G69271


Basic Information

Item Value
gene id G69271
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 43151862 ~ 43153110 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU92802
gtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtatgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtatgtgtgatctgtgccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92804
gtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtatgtgtgatctgtgccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92805
gtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtatgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtatgtgtgatctgtgccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92806
gtgtgtgtgtgtgtgtgtccctgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtatgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtatgtgtgatctgtgccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU92802 False 471 lncRNA 0.51 3 43151862 43152875
TU92804 False 332 lncRNA 0.51 3 43151862 43153110
TU92805 False 464 lncRNA 0.51 3 43151862 43152875
TU92806 True 530 lncRNA 0.51 3 43151862 43153110

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
snapc4 NA coding downstream 10309 43105342 ~ 43141553 (-)
LOC120560194 NA coding downstream 193589 42873897 ~ 42958273 (-)
LOC120561115 NA coding downstream 297520 42822405 ~ 42854342 (-)
LOC120560237 NA coding downstream 329217 42819874 ~ 42822645 (-)
LOC120560234 plpp7,LOC107097912,LOC106531399,LOC103368069,LOC105917130,LOC101484670,LOC108248082 coding downstream 489843 42658356 ~ 42662019 (-)
LOC120561120 NA coding upstream 148509 43301619 ~ 43304446 (-)
LOC120561121 NA coding upstream 155238 43308348 ~ 43310847 (-)
LOC120560199 LOC108248098,LOC101175325,LOC102290088,LOC101464010,LOC103156294,LOC103460382,LOC102193617 coding upstream 327851 43480961 ~ 43528118 (-)
fibcd1a fibcd1,LOC102791113,LOC101470696 coding upstream 404607 43557717 ~ 43582312 (-)
LOC120560219 NA coding upstream 436934 43590044 ~ 43651535 (-)
G69246 NA non-coding downstream 47110 43103960 ~ 43104752 (-)
G69250 NA non-coding downstream 55243 43006859 ~ 43096619 (-)
G69266 NA non-coding downstream 59962 43089641 ~ 43091900 (-)
G69258 NA non-coding downstream 113385 43037547 ~ 43038477 (-)
G69254 NA non-coding downstream 129024 43021132 ~ 43022838 (-)
G69251 NA non-coding upstream 13011 43166121 ~ 43194392 (-)
G69272 NA non-coding upstream 50551 43203661 ~ 43225724 (-)
G69273 NA non-coding upstream 72825 43225935 ~ 43226903 (-)
G69340 NA non-coding upstream 113707 43266817 ~ 43450492 (-)
G69342 NA non-coding upstream 121369 43274479 ~ 43275772 (-)
card9 card9,LOC108245830 other downstream 52697 43076230 ~ 43099165 (-)
chek2 chek2,LOC102215705 other downstream 126812 43002255 ~ 43025050 (-)
G69229 chek2 other downstream 137797 42970084 ~ 43014065 (-)
LOC120561114 NA other downstream 342240 42663363 ~ 42809622 (-)
G69140 NA other downstream 614904 42497565 ~ 42536958 (-)
G69249 NA other upstream 57909 43211019 ~ 43218894 (-)
LOC120561119 LOC102192266,LOC107386210,LOC101154874,LOC101486486 other upstream 70367 43223477 ~ 43251312 (-)
G69356 LOC106941104,LOC103460379 other upstream 218657 43371767 ~ 43380599 (-)
phf19 phf19 other upstream 378123 43531233 ~ 43551988 (-)
LOC120560198 LOC106532130,LOC103370617,LOC108248104 other upstream 512677 43665787 ~ 43709261 (-)

Expression


Co-expression Network