G68649


Basic Information

Item Value
gene id G68649
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030128.1
NCBI id CM030128.1
chromosome length 42883965
location 6073717 ~ 6110306 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU85780
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>TU85783
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>TU85785
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>TU85786
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>TU85787
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>TU85789
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU85780 True 2255 lncRNA 0.42 2 6107041 6110306
TU85783 False 2057 lncRNA 0.41 3 6107041 6110306
TU85785 False 2107 lncRNA 0.41 3 6107041 6110306
TU85786 False 2133 lncRNA 0.41 3 6107041 6110306
TU85787 False 821 lncRNA 0.45 4 6073717 6110306
TU85789 False 2013 lncRNA 0.41 3 6107041 6110306

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00014237 NA coding upstream 19282 6033437 ~ 6054435 (+)
AMCG00014229 sept10,LOC105911973,LOC107697805,LOC108430022,LOC103039444 coding upstream 194460 5866905 ~ 5879257 (+)
AMCG00014224 NA coding upstream 298956 5755529 ~ 5774761 (+)
AMCG00014225 NA coding upstream 333796 5721897 ~ 5739921 (+)
AMCG00014223 NA coding upstream 430228 5607773 ~ 5643489 (+)
AMCG00014243 NA coding downstream 124497 6234803 ~ 6239921 (+)
AMCG00014253 NA coding downstream 621318 6731624 ~ 6732517 (+)
AMCG00014259 NA coding downstream 929448 7039754 ~ 7046875 (+)
AMCG00014260 LOC107688668 coding downstream 940030 7050336 ~ 7054907 (+)
AMCG00014261 NA coding downstream 963018 7073324 ~ 7073602 (+)
G68637 NA non-coding upstream 17370 6054535 ~ 6056347 (+)
G68635 NA non-coding upstream 60658 6012682 ~ 6013059 (+)
G68623 NA non-coding upstream 117532 5897070 ~ 5956185 (+)
G68589 NA non-coding upstream 291331 5779378 ~ 5782386 (+)
G68559 NA non-coding upstream 369708 5657250 ~ 5704009 (+)
G68665 NA non-coding downstream 2350 6112656 ~ 6114964 (+)
G68686 LOC106586545,LOC106582186 non-coding downstream 93872 6204178 ~ 6206576 (+)
G68698 NA non-coding downstream 134596 6244902 ~ 6247049 (+)
G68728 NA non-coding downstream 602865 6713171 ~ 6714821 (+)
G68738 NA non-coding downstream 633557 6743863 ~ 6744111 (+)
G68475 NA other upstream 1421753 4649200 ~ 4651964 (+)
AMCG00014196 NA other upstream 1941999 4127476 ~ 4131718 (+)
AMCG00014146 NA other upstream 3363388 2706840 ~ 2710329 (+)
G67896 NA other upstream 3943572 2126872 ~ 2130145 (+)
AMCG00014111 NA other upstream 4171030 1900220 ~ 1902687 (+)
G68830 NA other downstream 1235889 7346195 ~ 7349467 (+)
G68848 NA other downstream 1303334 7413640 ~ 7416594 (+)
AMCG00014272 tbc1d23 other downstream 1354197 7464503 ~ 7482560 (+)
G69406 tgfbrap1,LOC102780916 other downstream 3892752 10003058 ~ 10008648 (+)
AMCG00014345 NA other downstream 4037673 10147979 ~ 10151913 (+)

Expression


Co-expression Network