c18h19orf54 (LOC107549270,LOC107748228,LOC107669776)



Basic Information


Item Value
gene id c18h19orf54
gene name LOC107549270,LOC107748228,LOC107669776
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056716.1
NCBI id CM032085.1
chromosome length 26409628
location 446701 ~ 451209 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043264062.1
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>XM_043264065.1
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Function


NR:

description
PREDICTED: UPF0692 protein C19orf54 homolog isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043264067.1 False 2286 mRNA 0.44 8 446701 451209

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G123301 ryr1b,LOC107676751,LOC107596888,LOC107758351 non-coding downstream 60089 511298 ~ 512632 (+)
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G123422 map3k10,LOC107560156,LOC107554498,LOC107758231,LOC107668271,LOC107756783 non-coding downstream 399444 850653 ~ 919977 (+)
G123472 yap1,LOC107758259,LOC107662128,LOC107746561 non-coding downstream 571896 1023105 ~ 1051430 (+)
G123243 NA other upstream 337869 108369 ~ 108832 (+)
LOC122362993 LOC107758246,LOC107662138,LOC107657475,LOC107757244 other downstream 363542 814751 ~ 823675 (+)
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G123568 NA other downstream 1114217 1565426 ~ 1571931 (+)
G123664 NA other downstream 1550577 2001786 ~ 2002290 (+)
LOC122363059 LOC107714787,LOC107556260,LOC107691117,LOC107551460,LOC565819,LOC107715220,LOC107690391 other downstream 1755990 2207199 ~ 2240260 (+)

Expression



Co-expression Network