opcml (opcml,LOC107746995,LOC107588660,LOC107686109,LOC107691701,LOC107751394,LOC107577150)


Basic Information

Item Value
gene id opcml
gene name opcml,LOC107746995,LOC107588660,LOC107686109,LOC107691701,LOC107751394,LOC107577150
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056708.1
NCBI id CM032077.1
chromosome length 16503406
location 12065931 ~ 12186096 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043249818.1
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>XM_043249820.1
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Function

symbol description
opcml Is expressed in nervous system. Human ortholog(s) of this gene implicated in ovarian cancer. Orthologous to human OPCML (opioid binding protein/cell adhesion molecule like).

NR:

description
PREDICTED: opioid-binding protein/cell adhesion molecule-like

GO: NA

KEGG:

id description
K06773 OPCML, OBCAM; opioid binding protein/cell adhesion molecule-like

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043249818.1 True 5522 mRNA 0.41 7 12065931 12128903
XM_043249820.1 False 5166 mRNA 0.40 8 12065931 12186096

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
lim2.1 lim2.1,LOC107579014,LOC107589671,LOC105028969,LOC105900331 coding downstream 278258 11786410 ~ 11787673 (-)
bsx bsx,LOC107747047,LOC107589660,LOC107751411,LOC107579003 coding downstream 281778 11781496 ~ 11784153 (-)
zpr1 zpr1,LOC107693980,LOC107747003,LOC107751399 coding downstream 311730 11749965 ~ 11754201 (-)
LOC122352762 hist2h2l,zgc:194989,LOC107719244,LOC108277172,LOC107667924,LOC103356012,LOC107574861 coding downstream 317874 11747207 ~ 11748057 (-)
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LOC122352422 pknox2,LOC107686111,LOC107691639,LOC107747045,LOC107686209,LOC107751409 coding upstream 30994 12217090 ~ 12283587 (-)
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dgat2 dgat2,LOC107746984 coding upstream 585330 12771426 ~ 12779789 (-)
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G76662 cblb,LOC107548831,LOC107699267,LOC107576804,LOC107693962,LOC107747038 non-coding downstream 830241 11234372 ~ 11235690 (-)
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G76912 NA non-coding upstream 492271 12678367 ~ 12678625 (-)
G77135 ppm1e,LOC107728886,LOC107686131,LOC107588822,LOC107734442,LOC107691656,LOC107577402 non-coding upstream 610568 12796664 ~ 12880735 (-)
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LOC122352715 LOC107693960,LOC107747020,LOC107744618,LOC107699265 other downstream 858679 11176569 ~ 11207252 (-)
G76625 NA other downstream 1027200 11017110 ~ 11038731 (-)
rps6kb1a rps6kb1a,LOC107747022,LOC107548877,LOC107744622,LOC107699259,LOC107693887 other downstream 1082193 10972881 ~ 10983738 (-)
G76498 NA other downstream 1585742 10478059 ~ 10480189 (-)
uvrag uvrag,LOC107691651,LOC107577365,LOC107686127,LOC107751378,LOC107589407 other upstream 492894 12678990 ~ 12769417 (-)
mogat2 mogat2,LOC107751377,LOC107691703,LOC107747029,LOC107686211,LOC107589716,LOC107579037 other upstream 596257 12782353 ~ 12789095 (-)
dclk1a dclk1a,dclk1,LOC107588999,LOC107728871,LOC107577778 other upstream 1306177 13492273 ~ 13533064 (-)
sparta spg20,LOC107728829,LOC107589828,LOC107577790,LOC107697408 other upstream 1352060 13538156 ~ 13543615 (-)
ypel2a LOC106603438,LOC106931471,LOC106940241,LOC101067200,LOC107659943 other upstream 1457088 13643184 ~ 13654413 (-)

Expression


Co-expression Network