XLOC_000567



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_000567
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 45383604 ~ 45398821 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00003122
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00003122 True 15218 lncRNA 0.37 1 45383604 45398821

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_000566 si:ch211-243a20.3 coding upstream 17182 45351890 ~ 45366422 (+)
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XLOC_000563 AL953855.1 coding upstream 212952 45170046 ~ 45170652 (+)
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XLOC_000571 si:ch211-214c7.4 coding downstream 308398 45707219 ~ 45744854 (+)
XLOC_000572 pkn1a coding downstream 356047 45754868 ~ 45836167 (+)
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XLOC_000557 CU929294.2 non-coding upstream 410678 44968462 ~ 44972926 (+)
XLOC_000552 NA non-coding upstream 547866 44826320 ~ 44835738 (+)
XLOC_000545 NA non-coding upstream 729636 44647908 ~ 44653968 (+)
XLOC_000573 BX511120.1 non-coding downstream 369595 45768416 ~ 45768530 (+)
XLOC_000575 NA non-coding downstream 468219 45867040 ~ 45869497 (+)
XLOC_000579 NA non-coding downstream 633899 46032720 ~ 46153200 (+)
XLOC_000581 NA non-coding downstream 818682 46217503 ~ 46219161 (+)

Expression



Co-expression Network