LOC122362588


Basic Information

Item Value
gene id LOC122362588
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056716.1
NCBI id CM032085.1
chromosome length 26409628
location 15035383 ~ 15047893 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU186722
CGCGCACAGAGCAGAGACGGAGACGCGAGTTCACGTCAACATCAGCGGCTACGAGCAGGAGAGCATGGAGCTATCACTGATGGCAGCCCAGCATTTGCAAGCGGTCAGTGGGGCCTTCATGGATTCTCCTTACAACGGCAACGCGTCTCTTCAGACGTCCACATCCAACCTCAACACCAGCTTCTCCAGACCGGCGGAGCAGGACGAGGAGGGCAAGTTCTCCAGCGACGCCATCTGGCTGTGGGTGGCTGTCATTGCAACCATCGGCAACATTGTGGTGGTAGCGGTGGTGTGCGCCTGTGCCTTTTAGACCCCGTAGTCTGCAAGAACACCGCCTGAACTCCTGACCCCTCACCCACCTGCACTTAGCACACTTTGTAGTATGCAAGCGACACCCTCCTTCCTCCGTCCTTCAAAAACGGCCCCTGTGAGTGCATTTAAAGGCAGTCTATCGATTCCTGTTTTATTAGCACTTTATCTGTTAAATAACAGCTCAGTTTATTTGGTTTGCTTGGTTATATAAGTCAGCATTACACAACATCTGTCAACTGATGATTAACACGATCGACCAAATCTATGGGACacgtgtgcgtgtttgtgtgagtCGGTTCTCGCTAAATCAGACAGATGGTGGTTGTCTGACGGTCGACGCATTTAGCATGATTTAACTCGGCTTCTGGTCATTCTGCCCAGTTCTCTCCGCTTCTGCCTTTTCTGGTGGAGTCCACATAGTTTTTGTCTATTTAGCGGCGATATAGCACCAACACGTGATGCATGACGACATATATTAGCTGCAAGTGTGAGAATGTGTCCAAAATAGTGCATTTAACTGAGAGAAATGACCGATGCACTGACCATGAGGTTTTAAGTGTGCAGCTCAGGATTTTCTCTAAACccacactgaaaaataaattccCTAAAATTTACGGTAAAAAACTAGCAGCTGTGGTTGACGAAATTCTACGGTAAAAAAATGCGGTAACACCGTTTTTGGTTTTACGttcaatttacagttaaatatcatcattttattaattgatataatgttaatataccgaCCTATTAAAGTAGTGAAGTCTGAACCAAAGCCCagcacaagcagcttttaaataataacatatacagAAGGAGTTACTAAGCACCATCACGGTGAGCCTCATTAAAACTGaaacatgcaataaacattaatttaacaacattagatatAACATACAATCCAAATAAACATGACTTTtaagaaaactaaaaagaaacatagtgaatttaaaaaaaaaaaacatcaaattgaaataaaatttgaaatgcagtgCAGGGAATTCTGAGAATGTGAATTCCGGGTTTTCCCTGTAACTTTTACGGGAATTTACCGTTAACTATTTAACAAGTTTTTGCTGTGGCATTTTCACAGGTTTTGCAGGAAATGAAAAAGATGTTGGCCTCACTGGACGCAGGGTCtaaatttgttcaaattaatgaaataattaggatcgtaaactaaaaatatcacaGTGGCATGCATAGAATACCCCAGTAATTAcgctaaaatatataaaaatatattcggtttacaaaatattcataaaacgAACAAGAACAAAGAAAATCTTCATTATTATACATCATTTTTGTAGCGCACATAGGCTGATAGTTTTCTTTTATCCATTCTAAAAGCATTCTTTTTTCAATTCCATCTACTCATTTTCTTATTCATTCACTTATCAGTTTTTGTGCTGCTTTAGTAAATCATAATACTAACCAATTACCGGTTCAGAAGCCCACGCTCTCCCTTATAGCTGGGTGTGTTTAACACAGTCTcttgtgttgttaaaagaaACATCATTGTGATAATATTAGTGCTTGAATCTCCCCGAATACCTTCTTCTGTGGGTTACAGACATGCCAGCTCATTAATTCAATCAAAGCTCGTTTTTCAAAGCCcaaaagtcttttatttttgtactgttgaCGGTCCACAGAGTTACTAACGGTCCGCCGGATCTCTGAACCGAGACGTGACCTCAGTTCCTGTGCAGTTAACCAGAGCGTGCAGGAGAGCTTCAGGTTCAGAGGTTAAAACACTTTCAGCATGCGGTCgctctttattattaaaacgcGGGTGAACTCGTGGGTTTCGGTTCAGGGTTGATGTTGTGTGAACTCTGACAGCATAAACCCTCTTGCACGATGTTGCCTCAGGGTCTCGGCAAACACACAGATGAATATAGAATgggaataatatttaataatgatgtGATGAGATTAAGTAAAccggtgaaaaaaaaaaaaaaagaaagctgtttCTCAGCCTCTATATGAAGGATGCGCGTTTTTCGTGCTACAGAAAACGGAAAAAGATCATGAATAATGTCTGTtagtgaatgtttttatttatgaataacaATACATGTTACATTATGGAATGGATATGGATGAAAAGAATGCTCTTTTATCGTAATATGTGAGCATATACAGTACAATATATAAAccgttcagatgcaaaagcgtCATCTGAATttttagtatgtttatcagGCTCCTGTGTGCAGGTTCAGTCATTTGAAAAAGAACCTATTTATTGCCATGAAAGCTTAAATGACTGAACCTACGCACAAAGCgctcattttaaatgaagatttcaaatgcaaaatatatttaacccCAAAATATTTTGGGTTAAGGAATTAAAGGCTGTCTCTAAATGTCAGATTTAGTTGCTCGCGATCTCCTTCAGGAGTTTGGCAGCGGGGCTGTGCTGTTTTTCTGGCCGTGGTTTGATCTCAGAAATGTGGCACAGCCCGGTTTAACTCGGTTTGTGTGCTTGGCTCCGGAGTCAGTGGAGACATAGGTGCCCATCACACACTCATCAACACCACGACGTGCCTTAAAGTGCATACAGCCGAGCCGGAGGGGAAAGATCCGTCTCGTCTGGAGATtgaaaaagatgcatgtttCGGCCTGAAGGACGTTCGCGTTAAAGCGTATTTTCTGGAGAATGAAACGCTTTAAGACGCTTCGTTTGCCTCAGAAGACACAGAAGTGGACGGCCTTCGAATGACTTTGATTGGCAAGCACTGGAGAAATCATGACCTTAAACCTTTAATGCGCTCTGCGTGTCTGCAGATGTTAGGAGTagaatgaatctgtgtttttttccctcgtATTTCGCAGCTGAATCACAAAATGCGTTCCGTAGTTTGGTCACGTGtgggaaaaacatttttaatgtttaaatatttaaatgataaaaatgatcatATGCATCTAATTGTGGACAGTGgttgatgcattaaaaacaagtgCGTAGTTGatgaaatgtgtaaatgtattgtatataaatgGAGGAAATGCACTTTATTCTCAATATAGCGTACGTATGCGTGCGTGCATATGAAGGGATATGAATGAAGCGATCTGTAATTTATGAGCGAGTATCACGGGACGCTCACCTGACTCCAGCACAATACACCGCTGCTAAAAACTCCAAGCAGTTAATCTTCACACGTTCTACCGCTCGACGTATCAAATGAAACCGTGGAAACATGTGCATATTCTTCTATTGCTTAAAAAATAGCAGCCTAAACCGCACAGGATGGCATCGATGTAACCGTTTGGATCATATAAAAACAACGTGTCAGAATGTGTCTCATTCATCtcttcacaaaacattaaa
>XM_043264122.1
CAGAGCAGAGACGGAGACGCGAGTTCACGTCAACATCAGCGGCTACGAGCAGGAGAGCATGGAGCTATCACTGATGGCAGCCCAGCATTTGCAAGCGGTCAGTGGGGCCTTCATGGATTCTCCTTACAACGGCAACGCGTCTCTTCAGACGTCCACATCCAACCTCAACACCAGCTTCTCCAGACCGGCGGAGCAGGACGAGGAGGGCAAGTTCTCCAGCGACGCCATCTGGCTGTGGGTGGCTGTCATTGCAACCATCGGCAACATTGTGGTGGTAGCGGTGGTGTGCGCCTGTGCCTTTTAGACCCCGTAGTCTGCAAGAACACCGCCTGAACTCCTGACCCCTCACCCACCTGCACTTAGCACACTTTGTAGTATGCAAGCGACACCCTCCTTCCTCCGTCCTTCAAAAACGGCCCCTGTGAGTGCATTTAAAGGCAGTCTATCGATTCCTGTTTTATTAGCACTTTATCTGTTAAATAACAGCTCAGTTTATTTGGTTTGCTTGGTTATATAAGTCAGCATTACACAACATCTGTCAACTGATGATTAACACGATCGACCAAATCTATGGGACacgtgtgcgtgtttgtgtgagtCGGTTCTCGCTAAATCAGACAGATGGTGGTTGTCTGACGGTCGACGCATTTAGCATGATTTAACTCGGCTTCTGGTCATTCTGCCCAGTTCTCTCCGCTTCTGCCTTTTCTGGTGGAGTCCACATAGTTTTTGTCTATTTAGCGGCGATATAGCACCAACACGTGATGCATGACGACATATATTAGCTGCAAGTGTGAGAATGTGTCCAAAATAGTGCATTTAACTGAGAGAAATGACCGATGCACTGACCATGAGGTTTTAAGTGTGCAGCTCAGGATTTTCTCTAAACccacactgaaaaataaattccCTAAAATTTACGGTAAAAAACTAGCAGCTGTGGTTGACGAAATTCTACGGTAAAAAAATGCGGTAACACCGTTTTTGGTTTTACGttcaatttacagttaaatatcatcattttattaattgatataatgttaatataccgaCCTATTAAAGTAGTGAAGTCTGAACCAAAGCCCagcacaagcagcttttaaataataacatatacagAAGGAGTTACTAAGCACCATCACGGTGAGCCTCATTAAAACTGaaacatgcaataaacattaatttaacaacattagatatAACATACAATCCAAATAAACATGACTTTtaagaaaactaaaaagaaacatagtgaatttaaaaaaaaaaaacatcaaattgaaataaaatttgaaatgcagtgCAGGGAATTCTGAGAATGTGAATTCCGGGTTTTCCCTGTAACTTTTACGGGAATTTACCGTTAACTATTTAACAAGTTTTTGCTGTGGCATTTTCACAGGTTTTGCAGGAAATGAAAAAGATGTTGGCCTCACTGGACGCAGGGTCtaaatttgttcaaattaatgaaataattaggatcgtaaactaaaaatatcacaGTGGCATGCATAGAATACCCCAGTAATTAcgctaaaatatataaaaatatattcggtttacaaaatattcataaaacgAACAAGAACAAAGAAAATCTTCATTATTATACATCATTTTTGTAGCGCACATAGGCTGATAGTTTTCTTTTATCCATTCTAAAAGCATTCTTTTTTCAATTCCATCTACTCATTTTCTTATTCATTCACTTATCAGTTTTTGTGCTGCTTTAGTAAATCATAATACTAACCAATTACCGGTTCAGAAGCCCACGCTCTCCCTTATAGCTGGGTGTGTTTAACACAGTCTcttgtgttgttaaaagaaACATCATTGTGATAATATTAGTGCTTGAATCTCCCCGAATACCTTCTTCTGTGGGTTACAGACATGCCAGCTCATTAATTCAATCAAAGCTCGTTTTTCAAAGCCcaaaagtcttttatttttgtactgttgaCGGTCCACAGAGTTACTAACGGTCCGCCGGATCTCTGAACCGAGACGTGACCTCAGTTCCTGTGCAGTTAACCAGAGCGTGCAGGAGAGCTTCAGGTTCAGAGGTTAAAACACTTTCAGCATGCGGTCgctctttattattaaaacgcGGGTGAACTCGTGGGTTTCGGTTCAGGGTTGATGTTGTGTGAACTCTGACAGCATAAACCCTCTTGCACGATGTTGCCTCAGGGTCTCGGCAAACACACAGATGAATATAGAATgggaataatatttaataatgatgtGATGAGATTAAGTAAAccggtgaaaaaaaaaaaaaaagaaagctgtttCTCAGCCTCTATATGAAGGATGCGCGTTTTTCGTGCTACAGAAAACGGAAAAAGATCATGAATAATGTCTGTtagtgaatgtttttatttatgaataacaATACATGTTACATTATGGAATGGATATGGATGAAAAGAATGCTCTTTTATCGTAATATGTGAGCATATACAGTACAATATATAAAccgttcagatgcaaaagcgtCATCTGAATttttagtatgtttatcagGCTCCTGTGTGCAGGTTCAGTCATTTGAAAAAGAACCTATTTATTGCCATGAAAGCTTAAATGACTGAACCTACGCACAAAGCgctcattttaaatgaagatttcaaatgcaaaatatatttaacccCAAAATATTTTGGGTTAAGGAATTAAAGGCTGTCTCTAAATGTCAGATTTAGTTGCTCGCGATCTCCTTCAGGAGTTTGGCAGCGGGGCTGTGCTGTTTTTCTGGCCGTGGTTTGATCTCAGAAATGTGGCACAGCCCGGTTTAACTCGGTTTGTGTGCTTGGCTCCGGAGTCAGTGGAGACATAGGTGCCCATCACACACTCATCAACACCACGACGTGCCTTAAAGTGCATACAGCCGAGCCGGAGGGGAAAGATCCGTCTCGTCTGGAGATtgaaaaagatgcatgtttCGGCCTGAAGGACGTTCGCGTTAAAGCGTATTTTCTGGAGAATGAAACGCTTTAAGACGCTTCGTTTGCCTCAGAAGACACAGAAGTGGACGGCCTTCGAATGACTTTGATTGGCAAGCACTGGAGAAATCATGACCTTAAACCTTTAATGCGCTCTGCGTGTCTGCAGATGTTAGGAGTagaatgaatctgtgtttttttccctcgtATTTCGCAGCTGAATCACAAAATGCGTTCCGTAGTTTGGTCACGTGtgggaaaaacatttttaatgtttaaatatttaaatgataaaaatgatcatATGCATCTAATTGTGGACAGTGgttgatgcattaaaaacaagtgCGTAGTTGatgaaatgtgtaaatgtattgtatataaatgGAGGAAATGCACTTTATTCTCAATATAGCGTACGTATGCGTGCGTGCATATGAAGGGATATGAATGAAGCGATCTGTAATTTATGAGCGAGTATCACGGGACGCTCACCTGACTCCAGCACAATACACCGCTGCTAAAAACTCCAAGCAGTTAATCTTCACACGTTCTACCGCTCGACGTATCAAATGAAACCGTGGAAACATGTGCATATTCTTCTATTGCTTAAAAAATAGCAGCCTAAACCGCACAGGATGGCATCGATGTAACCGTTTGGATCATATAAAAACAACGTGTCAGAATGTGTCTCATTCATCtcttcacaaaacattaaagatATCACTCCTGTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU186722 False 3670 lncRNA 0.40 3 15035383 15047877
XM_043264122.1 True 3680 mRNA 0.40 3 15035389 15047893

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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ppp1r37 ppp1r37,LOC107692481,LOC107566290,LOC107709550 coding upstream 133976 14871768 ~ 14901407 (+)
bmp16 LOC107566293,LOC107692530,LOC107709563,LOC107577119,LOC107725066 coding upstream 185007 14843211 ~ 14850376 (+)
kcnj5 kcnj5,LOC107725067,LOC107558569,LOC107709561 coding upstream 259990 14752182 ~ 14775393 (+)
fli1 fli1,LOC107692484,LOC107656981 coding upstream 307496 14704160 ~ 14727887 (+)
si:ch211-136a13.1 LOC107727474,LOC107566284,LOC107692514,LOC107722278,LOC108264834,LOC108435511,LOC106580732 coding downstream 4151 15052044 ~ 15064838 (+)
yif1b yif1b,LOC107566288,LOC107564401 coding downstream 18969 15066862 ~ 15072223 (+)
dusp8b LOC107713871,LOC107692476,LOC107569904,LOC107599770 coding downstream 385063 15432956 ~ 15442131 (+)
mob2b mob2,mob2b,LOC107722284,LOC107656971,LOC108430083,LOC108264656 coding downstream 401448 15449341 ~ 15482697 (+)
scamp5b scamp5b,LOC107740350,LOC107722282,LOC107599784,LOC108430449 coding downstream 463642 15511535 ~ 15518917 (+)
G126347 NA non-coding upstream 50635 14932321 ~ 14984748 (+)
G126345 ltbp4,LOC107724163,LOC107566282,LOC107692515 non-coding upstream 97749 14936925 ~ 14937634 (+)
LOC122323060 NA non-coding upstream 291939 14740786 ~ 14743444 (+)
G126285 NA non-coding upstream 564368 14470760 ~ 14471015 (+)
G126262 NA non-coding upstream 592880 14375565 ~ 14442503 (+)
G126458 NA non-coding downstream 18453 15066346 ~ 15066577 (+)
G126591 NA non-coding downstream 713070 15760963 ~ 15820330 (+)
G126605 NA non-coding downstream 777534 15825427 ~ 15828353 (+)
G126626 NA non-coding downstream 951559 15999452 ~ 16003818 (+)
LOC122362955 NA non-coding downstream 1010641 16058534 ~ 16058974 (+)
LOC122322993 LOC107709552 other upstream 125226 14906616 ~ 14910157 (+)
gemin7 NA other upstream 207091 14826788 ~ 14828292 (+)
G126146 gramd1bb other upstream 1094014 13940095 ~ 13941369 (+)
G126175 NA other upstream 1122583 13909564 ~ 13912800 (+)
lbhl lbhl other upstream 1166051 13861871 ~ 13869332 (+)
LOC122362954 LOC107740354 other downstream 903089 15950982 ~ 15953653 (+)
LOC122362745 si:ch211-71n6.4,si:dkey-30c15.17,LOC107686550,LOC107559644,LOC107753016,LOC107758068,LOC107670624,LOC107672404,LOC107733274 other downstream 999176 16047069 ~ 16055627 (+)
LOC122362750 homer2,homer3,LOC107595365,LOC107569981,LOC107703939,LOC107726331,LOC107723860,LOC107692231,LOC107572947,LOC107753825 other downstream 1215946 16263839 ~ 16271267 (+)
G126820 NA other downstream 1705816 16753709 ~ 16818399 (+)
G126884 ctxn2 other downstream 2026301 17074194 ~ 17077159 (+)

Expression


Co-expression Network