G82758


Basic Information

Item Value
gene id G82758
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047599.1
NCBI id CM018545.1
chromosome length 32114633
location 14712582 ~ 14737784 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU98129
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CATACATATAGATATgacaatattgatattgtgacgTACTGTATTACGCCGAGCGCCAGTGGTGGTTCAGAGCTAAACGACTTTGTGCTACCAATTAGAAGGATGAGAGTTTCC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU98129 True 10114 lncRNA 0.41 2 14712582 14737784

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rpl8 rpl8,LOC107595836,LOC102782025 coding downstream 118088 14591717 ~ 14594494 (-)
si:ch211-218d20.15 NA coding downstream 175391 14534411 ~ 14537191 (-)
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shox shox,LOC107597497,LOC107748138,LOC107673655,LOC107695485 coding downstream 281157 14422550 ~ 14431425 (-)
tfdp1a tfdp1,tfdp1a,LOC108266453,LOC108426071,LOC107748134,LOC107597491,LOC107595816,LOC107756763 coding downstream 430945 14271488 ~ 14281637 (-)
mao maob,mao,LOC108266753,LOC107565948,LOC107673703,LOC107748155,LOC107695498,LOC107595828 coding upstream 56122 14793906 ~ 14824547 (-)
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fundc1 fundc1,LOC107673665 coding upstream 115960 14853744 ~ 14857520 (-)
dipk2b c6hxorf36 coding upstream 162375 14900159 ~ 14904735 (-)
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G82604 NA non-coding downstream 416772 14293937 ~ 14295810 (-)
LOC113526223 NA non-coding downstream 760749 13943807 ~ 13951833 (-)
LOC113526249 NA non-coding downstream 793376 13917103 ~ 13919206 (-)
G82849 NA non-coding upstream 181965 14919749 ~ 14920280 (-)
G82858 NA non-coding upstream 233894 14971678 ~ 14971897 (-)
G82861 NA non-coding upstream 253432 14991216 ~ 14991486 (-)
G82864 ccdc80,LOC101480086 non-coding upstream 264750 15002534 ~ 15004759 (-)
G82904 NA non-coding upstream 347579 15085363 ~ 15125648 (-)
med14 med14,LOC107756768 other downstream 159087 14538868 ~ 14553495 (-)
si:dkey-67c22.2 LOC108266737,LOC107597485,LOC108426078,LOC107756753,LOC107656780,LOC105016353,LOC106586502 other downstream 857396 13762417 ~ 13855186 (-)
gli2a gli2,LOC107597558,LOC107661135,LOC107596061,LOC107714335,LOC106586430 other downstream 1462034 13191714 ~ 13250548 (-)
hspbap1 hspbap1,LOC108261044,LOC107596081 other downstream 1984545 12713065 ~ 12728037 (-)
irs2b irs2 other downstream 2204894 12482661 ~ 12507688 (-)
ndp ndp,LOC107748154,LOC107756747,LOC107695497,LOC107595887 other upstream 89891 14827675 ~ 14837409 (-)
dcaf6 dcaf6 other upstream 312099 15049883 ~ 15077216 (-)
LOC117597380 NA other upstream 369165 15106949 ~ 15114695 (-)
pou1f1 pou1f1,LOC107688653,LOC107661330,LOC107561319 other upstream 1205956 15943740 ~ 15973914 (-)
lmo7a lmo7 other upstream 1305499 16043283 ~ 16076620 (-)

Expression


Co-expression Network