gpr107 (LOC107723348,LOC107691037,LOC107597176,LOC107693862,LOC107740935)



Basic Information


Item Value
gene id gpr107
gene name LOC107723348,LOC107691037,LOC107597176,LOC107693862,LOC107740935
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 7286568 ~ 7300729 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043240209.1
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>XM_043240212.1
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>XR_006251030.1
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Function


NR:

description
protein GPR107-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG:

id description
K22985 GPR107; G protein-coupled receptor 107

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XR_006251030.1 False 1541 transcript 0.44 17 7286590 7299811

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G33903 LOC107723325,LOC107598017,LOC107740964,LOC107587450,LOC107681865,LOC107660777 non-coding downstream 163642 7464371 ~ 7482987 (+)
G34064 NA non-coding downstream 339647 7640376 ~ 7640732 (+)
kank1b kank1b,LOC107730999,LOC107691025,LOC107597012,LOC107587402 other upstream 297796 6978548 ~ 6988772 (+)
si:dkey-34e4.1 si:dkey-34e4.1,LOC107700938,LOC107596916,LOC107710760,LOC107587412 other upstream 461202 6793365 ~ 6825366 (+)
dab2ipb dab2ipb,LOC107693836,LOC107710761,LOC107700936,LOC107726296 other upstream 523760 6617276 ~ 6762808 (+)
G33664 NA other upstream 794582 6473347 ~ 6491986 (+)
hexb hexb,LOC107718643,LOC107700931,LOC107655935,LOC107570862 other upstream 1031228 6247795 ~ 6255340 (+)
G33878 c9,LOC107691041 other downstream 37739 7338468 ~ 7344078 (+)
LOC122345182 ns:zf-e68,myhz1.2,myhz1.1,myhz2,myhc4,LOC107598006,LOC103370545,LOC107723326 other downstream 72879 7373608 ~ 7449497 (+)
G33891 myhz1.2,myhz2,myhz1.1,ns:zf-e68,myhc4,mmyhl1,myhb,mmyhl2,LOC107723326,LOC105016875,LOC105016873,LOC106565367,LOC107088603,LOC107384188,LOC107093413,LOC103461378,LOC108241321,LOC107083053,LOC107083052,LOC107378336,LOC106938339,LOC106596646,LOC106596400,LOC106585883,LOC106597527,LOC106594844,LOC108261437,LOC106595486,LOC106598139,LOC108261508,LOC103379498,LOC103379499,LOC108444093,LOC101482140,LOC107660779,LOC108443910,LOC108415768 other downstream 119411 7420140 ~ 7520241 (+)
G33890 myhc4,myhz2,ns:zf-e68,myhz1.1,myhz1.2,LOC107723326,LOC107660779,LOC108415768 other downstream 124976 7425705 ~ 7446216 (+)
svopb LOC107723362,LOC107681854,LOC107598053 other downstream 258211 7558940 ~ 7567263 (+)

Expression



Co-expression Network