mtmr3 (mtmr3,LOC107699659)



Basic Information


Item Value
gene id mtmr3
gene name mtmr3,LOC107699659
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 16580257 ~ 16621766 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>TU158254
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>TU158256
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>TU158258
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>TU158260
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>TU158261
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Function


symbol description
mtmr3 Predicted to enable phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 3-phosphatase activity; phosphatidylinositol-3-phosphatase activity; and protein phosphatase binding activity. Predicted to be involved in phosphatidylinositol dephosphorylation and regulation of autophagy. Predicted to act upstream of or within dephosphorylation and lipid metabolic process. Predicted to be active in cytoplasm and membrane. Orthologous to human MTMR3 (myotubularin related protein 3).

NR:

description
PREDICTED: myotubularin-related protein 3 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K18082 MTMR3_4, ZFYVE10_11; myotubularin-related protein 3/4

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G133631 smyd1b,fabp1,LOC108265070,LOC108430330,LOC103043953,LOC108430333,LOC107704576,LOC107579792,LOC107573351,LOC107712467,LOC107726869 other upstream 561439 16002061 ~ 16018818 (+)
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Expression



Co-expression Network