AMCG00014811



Basic Information


Item Value
gene id AMCG00014811
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030128.1
NCBI id CM030128.1
chromosome length 42883965
location 31939553 ~ 31962971 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence


>AMCG00014811
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>TU91238
tatataatatgcaAACTAAACTGGTTAAACTTACTAACCTCACTTATTTTCAGTATGAGGTGTTAGACACCTTTCAGTACTGCAGCAAATGTCATGGACAGCTTAGTCATGTCAAATAATCTCACTGAGTTAACAGGACAGCTGCCAAACTGTGGCAGTTGAAGAGGCTTTCTAACAGCCATCCAGAACACAAAGTACAGTGGAGAAATGAGTGAGTGAAGCACTCTTATCATAGTTTAGTTCAGCAAAAGCTCTTGCTTGTTTGAACTGGGTTGCTGGGTGTTTATGTTCAACCGCATGTAAATACTGGAGTCAATTAGAAAACCTgtatgatttcagtattttacaaaGGCTGCAGAGTTGTTGGGTCCCATCCATATTGTCACTGGTGGTTCTTTgtaaagttttgttttcctttcatatgTAAAATCCTCTGTGTTTTGCAGAAGTGAGCAAACCTGTTTCCTTTATCATTTTCTTTACTGCTTTAATTTCTTCCTAACTCTTTCTTGTTGCCTTTTGGTTCCTGTGACATTTAATGGCAATTGATGcagcaaacatttgtttttttaacagaggTATCTTTTCCACTAGCTTGCTGCTAATGCAGAGACTgtggaatgtatttttcacactAGTGCTCATAAAGTTCTAGTGTTCCAAAGCAATCTTACTTTTCAGTGCAATTAATGACGTCCCCCCCCCCTCAAATAGTACTTTTATCACCAGCATTAATTGGCTTAATATCTGACTTTGGAAAAGGCCTAAAACCAGAAATGTAGTCAGTTTCTGTACTAGTACTAAACTGTTTTGCATGTGCAAGGAGGGTTGTCAAATATTgtcctttttaaatgcattaatgttgctctttaaaatgatttgcagtaTTTAGCAACTGTAGGGTTATTGTTATACAATGAAGTAGTAAGACATCAGATTTGCTTAGTTTGCGCGCTGCCATTATTTCCAATGGGATGTAAGAAAATTAGATGCTAAGAGCTGCTACTGCTCACTACCCAAAAGGAATCAAGTCTCCTATCACGCATCCTCCTGGTTGATGAGGAACCTCTTCCCAAGCCAATTTAAAATCTGTTGCATCTTTGTGGTTAACTGCCtctaaatacattgtttttaacccaaacttattttgaatacttagtttttaaaattgtacagaGAATCAGACCGTGTATcagttaaaattgtattgtggTTAATTGTTACAATTTATAATTCTGATTTGTGCCAAGGCTCACAGATATTCTGTAATTAGCAGCCATGGGTGATTCGCCGgatctttttaaattttctcATACAGCAGCATTGTTATTCTTGCACTTATCAACTTACTGTAACTGCTTCTGTACTCTTGATAATTATGCTTGCTCTGACACCAATGCCTGCAGTACTGATACAACTACTGCTCTATATTTTATACTTATGtgtcatgtttttgtgaaaagtgtagatTTACAGTTGTCGCAGTGTCTCCCTGGGTGAGGTTGTCTACTAAGATAATAGTATGCTTTATATTGGAAGCGGTTTCATATTGCACTTTCAGCAATGCTGTCCACTTACATTGAGCAAGTAGTAGGAAGATTTGATAATGGACCAACTGTACATTTAAGTTAACTTGAATTGGGATATATCTGAGTGACTAATATTGGTGCTATATAAGGGCACAACTTGGCAAGCTTAACCATTATCAATTCAGTGTGTTGGCTTGTGTTCCTCCAGCATTGTGCCAAACCAATATCCAAGATGCTTTCTGACTTACAGGCAAGCAGTGCAGTGACCTTCTCCAGCTTGTCCACTCTGTCACCAAATATCTTTCAACACTCCCTTGATCTGTCACAGCTGATTGCCCCAATTACTGGGAAGGTTTTCAGTCCTGAGAGATGTCCCAGACAGTCAGATTTGTTAACGAAAAGAGCTGATCGTGGcccattgtttatttttaaatggtgtgttgcaatttagttaaatatactaaacatttaaaagttaatttgaaaattgaaatatatcATGAATGTCATTGAACAAAATACCATTGCAATTCTGAATTAACTTTGCAATTCTGTCTGGAATCCTATTGAGCCCCGGAGAAACCTTTCACTGATCTGTGATTCTAACAATTTTTGAAGATGACCAACAACAATCTTCTGAACAGCCCCTGCATTTGGCAGCCTGTGCATTTTCTTTGGCTCCAACTATTTTGTCTACTATATGGGTTTGACACTATACTTATAAGTAAACTAAACccccaaatattgatttattagaTGTTTATATGATTTACTAAGGACAGCTTTTGTCACTTTACTCTAATGATGGTAAATATTGAGCCAGCTGTATCACAGCTCCTGGGACTCAGGTTCGTGTAGGGCATGTAGGGAGTGTGCCTCTTCTCCCCTTGTCCATGTGGCTTTACTCTGGGAGGCCTCTGCTTTCgtcccacatcccaaagacatgctaCTTAATTTGATTGGCTACTCAAAATTACGGTGTAGTCGCTTTTAGTGTGGTGTATGTGTATGTCCCTGTGTGTGCTTCTCTGCAATGGTTGTGTCCTGTCCAGGATGAACATGACCCTGTGATCATCAGGTTAGGTTCTGGTTCACTGTGACTTTATAATGGATCGATGGGAGCTTAGACTCAATTTTGTGAACATTACAGTCTTAGTGTTTATCTGATATGTTTCCTAAATGAAGCCTGCCATTTAAAGAGATCTGGTGTTTATAGTTATTATATCCATGAGTATTGGAACCATCTATTTGAGACCCTGATATCTCTCTATTTGATAGTGTGTGTGGTGTAGGTTGATAGTATTTCAATGCTTCATGTGGgacaaatatataacttttttttaattttaattattgatcattattttaatgaaaagtatacatttatgaatttattcAGAGTGTATTGAATACTGATTCAGCCTATCGAATTCTGTCAAGAATTTCCACAGAAAACAGTGCCAGCCCTACATTTACACAACCTCTATAGTCCAGTCAACTGGcatctttaaaatattgtactttCTGATAACTTTTGAGTATAAAGTTTCTGCTTTGATAAGTCTAGTGTAACTTTAATTATAATGAGGTCTTCCAGATCTTTGCAGAAGTGTGTGATTCCCCTGGTTTGCTCCAATTACAACTTTAAATAACTCACGGGCACCCATCGCCTTATGGTCTGTTTACGTTTACACAGAAAATACGGAAGCTTGTTAGGATCAAGAACAGGCAGCCAACTCTTCTGGAGGCCATTCGAAGGAAGCGGATCCAGGAACTCAAAGTGGGGCGGCCTCTCGGTCGGCGTGTCTCCGCAGTGGCCTCCCACACCTGCGCCGAATGTAAAGTTGCCTACAAAAACTGTGACGCTCTCATCATGCACAAAATCAGACACATTAAAGGAAAGCACTGGCCTTGCCCGTTGTGTAGCAAATCCTTCTTCAGGCAGAGAAATGTGCAAAACCACATACGCATGCATGACCAGAAACTCTACAAGTGCCGGCACTGCATCACATAGAACAATCCCAGGAAGGACTGGACATCTTCTAAAATGTAAGGTTTGTGTTGCTTGATGGGGTTGTGTTTGGGATTCCCAGAGAAGGTTAAGAATTTAATTCTATCTGGATTCTGTAGTTTTAAATCTTTAGttatgctgtatttttaaattattttttataaaagcaCTATACACAAAAGTTATCTACAGAGCGTGTAGAAATCATGTTCTGGAAATCCCTGAAATATAACACAAGTGATCACTTCTGAGCACAACCAGTGTCATTGTTTACAATTTGCAGCACTTGAAGACATCCATTTCAATAGATATAGCATACCAGATCTGAACATTATAAAATGCTAAATTGACTAGAACAGATCTTTAATGCATATAATTTCATGGATGAAGCACACTGTATTAAGGTTTTGTAGTCATGCTCTACGTTGGAAATAGATACAATAAGTGTTCTTCATTATATGTCCTATGGGCCCAAAGCATCCTTTGGGAATCCAATTAGTTGCCCCCAGTTatcattgtatatatttacagaaataaatgacaTACATCATTGTGTTTGGTGTCTCTGAACTGAGCAATCTTAGGAGAGcgagaacattttaaatatgtgcacCATCAGCAGATCGTTGgtgtctttggaaatgttccatgttttcttttcattgatgCTGTTAACATCTCTTGCTTCGGTTCTTGAACTGTGTGGATTGTTTCTGGGGTTTTctttagaaaaaacatttccagaaGTCATCACACAGGTTCATATCTGGAGAGTACTGTGGCCAGCAGCATCCATACCCAAAAGATGCAGGATATCAACTAGATAAAACTTGGTTGTTAAAATGCTTATGCCATCTTGCTAGGGACAGTCAATTTTCCCAAGCCTCCTGTGTAGTGTGACAACAAATGCAATGATATGTGTCATGTGTCTTGGTACATCTATACAATTAAAGCGAGCATCGTTTTGGaaaggcactgtatatttttcttttttaaccaaATCCTAGGAGCCTCATTACAGGGTTATACAAGTGGTTTCAGTTTGCCTCCATGTCTGTCCTGGGGGAGTTGATTCAGTTCTGGATTGGGTGATAAAGATATTCAGGAATGTACTGGGGATGAACAAAGAttaaaaccaataaatacataacgaAACAAAAAATCCTGGTGATTGGATATTCCATTCACACAAGGACACCATGACAGATCATTTTGCTGTCCATCTGTTGAAAACACGAACACTTATTTTGTGGTTTTTAACTTCTCTCAACCTCTTGTGATAGTTATACCACCCCTAGGATCCAGGACCTTTTAACTCAAGATGATTACATTCATTGCACAATTGACTACTCATTGCATACCTAATACTAAAACATATTGCAAGAAAATgcatatgaattaaaaaaacaaacgtctttttttttttttttttccaggaggACCGCAGCCTGGAATGTTTG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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome
ko04214 Apoptosis - fly

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00014811 False 5240 mRNA 0.45 7 31939553 31962971
TU91238 True 5732 lncRNA 0.36 2 31956252 31962969

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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AMCG00014807 NA coding upstream 49105 31865131 ~ 31890448 (+)
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AMCG00014812 NA coding downstream 279983 32242954 ~ 32255291 (+)
AMCG00014815 gja8,LOC107746070,LOC107566528,LOC107566539,LOC107603011,LOC107746288,LOC107676899 coding downstream 433716 32396687 ~ 32397508 (+)
AMCG00014817 taf6 coding downstream 690772 32653743 ~ 32663154 (+)
AMCG00014821 LOC107738524 coding downstream 771897 32734868 ~ 32756137 (+)
G72926 NA non-coding upstream 192653 31745523 ~ 31746900 (+)
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G73018 NA non-coding downstream 4385 31967356 ~ 31969205 (+)
G73019 NA non-coding downstream 9014 31971985 ~ 31995538 (+)
G73045 NA non-coding downstream 293038 32256009 ~ 32256776 (+)
G73105 NA non-coding downstream 595310 32558281 ~ 32564339 (+)
AMCG00014799 NA other upstream 141090 31790901 ~ 31798463 (+)
G72925 NA other upstream 184623 31717118 ~ 31754930 (+)
AMCG00014793 NA other upstream 416366 31512808 ~ 31523187 (+)
AMCG00014786 nhlh2,LOC106574539,LOC107739819,LOC105019883 other upstream 791676 31143423 ~ 31147877 (+)
G72787 NA other upstream 943190 30990063 ~ 30996363 (+)
G73103 NA other downstream 579539 32542510 ~ 32561489 (+)
G73244 NA other downstream 1401784 33364755 ~ 33366100 (+)
G73292 LOC100846954 other downstream 2275963 34238934 ~ 34239400 (+)
G73329 NA other downstream 2817151 34780122 ~ 34780590 (+)
G73343 NA other downstream 2979040 34942011 ~ 34960447 (+)

Expression



Co-expression Network