rxrbb (rxrbb,rxrba,LOC107596638,LOC107581542,LOC107752838,LOC107743171,LOC107566635)


Basic Information

Item Value
gene id rxrbb
gene name rxrbb,rxrba,LOC107596638,LOC107581542,LOC107752838,LOC107743171,LOC107566635
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056714.1
NCBI id CM032083.1
chromosome length 28146790
location 12363785 ~ 12378449 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
rxrbb Enables DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific. Involved in negative regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of RNA polymerase II transcription regulator complex. Is expressed in blastoderm; ovary; and testis. Orthologous to human RXRB (retinoid X receptor beta).
rxrba Contributes to DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific. Involved in regulation of transcription, DNA-templated. Acts upstream of or within negative regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of RNA polymerase II transcription regulator complex. Is expressed in several structures, including blastoderm; digestive system; eye; gonad; and tail bud. Orthologous to human RXRB (retinoid X receptor beta).

NR:

description
PREDICTED: retinoic acid receptor RXR-beta-A-like isoform X1

GO:

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KEGG:

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setd2 LOC107743179,LOC107685560,LOC107752833,LOC107673014,LOC107581536,LOC107596709 coding upstream 199412 12577861 ~ 12599994 (-)
LOC122361014 mtbp,LOC107596625,LOC107685571,LOC107707175,LOC107673040 coding upstream 427779 12806228 ~ 12825561 (-)
G111716 NA non-coding downstream 212908 12150542 ~ 12150877 (-)
G111713 NA non-coding downstream 224255 12139177 ~ 12139530 (-)
G111712 NA non-coding downstream 226013 12137461 ~ 12137772 (-)
G111690 NA non-coding downstream 282932 12080652 ~ 12080853 (-)
G111689 NA non-coding downstream 286778 12076453 ~ 12077007 (-)
G111788 NA non-coding upstream 58976 12437425 ~ 12439653 (-)
G111789 LOC107662667,LOC107752837,LOC107581613,LOC107581612 non-coding upstream 61337 12439786 ~ 12440874 (-)
G111791 NA non-coding upstream 63504 12441953 ~ 12442613 (-)
G111806 NA non-coding upstream 100985 12479434 ~ 12479788 (-)
G111807 si:ch211-257p13.3,LOC107752836,LOC107581541,LOC107685558,LOC107596636,LOC107673049,LOC107743172 non-coding upstream 102275 12480724 ~ 12480975 (-)
LOC122361049 c16h2orf66,LOC107743229 other downstream 496470 11865680 ~ 11867315 (-)
G111490 si:dkey-12j5.1,LOC107738871,LOC107549224,LOC107689883,LOC107717803,LOC108256403,LOC108426361,LOC107593733 other downstream 952008 11410678 ~ 11411777 (-)
LOC122360600 enpp2,LOC107757440,LOC107745056,LOC107697648,LOC107574906,LOC107681346 other downstream 976792 11333175 ~ 11386993 (-)
G111450 mal2,LOC107757438,LOC107571097,LOC107677950,LOC107738940 other downstream 1077353 11269620 ~ 11286432 (-)
LOC122360812 cobl,LOC107746964,LOC107684220,LOC107551210 other downstream 1480361 10857520 ~ 10883424 (-)
zgc:92606 zgc:92606,LOC107724707,LOC107549485,LOC107598403,LOC107672985,LOC107744286,LOC108432344 other upstream 1275611 13654060 ~ 13683909 (-)
G112478 NA other upstream 1856105 14234554 ~ 14301619 (-)
dicp3.3 NA other upstream 2119814 14498263 ~ 14503136 (-)
LOC122359961 riiad1 other upstream 2204030 14582479 ~ 14587869 (-)
si:ch211-105c13.3 si:ch211-105c13.3,LOC107673711,LOC107594941,LOC107582067,LOC107677027,LOC107735771 other upstream 2520733 14899182 ~ 14904907 (-)

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