tp53i11a (tp53i11,tp53i11a,LOC107687052,LOC108435353,LOC107671372)


Basic Information

Item Value
gene id tp53i11a
gene name tp53i11,tp53i11a,LOC107687052,LOC108435353,LOC107671372
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047605.1
NCBI id CM018551.1
chromosome length 26640196
location 1936826 ~ 1979679 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026930629.2
CCCGCTACAGCGTGCAGTACGGTAAGCGTTGCGCTCGTGCTGGATTGCCGTTTGCCAAAGTGTGGTGCTGCGATGTGAAAGATTTGCTCGCAACCCggggattgtgtgtgttttccttctGTCGTGGAAGTGCAAGAGTAAAGCCAAGTGGAGCGTCTACCTCTTCCTCTACGCCATGGCCTCCAAACCTCACCCTCCGCTCATGAAGAAGCACAGTCAGACTGACTTAGTGAGCCGCCTCAAGACTCGGAAAATCCTGGGTGTTGGAGGAGAGGACGATGATGGAGAAGTTCACAGATCAAAgATCAGTCAGATGTTGGGTAATGAAATAAAGTTTGCTGTACGAGAACCCATAGGCCTCAGACTCTGGATCTTCATCTCTGCAGTTCTGTTCACAGCTACGGCTTTAGTGGCCCTGGCTTTCCCCAATCAACTCTACGAGATCGTCTTTGAGCTCGCCACCACTAGGATCTCCATCAGACTCTATGGAGGAGCTCTTCTGAGTATCTCGTTAATCCTGTGGAACGGCCTCTACACGGCAGAGAAGGTCATCATTCAGTGGACTCTGCTCACTGAAGCGTGCTACCTGGGTGTACAGTTCCTAGTGACATCCGTCTCGCTCCTGGAGATGGGCACGCTGTCCAACGGAGCCgcgctcctcctcctcagtgACGCCGTCTTCCTCGTCATCACTCTGTCGTACTACAGTCAGCTCAGCCGTCGGCCCAAGAAGATCTGAGATGCACcggctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggggataaTACGAGTATAACACTGAGTGCACATTACAGGATTTGTCTTTCTTGACATGTTTACAAGATTAGTGACTCAGGTCACATGAAGgattttggtttattttgttattacacAAATTAATCTTGATGTTTATTGCATCTACGTGAATATTAGAAACATTCTCCGCTTGGATGGTCTGCACTCAGCATCACATATCCTCCACGCATTCACGCTCGCCACCTCGCTAAATTTAATAGTTCTGAACGGTTCATAATTTAGCTTCGGATTCTCAGAGCGAGCAGTATGGTAGCAATGTATCATGGCACTTATATAAGAtatagttatataatatatCACAGTATTTGGTTTTGATAGGAAAATACTACCAAAGATTGAGATTATGAagttcagagtttttttttacccatagtttataaaaaaattaaagtctATAACAAGGAAAAGGCACAAGAGTGAAATGTTCGGTACAAAAATTGAGATTTTAATGTTCAATCAGCTAGGTAGAGTAACAACAGAGTTATAAAACCACAAGGATCTCATAAAAGTTTATCACAATTCCTCCTTTATTCCTCCTCGTTTATTTGCAATGATTAAGGTTTCGTGTTTCTTAGCGGTTATTCTGCGTAAACTTAATTTAGCCGTAATTTAGTCGTCTGATGTGACAATGTTTTATTAACAGTAacttatgaataaaaaatagttCTAGATAAGTTAACCTTCTTAGAAATTTTCTGTGGTTTTTTCTGGAGTGATTACAGCTGTCCaggtcattttttaaaaggaatTTTTGGCTCTCGAGATCTCTACACTGGCTCTTCGGTCCCTCGGCTCCAAGCAAGATCTGTTTTTAGGATTAGCTCTTAAACACTAGACTCCTGGCCtacttctgcttctgcttcctCCAGCTGAGGGTTTCTGTACTATATGACACATAACCACATGAATTCAACTGATTTGAtgtcatttcacacacatgGATACATCACTAACCTAATATCACCGTTTATAGACAAGATTAcaacatgctttatttttttttaacgcatATGTCATTTGTCCAAAGTTTCATTTGTTGGTCATAGGGACGTAAACAGAATTATTCAAGACCCTGATTCACGTAGATGCAATAACAAGGCACAGCCTCCAGAAAGAAACACTTTATAAGCTCTCTGGACCGAAAAATGAGTCCCGTCCATCAATAGCAGCGCTTTATTGTACAATGTCGGTAGTTTGAGCACTTAGACTCTGAAGATTGCTTTTTGCGCTTCGTGTCTGAGCAAAACACAACACTGACCCTCCCACGTTCCAGAGTGATGACTAAAGTGTGTAGGAccaaatctgtgtgtgatttgCTCATCAAAGCACTTTGACTGTCCTGTAAAATCATCAACACCTCAATTTTATAGAAAACTAGTGGGATTATTTGGAAGAAGAGGAGTGAAGGAGTGAAATACGCCACAAACTCTTAGCTGAATTGCACCCAGTCAGTGGAAGAGGGGGCCAAAACTTACAGGAACTGTCTCAAAACACTTGGCTTCCTGAGAGAGATGAAACCAAGTATTAgggaagactttttttttttttccctccaaggAGCTTATGAGACTGAAATCAAATCAAAGCTTTAAGCTGTGCAATCAATTTTCAGACTGATGGTTCAtcacttccttttttcttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttaaataaattgcataatCCTGTACTGTGTGCTCAGTTTATTAAGGCTGTTTTTACACTTGgcctgtttatttttaactccAGGCACATGTTTGTCATGCTATCCCATGGGAATCAGCTGCTTTTAAAAGGAGCTGATGCTTctggggttttttgttttggttttttttgtcacactAGAGCTTCCACAAgttgaaaaaaattcagaagtgcttttttttttttaacttcctgaccaatcagatcacaagtTGAGgggcaagaaagaaaaacacaaatgacaACGTGCTGGTGGAAGTATTAGTTAGTGACTGAGTGGATATGAGGAGGTTAGGACGTGACGTCACGTTTGgtttctgcctccaaagctacagcgaagacaaacaacctcctcatctcCAGAGTTGCAGCAATCCTTATTCCATCTGATTACTGAGAATAATAAAATCTACAGAGCAAGCGAGGCCAGGCTAGGCTGAAAaggccaagtgtgaaagcagccttggAGAGTTTGGTTTGTGAAATGACTCAGCACAACATTCATGGTTTACTGTAGCTCTTCTATCAGGACCAAACAAAATCTGGTTTGTGTAGCACCTCGTCTCTCTTGACACTTTCACTTTTATCATGCGATGGCGTACAGATACAGAGTGATGAATTTGGGAATGCAGGGGAATTCCTGGTCAGGGCTTCTTCAGGTGTTTTCCTCAGCATGATCTCCTTTGTTAATGTTTGTGCACTGGGTAAAAGAGAAACTTTCCATTTTAGAGATTTATTTTTCGATAGTATGCTTCACTAGAAGTATGTATATAACAGATTAACTAAAGATGTACTGTTATCCAGCGTGTAGActtcagacctgccaacctgcGCCGCTTCCCCAgcaaagcgctatctgccctcttctgcatacatgaactcacactattggctagtgtcgctgtgattgacagggggggagagagtatgcccctcccatcCCGAGAGCACGTTTTGCTCTCCTGAACTCGTGgctatggatggctgtggcatcgtcgggATTTGAAATCGCGATCTCCGAACGACAGGgcgaacatttttctgttgcgCCGCTCGGGAGTCTGGAGCACCGCGTTTCAACATCAGAGTACGCTTTCCGCACTAAACCCCAGATGAGCCAATCAATaaatgaatctggaatgactgacagttgtgtAGGTGTTACTAACCCTCTAGAAACCCCGCCCCTTCCCTATTATCTTACATTCTCTGACTGTacatggagaatgttttgagttcattaacatgaaataaaatcttagctaacattagtgaagTATATAGCTAACATCAGTCACTATAATTATTAGGGATGACACTGAATATTTTCGTCCATTTtcatcaccattttttttttggctaacaGTGATTAAATATGTCAAATCTAACATGttacaaatcattttaatgctaATGATCATTAGGAAGTGatttaaatatgatgtttgCTGTCTTGCAGCAGTATTTAAACGTCGTGGTCAAACCTGTTACAATAATGTAGCTAtacagtgtttttgtgttaaCAACCAGGTGATTGAAGGAGGTCTGGTTTTAGTTAAGATGTAAACACTCAGAGttttacatacacactttattattaattgctgcacaaaacatgtttttcctAGAATAGTTTCTGCCTTAGACACGTGATTTACTCGACTACGCGTTATTCCTCTttaaggttggcaggtctgataTGTTGAAATGCCATTTACATTCGGAACAGATCTGTTATTATGGTGAAATTAATGACAGTTGTGGTAGTTTTAATGGAAAATAGCAAAATGTCGATTGTAGATCTGTTCTTGTAAACAATCACACTTTGACGCAGTTGAACAAGTTGATGCAGATCTAGTTTTAAAGCACAGTTTGTTAAAATAAGCTCAGAACGGTGTTACCGTACACAGAGTGCAGGTTCTGTATAGTTTGGAAATCATTGAATTATTTGTGAATGGAGCATTAAGTGCATTAACTACATTAATTGATGAGTATTAAGAGTGAGAACAGTTTGTACGTTTATTTTACCTGTATTAATTAGTAGGGATATTTGTGATTAACGTAGAGCACTGATCAGGATAGAGCTTTGATTTTCGAGGTgatataaacatgtaaacattttttttctggagatTGTGCTGCGTAGTCGTAGTGTAGCAGTACAAATGTAGCATTAAAGTAATCTATAAATATAACGGAAAGAAAAAGGTTTTACATTTGTGCTGTCCATTATGTCAAATTTAAtccacattaacattaacactttcTCAATTTCAGCCGCGTGTTGTAATTCTTCttatttatatcatttctacagtaacctGCTGCTCTTGGAGAATTAAGTGGTTTTTgactataattatataattaaatgttcTAGTTGACAGAGATGGGTGATTAAATGTTCTGCTCTTATTTTAGGTCAGTATAAACCGATACCTGTTTTATCCGGGCAAATTAAATGGT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>XM_026930631.2
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AAATGGTTATTGTTAATcagtttttttgcagtttttgttgtgtttcagcaactttttcttttttttttttacgatccATAGCCATGGTCAGTGAatgtattacttttttaaaaatcacatgactTTTATCAAGGttgttatggttattatttagttatcatAAGAAAGGAGTTAAATCTCAGTAACTAAAACCaagtacaaataatgttaacttTAATCAAAGTACAATTTTAATAACCAGGACGTGTTTCACTGTGTTTCAAATCTAcatctgtgtgtgaatgaaaatcaaataaattagCATGATGGTACATATTTGCATTATTGTTCTTAAAATGAAATCTCTCCTGTGATCATAAAGGAAATGACTTTTCTCTGGCTGCAAAAATAGTTTGAGCTGTAGTATCCAAAAATTTTACCATGATTTCACCATATTTTCAGTTCTAAACACAACTTCTGGGTTATTGTGTGTTGAATTTGTGTTGTACAGTTGCTTTGCACGGTGACTTTTAGCGTCTTGAGCACAGTGTGCTTTCACAAAAACGACACGGCCGTTACTCTGCCTCTTTACTCCtgattgtgttgtgtgttttgtttcgaAAAACTATGTACATATGAGCATACCTAGAGTTCTGTATATACTTTTGTAGCAAGAATGTGAAGTGCTTCAGAAATAAAGATACAGTTTTGCAAATGCC

Function

symbol description
tp53i11a Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TP53I11 (tumor protein p53 inducible protein 11).
tp53i11 Predicted to be involved in negative regulation of cell population proliferation. Predicted to be integral component of membrane.

NR:

description
PREDICTED: tumor protein p53-inducible protein 11-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026930629.2 False 5691 mRNA 0.39 7 1936826 1979679
XM_026930631.2 True 5698 mRNA 0.39 7 1936826 1962624

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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rps13 rps13,LOC107586033,LOC107700620,LOC106561079 coding downstream 283348 1647120 ~ 1653478 (-)
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hnf4b LOC108271394,LOC108429112 coding upstream 321942 2301621 ~ 2316135 (-)
dhx38 dhx38,LOC106562086,LOC106587179 coding upstream 996780 2976459 ~ 2997108 (-)
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G174617 NA non-coding upstream 14422 1994101 ~ 1995636 (-)
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G174247 fbxo22 other downstream 877592 1057656 ~ 1059234 (-)
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G174207 LOC108270943,LOC108444425 other downstream 973748 961496 ~ 963078 (-)
calca calca,LOC108271361,LOC107700617,LOC107593372,LOC107688176,LOC107750650,LOC107586036 other downstream 1902660 30281 ~ 34166 (-)
LOC113536731 hsbp1b,hsbp1a,LOC108271362,LOC103023435,LOC108429110,LOC107553992,LOC107583924,LOC107561694 other upstream 35043 2014722 ~ 2022231 (-)
G175098 NA other upstream 622735 2602414 ~ 2603211 (-)
G175048 zfhx3,LOC107679901,LOC107565374,LOC107738341 other upstream 774676 2754355 ~ 2756525 (-)
serf2 NA other upstream 1570186 3549865 ~ 3581987 (-)
G175497 NA other upstream 1589662 3569341 ~ 3572262 (-)

Expression


Co-expression Network