LOC120559547 (mitf)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120559547
gene name mitf
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 13564625 ~ 13605435 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

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Function

symbol description
mitf Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and E-box binding activity. Involved in several processes, including negative regulation of cell migration; positive regulation of gene expression; and regulation of transcription, DNA-templated. Located in cytoplasm and nucleus. Part of protein-containing complex. Implicated in Tietz syndrome; Tietze's syndrome; Waardenburg syndrome type 2A; Waardenburg's syndrome; and familial melanoma. Biomarker of melanoma.

NR:

description
PREDICTED: microphthalmia-associated transcription factor isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K09455 MITF; microphthalmia-associated transcription factor

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039801320.1 False 3466 mRNA 0.40 9 13597049 13605435

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G49776 NA other downstream 969107 14574542 ~ 14577572 (+)

Expression


Co-expression Network