G69140


Basic Information

Item Value
gene id G69140
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 42497565 ~ 42536958 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU92616
catgtttctggaaacatctgaagagagaaatagaccgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU92618
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>TU92619
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>TU92622
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>TU92624
tgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtatctgttgtctccagttgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCtgctgtccatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatatcagaGTGTGTATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGGtgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGCTGTCTCCAGTGTGTGTTCCAGCTCTGCAGCTCTGTCAGTCGTGTCCGTCTGTCCTC
>TU92625
tgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtatctgctgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagagtgtgtATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatatcagaGTGTGTATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGGtgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtgtgtatctgttgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGCtgtctccagtgtgtgtgtgtatcagagtGTGTATCTGCTGTCTCCAGTGTGTGTTCCAGCTCTGCAGCTCTGTCAGTCGTGTCCGTCTGTCCTC
>TU92626
catgtttctggaaacatctgaagagagaaatagaccgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgta

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU92616 False 272 lncRNA 0.49 2 42512621 42536958
TU92618 True 773 lncRNA 0.48 2 42535267 42536075
TU92619 False 669 lncRNA 0.48 3 42535267 42536075
TU92622 False 257 lncRNA 0.48 2 42497565 42536958
TU92624 False 707 TUCP 0.47 2 42535267 42536075
TU92625 False 665 lncRNA 0.48 3 42535267 42536075
TU92626 False 267 lncRNA 0.48 2 42497565 42536958

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120560191 NA coding downstream 226354 42262425 ~ 42271211 (-)
hpdb hpd,LOC103375816,LOC107092762,LOC101157460,LOC104940904,LOC106516708 coding downstream 240681 42241736 ~ 42256884 (-)
LOC120560212 NA coding downstream 284863 42209201 ~ 42212702 (-)
LOC120560222 NA coding downstream 318267 42175476 ~ 42179298 (-)
LOC120561110 LOC104936293,LOC104940908 coding downstream 361226 42111748 ~ 42136339 (-)
LOC120560234 plpp7,LOC107097912,LOC106531399,LOC103368069,LOC105917130,LOC101484670,LOC108248082 coding upstream 121398 42658356 ~ 42662019 (-)
LOC120560237 NA coding upstream 282916 42819874 ~ 42822645 (-)
LOC120561115 NA coding upstream 285447 42822405 ~ 42854342 (-)
LOC120560194 NA coding upstream 336939 42873897 ~ 42958273 (-)
snapc4 NA coding upstream 568384 43105342 ~ 43141553 (-)
G69131 NA non-coding downstream 1631 42425752 ~ 42495934 (-)
G69127 NA non-coding downstream 53720 42366029 ~ 42443845 (-)
G69129 NA non-coding downstream 84348 42396081 ~ 42413217 (-)
G69110 NA non-coding downstream 274427 42209938 ~ 42223138 (-)
G68919 NA non-coding downstream 407036 42090073 ~ 42090529 (-)
G69148 NA non-coding upstream 1084 42538042 ~ 42538316 (-)
G69149 NA non-coding upstream 1821 42538779 ~ 42539184 (-)
G69169 NA non-coding upstream 78263 42615221 ~ 42633725 (-)
G69177 NA non-coding upstream 111802 42648760 ~ 42649027 (-)
G69179 NA non-coding upstream 113333 42650291 ~ 42651406 (-)
G69105 NA other downstream 364984 42130611 ~ 42132581 (-)
G68921 NA other downstream 381304 42107630 ~ 42116261 (-)
G69104 NA other downstream 382806 42112792 ~ 42114759 (-)
rnf34a NA other downstream 390443 42098327 ~ 42107122 (-)
G68883 NA other downstream 423585 41836547 ~ 42073980 (-)
LOC120561114 NA other upstream 126405 42663363 ~ 42809622 (-)
G69229 chek2 other upstream 433126 42970084 ~ 43014065 (-)
chek2 chek2,LOC102215705 other upstream 465297 43002255 ~ 43025050 (-)
card9 card9,LOC108245830 other upstream 539272 43076230 ~ 43099165 (-)
pomt1 pomt1,LOC103397945,LOC102782456,LOC103398975 other upstream 606430 43143388 ~ 43178989 (-)

Expression


Co-expression Network