LOC113531612 (nudt12)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113531612
gene name nudt12
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 15357916 ~ 15364024 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
nudt12 Predicted to enable NADH pyrophosphatase activity. Predicted to be involved in NAD catabolic process; NADH metabolic process; and NADP catabolic process. Predicted to be active in cytosol and peroxisome. Orthologous to human NUDT12 (nudix hydrolase 12).

NR:

description
PREDICTED: peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K03426 E3.6.1.22, NUDT12, nudC; NAD+ diphosphatase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026922449.2 False 3716 mRNA 0.42 7 15358122 15364024
XM_026922457.2 False 3641 mRNA 0.42 7 15358122 15364024
XM_034306505.1 False 3597 mRNA 0.42 7 15357916 15364024
XM_034306506.1 True 3856 mRNA 0.41 7 15357916 15364024
XM_034306508.1 False 3599 mRNA 0.42 7 15358122 15364024

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC117595717 nudt12 coding upstream 439 15351226 ~ 15357477 (+)
prdm6 prdm6 coding upstream 80976 15246938 ~ 15276940 (+)
snx2 snx2 coding upstream 148834 15195053 ~ 15209082 (+)
sncaip sncaip coding upstream 183194 15165645 ~ 15174722 (+)
LOC113532232 lox coding upstream 194556 15156839 ~ 15163360 (+)
lrrc2 lrrc2 coding downstream 34248 15398272 ~ 15402724 (+)
spinb LOC108265781 coding downstream 54440 15418464 ~ 15439687 (+)
csgalnact1b LOC108265223 coding downstream 78476 15442500 ~ 15452743 (+)
LOC113535909 LOC103035969,LOC108265984,LOC108430321 coding downstream 90024 15454048 ~ 15463883 (+)
LOC113533162 NA coding downstream 109652 15473676 ~ 15482696 (+)
G133306 NA non-coding upstream 13885 15343754 ~ 15344031 (+)
G133260 NA non-coding upstream 58529 15299184 ~ 15299387 (+)
G133220 NA non-coding upstream 148070 15209515 ~ 15209846 (+)
G132968 trim36 non-coding upstream 533553 14821982 ~ 14824363 (+)
G132959 NA non-coding upstream 613770 14742482 ~ 14744146 (+)
G133330 NA non-coding downstream 37422 15401446 ~ 15401762 (+)
G133342 NA non-coding downstream 61165 15425189 ~ 15426372 (+)
G133386 NA non-coding downstream 233384 15597408 ~ 15606339 (+)
LOC117597798 NA non-coding downstream 266429 15630453 ~ 15640958 (+)
G133617 NA non-coding downstream 607836 15971860 ~ 15972109 (+)
commd10 commd10 other upstream 375032 14940301 ~ 14982884 (+)
trnae-cuc_19 NA other upstream 378012 14979833 ~ 14979904 (+)
G132595 atoh1 other upstream 1034466 14322172 ~ 14323450 (+)
aopep c5h9orf3,cunh9orf3 other upstream 1335229 13949937 ~ 14022687 (+)
dock8 dock8 other upstream 1409108 13890404 ~ 13948808 (+)
srp19 srp19 other downstream 14918 15378942 ~ 15384824 (+)
G133631 smyd1b,fabp1,LOC108265070,LOC108430330,LOC103043953,LOC108430333,LOC107704576,LOC107579792,LOC107573351,LOC107712467,LOC107726869 other downstream 638037 16002061 ~ 16018818 (+)
si:ch211-166a6.5 LOC108265755,LOC107714554 other downstream 1038724 16402748 ~ 16419509 (+)
mtmr3 mtmr3,LOC107699659 other downstream 1216233 16580257 ~ 16621766 (+)
bicdl1 bicdl1,LOC107724381,LOC107699624 other downstream 1352109 16716133 ~ 16737984 (+)

Expression


Co-expression Network