gucd1 (gucd1,LOC102792582)


Basic Information

Item Value
gene id gucd1
gene name gucd1,LOC102792582
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 16859976 ~ 16868768 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU158518
GATCCGAGCTCCTAATTCCCAATTCCGAGGTAGGCCAAATGTAGTATTACTCGTAAGTAGCGTACCCGCAAATTTCTGCGAGTTTTTGCTTAATGCGTTAACTTTGTACAGTCTCAACTACTTTTGTTACACCGGAATGCACCGATTGACTGAAGAATGCACTCGTTTGTGCACGCATTAATTCATCCGTTCTTTTAATAACGATATTTCGTTCATCGCATTTGTCTCTTAAACGAACAGACGTTAGACCACTGTCTAGtgttagctaactggctaatgCTGTTGAAACCATTAACGATGGTAAGCTTGGAGAAACTATAAACAGTTGGATCAACTAGATATATAGCCGGTGAATTCCAAAACTACAGAATGACAGGTGAAATGTCAAATGGCATTTTCCCCCAGCCCACAGACGTTGTTCTGTTAAACGTTCCGGTTATCCGGCAGCTGTACCACTGGGATTGCGGTTTGGCGTGTTCGAGAATGGTATTAAAATATCTACATCCAGTGAGTGAAGAGGCGTTCCAGAGAGCTTGCTGTGATCTGAAATTAACAGAAAGCGTGTGGACTATTGACCTCGCATATCTCATGTGTCAGCTAGGCGTAAAACACTGTTTCTGCACACAAACATTAGGGGTAGACAAAGGCTTTAAAAATCAGGTATACCAAAATTTATGTAACTGATGTGTATAAAAGTTAATATTGCTTAAAAGCTAATGACTAATTTGGTCACATTGCACGAGTCATAGTTTTTATTGTATTAGTCAACATATTgttattaattgttattataaaTCTTGACCTATTTTGCAGGCTGCACACTTTGTAGCTGCTCATATTACGCACTGCATATAAGTAATTTAGTAATTTACTGTATGGTgctggaaattaaaaataaaaaaggattaTGAATGGAGTTGGGAAGGACAGGTCAATATGGCCAGTGtgttctccaaaaaaaaaaaagagagcattttgttttgaatttctATGCAGGTGCAGGCATCTTTTGACACCATggcaaaagatttttttaaattgtgcagTGTGACCCAAGCTTaaacaaatgttaatatttattcttttctccTATTGTAGTCCTTCTACAAAAAGCATTTTGATACTGAAGAAGACAGAGTAAATGAACTCTTTCTGAAAGCAGAGAGCAGTGGCGTAGTGGTAAAGAAATGGTAATAAACATGTTCTTCCGTATATATGTTGTTGCATGATTGTTCCAGTTTCACTGTAGGTCCTAGCACATAAATCAGGATTCCCACAGAATCTGGAAAATGGAAGGTTACATAGGTAACTGTGGTTCTAAGACTGTACCAGGGTGGTTTTCTTTTTGGAATACCAATTTCAAAGTCGTCACCTTGTGACTATGACCCCACATGGGTAGCCAGTAAAAGGTCCTTGCTATGTCACGCTTGTCTTATGGTTATTCACAACGACTTGAGTGACACAGGTGACCAGGTAATTTCCAGTTAATCACAGAACTATGGGTTGTGTACTTTGGAACCAGAGCAGTCTGTATATTAACTTTGTCATGTGCATTTCTAACACGTCCTATAGTGCACTTTGCTATGACAGCACTCATAAACAGTGCTGATACCATACTTCACTGAGGATTATAGTAGCTcaaattgttgatatggagcGTACTGGGAATAGCGATCACTGATCAGCAGTTGTAATAAGAAGAGATTTAGACTTATTAAATTCcaccttttatttttatctcttttccctttttctgtAGTAGAGACTGCACTTCAGTCAATATAGCCAGTTGGAGTGGGTCTCACGCATGTGTTGGGGCGGAAGCTTGTGTTTGTTAGTGGTTGACAGTGAACTTGTATTTGACTGCGTATTTTCACATATGATGCCAAGATTCCTTGGAACTTTTGGGGAATTATACCTGATGAAAAGCACCATCAGACTTAATTTACACATGAATTGCTATGGGTTCTGCGTTTGCACAGCAGCACCCGCGTGCAAGGTAAATGTAAAAAGCTCCTCCAAGTGCTGCACTTAATTGCTTTGTTGCATTCCACTAATAGCCTTTGCATTTGTCTTACACCCACTGCCAACTCCTTTTCATTCCAGTATTGTAAAGCACTCAGTTTGATCAAAGAGCTTACCTTTTTCTTTCTAGGGGCATTATAGCAGCTCTTTAAGTGCTTGCTGAAAATGCCTTGGTCCCAAGCAATTTGTGCATTGACCATCTTCCAACCCCATGAGGGGTCGTCAGGACAAATAGCTTGCCGTCCTTCTTTGAAAGAGGTTGTGGAAAAGTCTGTGGAAGTAATTCACCAGTTGCAAATTTATGATTTTATAACATTAGGAAATACTCACCAACACTGCTACGCATCAACACAAACAATAAGTCATTCACTTCTCCTGACAGTGCAgattcagcaataaaaaaaaattaacaagaaACAAAGGATTAGAGAACTTTAATTAGTGCCTTGAATTCACTTCCTTAACAACATGAGAATGGGAAAGAGATATGATATAGCATGGTCGTAGGCTGGGTCAGTGTCACGACATGGCAACTTTGCTATTGGTACTTGACAAACGTGCAAACAGTAATACACCACTAGTTCTGAAGGAAACCATCCTTGTGGTCCAGAACAAAAGGGAGTAGTGAAATTTAGTGATTGTTTTTTCAATCATGGAAAATTCC
>TU158519
GATCCGAGCTCCTAATTCCCAATTCCGAGGTAGGCCAAATGTAGTATTACTCGTAAGTAGCGTACCCGCAAATTTCTGCGAGTTTTTGCTTAATGCGTTAACTTTGTACAGTCTCAACTACTTTTGTTACACCGGAATGCACCGATTGACTGAAGAATGCACTCGTTTGTGCACGCATTAATTCATCCGTTCTTTTAATAACGATATTTCGTTCATCGCATTTGTCTCTTAAACGAACAGACGTTAGACCACTGTCTAGtgttagctaactggctaatgCTGTTGAAACCATTAACGATGGTAAGCTTGGAGAAACTATAAACAGTTGGATCAACTAGATATATAGCCGGTGAATTCCAAAACTACAGAATGACAGGTGAAATGTCAAATGGCATTTTCCCCCAGCCCACAGACGTTGTTCTGTTAAACGTTCCGGTTATCCGGCAGCTGTACCACTGGGATTGCGGTTTGGCGTGTTCGAGAATGGTATTAAAATATCTACATCCAGTGAGTGAAGAGGCGTTCCAGAGAGCTTGCTGTGATCTGAAATTAACAGAAAGCGTGTGGACTATTGACCTCGCATATCTCATGTGTCAGCTAGGCGTAAAACACTGTTTCTGCACACAAACATTAGGGGTAGACAAAGGCTTTAAAAATCAGGTATACCAAAATTTATGTAACTGATGTGTATAAAAGTTAATATTGCTTAAAAGCTAATGACTAATTTGGTCACATTGCACGAGTCATAGTTTTTATTGTATTAGTCAACATATTgttattaattgttattataaaTCTTGACCTATTTTGCAGGCTGCACACTTTGTAGCTGCTCATATTACGCACTGCATATAAGTAATTTAGTAATTTACTGTATGGTgctggaaattaaaaataaaaaaggattaTGAATGGAGTTGGGAAGGACAGGTCAATATGGCCAGTGtgttctccaaaaaaaaaaaagagagcattttgttttgaatttctATGCAGGTGCAGGCATCTTTTGACACCATggcaaaagatttttttaaattgtgcagTGTGACCCAAGCTTaaacaaatgttaatatttattcttttctccTATTGTAGTCCTTCTACAAAAAGCATTTTGATACTGAAGAAGACAGAGTAAATGAACTCTTTCTGAAAGCAGAGAGCAGTGGCGTAGTGGTAAAGAAATGGTGTGTGCTGTACTAGCATTAGCAATTTTGAAGAGGCAAGAATGAGCTATGGAACAGATGAGGACATTCTTTTCATCTTCAAGGACAGCTGATCACAGGATGCGCCTTTTTCTTTTGAGTCATGGTGAGGGCTTTGTGTAggcatataatatatatcaatCTTGGTATAGTTACAAATAAAAGGGGAGACCTCCAGAAACTTGGGAACAAATGTATATAGCCCACACTCATGAGTTGACCCCTTAACTTGTGAACAAACATAAAAAGGCTTAAACTCTATCACCTGGTGCAAACAAAAACAGGTATAGCTGTTATGTGACATTAGTCTTAAGGTAAACCAGTACTGATACAAGTGTTAATGCACAAATATATAGACAATATAGTCCCACCATTTTGCacaaataaatggaaaacaaaatgcacaaatatatcTACATCTACAAATGCTCAAATACAACTATATACTAACAATGCaaatacacagtggatataaaaagtctacacacccctgtgaAAATTCCACTCCTCCTTGCAAAAATGTCCTgaatctcctgtgcacagctctcttcaagtcattccactgGCTTTTGacaggatttagatctgggctctgactgggcaaTTCCAAAAATGTTGATCAtctgaagccattcttttgtttacttggatttgtgctttgggtcattgtcgtgctggaGGTTGAAATTTTCTTCATCTCCAGCCCTCTAACAGAAGCCTgtaggttttgtgccaaaatagattagTATTAGGAGCTATCCATATGCCTCTATTTTGAATAGAGACCCAGGACAAACccctggtttgagtatttcagaaactgatgatctcctgagATGAGATTTTAGGCACAATAGTCTATATAGTTGACACAGAAATGGTgcaaaacccccaaaaaaaacaacaaataaacaacaacaacaaaatccaACGAGTGGCAGAAACAACTttgtgatgagagagagaggaatggctagactggttctaagataagataaactttattgttcTTGAAGGAAATTCTTGAGATAGAACTGACAAGACGGCTTTGGTAACTCTAATAAccattctttacaactgtggtgagcagaaaagcgtctcagaatgcacaacatgctgaaccttgaggcggatgggctagagtggcagaagaccacattgggtacTGCTGTTCTGAAATACTCATTCAGAtgttttgatgtgaatattaactttTAATGCTATTAACGCTCtagacctgtatctgcatgattttatgcattgcactgctgccatttGATTGGGTAATTGCAAgcattcctattaaagtggccggtgattGTATTCATATTCGGGTTGTAATGCACAGATCTGAGTGGCCTGGTGTGTTTCTGCATTACATTGATTTGCAATAGGTATTGCCATTTTCTTGTaagtattattttatgtttgtttattattctaTGCCTTTTCAAATGATGTGCAAGATACAAATGactttgcatttatttgtgGAATGTGTTGTGATCATTTCAATCTATAAAGTTATATGCTTTGCTTGGCATTTAAGTGTTTGTGGACTGttagatactgtatatttgtgcaTTTGATGCTTGTATTTGTGATTTTggtactgtttttcttttactttagcTGTAGTGTCAGCTAACCTATGAGATGAATTTTGTTCACAGAATCTGTTCTCTGAATTCTGTCCTCTATTTCACAAAATCAGTACGTGCATATATTTGCCATGCTTCTGTAACATTTTGCTGAATAACATATCTGGAATCAATAAACCATAATTTATTATGTAGTTAATATAGTTAATAGAGCCGCAATATATATCACCACATAATGCAGTGCAGcacatttaatttagttttgaACACTTACCATGTTTATCTGCTTGAAATCAAGTGCAATGCTTCACAATTTGTAGGATTGTTTTAAGTACCAAAAATGACTACACTTAGGTGTTGTTCCTTTAATGGTTACTTATTATGGACAACcagcaaacatcagaatgatcAGGAATGTGGGTCAGAGAGACCATGTGAACTAAACCTGGTCATCTAAACTATGTTTAACTAAAATATTCCTCAGGGCCTGTTTGGTATCAATCTAATCCATGTTTCATTGTGAACAATGTGGTGACATCATAACATACAAGTTTAggaaataacatttacagtatatgattttatattttgcagtgtatgATTGTtcttcccacacacacccacaccaacacatacacatacacaggagACCTTTTCCTGTTGTTCCAAAGACACATTCTCAGGAATTAATTAACATATAAAATCCTAGGGTGACCCTACCCAACTGGGGAGCCATCCtgccataaaatacattttctctctcccaTTTGGTCATTATATATTTCAAAGAGGCTCAAAGGTATAAAAAGGTATGCATTATACAATGGCGAGAAATGCGTTTACCATCAAGCATCCTATGCCCACTTCTCTGTTCATTGACTCTGT
>XM_026910769.2
AAATGACGTTGATCCGAGCTCCTAATTCCCAATTCCGAGGTAGGCCAAATGTAGTATTACTCGTAAGTAGCGTACCCGCAAATTTCTGCGAGTTTTTGCTTAATGCGTTAACTTTGTACAGTCTCAACTACTTTTGTTACACCGGAATGCACCGATTGACTGAAGAATGCACTCGTTTGTGCACGCATTAATTCATCCGTTCTTTTAATAACGATATTTCGTTCATCGCATTTGTCTCTTAAACGAACAGACGTTAGACCACTGTCTAGtgttagctaactggctaatgCTGTTGAAACCATTAACGATGGTAAGCTTGGAGAAACTATAAACAGTTGGATCAACTAGATATATAGCCGGTGAATTCCAAAACTACAGAATGACAGGTGAAATGTCAAATGGCATTTTCCCCCAGCCCACAGACGTTGTTCTGTTAAACGTTCCGGTTATCCGGCAGCTGTACCACTGGGATTGCGGTTTGGCGTGTTCGAGAATGGTATTAAAATATCTACATCCAGTGAGTGAAGAGGCGTTCCAGAGAGCTTGCTGTGATCTGAAATTAACAGAAAGCGTGTGGACTATTGACCTCGCATATCTCATGTGTCAGCTAGGCGTAAAACACTGTTTCTGCACACAAACATTAGGGGTAGACAAAGGCTTTAAAAATCAGTCCTTCTACAAAAAGCATTTTGATACTGAAGAAGACAGAGTAAATGAACTCTTTCTGAAAGCAGAGAGCAGTGGCGTAGTGGTAAAGAAATGCTCTGTGACTGTTCAGGAGATCCAGGCTCATCTGAGCCATGGACATGTGGCTATCGTGCTGGTAAATGctgtagtgttagtgtgtgaacTCTGCTCCACTTCAGTCAAGTACTGCTGCTTTCTACCTGTGAATCAGAAGTGTTTCTGCAGTACACCTGATTACCAAGGTCACTTTGTGGTAGTATGTGGATTTAATCGTACAGCTGGCTGCATCTTTTATAACAACCCTGCTTATTCTGACCGTGTGTGCTGTACTAGCATTAGCAATTTTGAAGAGGCAAGAATGAGCTATGGAACAGATGAGGACATTCTTTTCATCTTCAAGGACAGCTGATCACAGGATGCGCCTTTTTCTTTTGAGTCATGGTGAGGGCTTTGTGTAggcatataatatatatcaatCTTGGTATAGTTACAAATAAAAGGGGAGACCTCCAGAAACTTGGGAACAAATGTATATAGCCCACACTCATGAGTTGACCCCTTAACTTGTGAACAAACATAAAAAGGCTTAAACTCTATCACCTGGTGCAAACAAAAACAGGTATAGCTGTTATGTGACATTAGTCTTAAGGTAAACCAGTACTGATACAAGTGTTAATGCACAAATATATAGACAATATAGTCCCACCATTTTGCacaaataaatggaaaacaaaatgcacaaatatatcTACATCTACAAATGCTCAAATACAACTATATACTAACAATGCaaatacacagtggatataaaaagtctacacacccctgtgaAAATTCCACTCCTCCTTGCAAAAATGTCCTgaatctcctgtgcacagctctcttcaagtcattccactgGCTTTTGacaggatttagatctgggctctgactgggcaaTTCCAAAAATGTTGATCAtctgaagccattcttttgtttacttggatttgtgctttgggtcattgtcgtgctggaGGTTGAAATTTTCTTCATCTCCAGCCCTCTAACAGAAGCCTgtaggttttgtgccaaaatagattagTATTAGGAGCTATCCATATGCCTCTATTTTGAATAGAGACCCAGGACAAACccctggtttgagtatttcagaaactgatgatctcctgagATGAGATTTTAGGCACAATAGTCTATATAGTTGACACAGAAATGGTgcaaaaccccc

Function

symbol description
gucd1 Orthologous to human GUCD1 (guanylyl cyclase domain containing 1).

NR:

description
PREDICTED: protein GUCD1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU158518 False 2689 lncRNA 0.39 3 16859986 16862952
TU158519 True 3694 lncRNA 0.37 4 16859986 16868768
XM_026910769.2 False 1915 mRNA 0.41 6 16859976 16867175

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cux2b cux2 coding upstream 281287 16460558 ~ 16578689 (+)
rad9b rad9b coding upstream 420892 16423733 ~ 16439084 (+)
dhx37 dhx37 coding upstream 462351 16376145 ~ 16397625 (+)
gp1bb gp1bb coding upstream 484848 16371957 ~ 16375128 (+)
sept5a sept5,LOC102226618 coding upstream 488235 16355696 ~ 16371741 (+)
LOC113524948 NA coding downstream 169053 17037821 ~ 17050280 (+)
LOC117597835 NA coding downstream 192290 17061058 ~ 17081950 (+)
seta seta,LOC108265615,LOC103031932,LOC107752982,LOC107699670,LOC107754404,LOC107560061 coding downstream 480548 17349316 ~ 17352590 (+)
crb2b LOC108264959 coding downstream 542340 17411108 ~ 17449062 (+)
lhx2b lhx2,lhx2b coding downstream 742618 17611386 ~ 17621646 (+)
LOC117597830 NA non-coding upstream 196662 16643490 ~ 16663314 (+)
G133890 NA non-coding upstream 419453 16439266 ~ 16440523 (+)
G133842 NA non-coding upstream 497727 16330580 ~ 16362249 (+)
G133724 NA non-coding upstream 687443 16172290 ~ 16172533 (+)
G133722 NA non-coding upstream 688476 16171185 ~ 16171500 (+)
LOC113533561 NA non-coding downstream 82780 16951548 ~ 16974937 (+)
G134230 NA non-coding downstream 96066 16964834 ~ 16965057 (+)
G134238 NA non-coding downstream 122999 16991767 ~ 16991967 (+)
G134241 NA non-coding downstream 146983 17015751 ~ 17016056 (+)
G134242 NA non-coding downstream 147486 17016254 ~ 17016534 (+)
bicdl1 bicdl1,LOC107724381,LOC107699624 other upstream 121992 16716133 ~ 16737984 (+)
mtmr3 mtmr3,LOC107699659 other upstream 238210 16580257 ~ 16621766 (+)
si:ch211-166a6.5 LOC108265755,LOC107714554 other upstream 440467 16402748 ~ 16419509 (+)
G133631 smyd1b,fabp1,LOC108265070,LOC108430330,LOC103043953,LOC108430333,LOC107704576,LOC107579792,LOC107573351,LOC107712467,LOC107726869 other upstream 841158 16002061 ~ 16018818 (+)
srp19 srp19 other upstream 1475152 15378942 ~ 15384824 (+)
G134341 NA other downstream 427343 17296111 ~ 17296883 (+)
vdac3 vdac3,LOC107754399,LOC107560056 other downstream 1162207 18030975 ~ 18048889 (+)
pbx3b pbx3,pbx3b,LOC108434408,LOC107550583,LOC107669256,LOC107555108 other downstream 1567417 18436185 ~ 18681932 (+)
G135287 LOC108265174 other downstream 2618719 19487487 ~ 19502643 (+)
LOC113533656 gnas,LOC108261582,LOC108265241,LOC108434415,LOC104936173,LOC102796627 other downstream 2957030 19825798 ~ 19902367 (+)

Expression


Co-expression Network