGATAAGAATGAGATTTTAATGTCGCTGGTAAGGACTAACCTTCATGCTGTCTTGTGTCTTTGTTGCATTTTCACTGAAACCGGGAGTTGGATGGCTTGTtccatgatttttttattttttttaatcaggtttATCTCCTGTGGAATCCCCCTACTTCAATATTAATCTTTCATCAATGTTGTGAACACGCAGCAGCAGTCGATATAAAAAAGCAATTATTTCAAATTTAAATAAGCACACAAATTTCTAATATACTTTGGCCTCAAATTTGggttttttaaatatgtttaattGTGTAATCACACTGGATCGTAACTCTTATTATGATGTCCACAGTGTTGAGCATAGCCTAATGAGTAACTGTTTTAGTGCTACAGTATGTAGGAAGCGCCTTTAATCAATGAATATACAACATGATTTCTGAGCAGCATTTTCGAGGTTCAAAATTCCAAGTTCTTTCGGGTTTATCTATAACACAGTAATGGGAATTCGTAAAGGCACTATGACCATGTCTTGTGTTAACTGACTGTCTGTTAACTGACTGTCTGTTAATGTTTGTATCCGGGTTGAGGTCACTTCACTTTCATAGTGTTCAGAGTgggaaatttactttttttccattttgtagGCGTCTCAAATCCAGTGAATATTTGTAAGAAGCTTTCATTTCAATTATTAGATTTGCTGTTTTATAAATAAGTTCAGTTGAAAGTCAGCTGACCACAACTCTGGCATCTGTGAATGTGGAGACTTTCAGACTTTTTACAAAGTTGTGGCTCTGTCCAATAAATGATGTGTTAGATTTCCATATTTCTTCTAAGTGTGTTCTTATTTGCTAATTGTATGTGTTTACCTCTGTTTTAAGAGGCATTGCAGTTTTAATAGTAAATCCACACTGGATCACATAAACATCTCGTAGTACTGCTCTGGCCACAGCTCAATCGGTAACATCAGTGATTTTTAGGTGGAGTCAGGAATGCAACATGAGTGGGCGGCGCCGCCCATAAATGGCAAAGCAGCAGCAGGTTTCTGCCTTGTCATTCAGTGTGAATTTACCCTTAAAGAGCAACAACACGCAGGCTGCGAATTCTGCTTTTTCCTCACCACGCTGCAAGTTTTGCCTCCACCTTAAAGGTGTTGTAACATTGCACTATAGTCCATGTTGGCTGTGCTCACAAATGCACCAAACCACTACTAGTGGTGGAGCAGCATGGAAACATTAAACCCACAAGGAAGGAGAGTTTAAGTGTGTTGTTAATCTTTAACTTGGCCGGCATTCAGTCAGGGGgacatcattattttttttttttgtagactgtgtttcacaatgtgtgtatttgcgCCTCTCTGCATCGTGTGTGGCAAATGGGGAGATTATACAGTATGCCCATGTTTAAATTTGGACTCTGGAGCTTGTAATCGGAGGTGTCGAAATAAATGGTATGACATCACTCACCATTTTAGTtcagtgtttttaatgttaattGTAATGATTTGGAACCCTCTTACAAGCAATATCAGAGCCCGAAGAAGGAAAACCTAAAGCAGAGTTTCAAGAAAACGAAGACCCGAGGTGTCCGTCTTCAGGTTCTGATATTGGTCTGAACCCACTGGGGTTCTTGACATGGTTACAGtaaccaatgttgtaaagaaaatcCACAGTGAAAAGTGCACACACAAGACTAAACACAAATCTACTCTATTACATTCAGCTTTCCTGTGTGGGTGTTTTGGTTTTCAAACTGTGAAGTCACAGTGATGTATGCATGCCTAGAGCATTACAGATACAAAAACTGTACTTtgcccaataaaaaaaaaaaaaaagatcttaatGATAAGATCtgtgcttttacttttactgtCTGTACATTTTTGACAATAAAGAGGCAATAATGAAATGAC

Function


NR:

description
PREDICTED: CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0008654 phospholipid biosynthetic process biological_process
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016780 phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups molecular_function

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039799836.1 False 2928 mRNA 0.42 7 10306488 10316636

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
hspg2 hspg2 coding upstream 15255 10163002 ~ 10288140 (+)
pink1 pink1 coding upstream 172141 10118685 ~ 10131254 (+)
LOC120558778 NA coding upstream 186560 10023340 ~ 10116835 (+)
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vwa5b1 vwa5b1 coding upstream 333472 9936549 ~ 9969923 (+)
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LOC120559190 LOC103365742 coding downstream 214027 10530663 ~ 10540352 (+)
LOC120559192 NA coding downstream 257965 10574601 ~ 10583529 (+)
LOC120558406 NA coding downstream 277148 10593784 ~ 10747553 (+)
LOC120558407 NA coding downstream 441761 10758397 ~ 10811552 (+)
G48507 NA non-coding upstream 289012 10010836 ~ 10014383 (+)
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G48399 NA non-coding upstream 550850 9752026 ~ 9752545 (+)
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G48602 NA non-coding downstream 195186 10511822 ~ 10542926 (+)
LOC120559193 NA non-coding downstream 227373 10544009 ~ 10560240 (+)
G48639 NA non-coding downstream 269523 10586159 ~ 10586543 (+)
LOC120558408 NA non-coding downstream 319840 10636476 ~ 10637645 (+)
agmat agmat,LOC102790280 other upstream 152144 10139598 ~ 10151251 (+)
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LOC120559255 tshz2 other upstream 1181483 8990487 ~ 9121912 (+)
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G48640 NA other downstream 297395 10614031 ~ 10750428 (+)
G48752 NA other downstream 855959 11172595 ~ 11173654 (+)
G48765 NA other downstream 998026 11314662 ~ 11315992 (+)
xkr5l xkr7,LOC103354446,LOC100690518 other downstream 1767816 12084452 ~ 12090773 (+)
LOC120559364 cables2,LOC103354454,LOC100695798 other downstream 1776143 12092779 ~ 12103899 (+)

Expression



Co-expression Network