si:rp71-79p20.2 (slc2a4rg,LOC104941506)


Basic Information

Item Value
gene id si:rp71-79p20.2
gene name slc2a4rg,LOC104941506
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 17787344 ~ 17831215 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039800330.1
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Function

symbol description
slc2a4rg Enables DNA-binding transcription factor activity. Involved in regulation of transcription, DNA-templated. Located in nuclear speck.

NR:

description
PREDICTED: SLC2A4 regulator isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039800330.1 True 7710 mRNA 0.42 9 17787344 17831215
XM_039800331.1 False 7569 mRNA 0.42 8 17787344 17831215

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
birc7 birc7 coding upstream 97477 17686147 ~ 17689867 (+)
slc17a9b slc17a9,LOC102799335 coding upstream 199764 17576722 ~ 17587580 (+)
LOC120558532 gid8 coding upstream 212201 17571779 ~ 17575143 (+)
LOC120559200 LOC103354450 coding upstream 268930 17511672 ~ 17518414 (+)
LOC120559455 LOC103354448,LOC104961977 coding upstream 392621 17375003 ~ 17394723 (+)
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LOC120559899 emilin3 coding downstream 309609 18140824 ~ 18156119 (+)
slc9a8 slc9a8 coding downstream 360672 18191887 ~ 18212077 (+)
rnf114 rnf114,LOC103364155,LOC104964933,LOC104925098 coding downstream 510495 18341710 ~ 18349313 (+)
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G50752 NA non-coding downstream 112497 17943712 ~ 17944815 (+)
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G50860 NA non-coding downstream 436250 18267465 ~ 18267887 (+)
LOC120559485 lime1,LOC103354460,LOC103467936,LOC105926125,LOC107096010,LOC103141841 other upstream 946 17741371 ~ 17786398 (+)
G50523 slc6a6,LOC104935489,LOC101165803,LOC100694392,LOC102780524 other upstream 590171 17185911 ~ 17197173 (+)
eif2d eif2d other upstream 792643 16977897 ~ 16994701 (+)
LOC120559923 NA other upstream 1378883 16397669 ~ 16408461 (+)
brpf1 brpf1 other upstream 1391136 16380044 ~ 16396208 (+)
opn7b LOC103364157,LOC103467481 other downstream 424677 18255892 ~ 18300333 (+)
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