adamts10 (adamts10,LOC107676806,LOC107585873,LOC107731268,LOC107695212,LOC107549976,LOC106613844)


Basic Information

Item Value
gene id adamts10
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gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056706.1
NCBI id CM032075.1
chromosome length 24299999
location 9995547 ~ 10041769 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU92749
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>XM_043247917.1
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Function

symbol description
adamts10 Predicted to enable metalloendopeptidase activity. Predicted to be involved in extracellular matrix organization. Predicted to act upstream of or within proteolysis. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular matrix. Is expressed in several structures, including digestive system; eye; heart; pleuroperitoneal region; and thymus. Human ortholog(s) of this gene implicated in Weill-Marchesani syndrome. Orthologous to human ADAMTS10 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 10).

NR:

description
A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 10-like isoform X2

GO:

id name namespace
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GO:0004222 metalloendopeptidase activity molecular_function
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K08625 ADAMTS10; a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 10

RNA

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Neighbor

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haus5 LOC107731222,LOC107585885,LOC107745798,LOC107695262 coding upstream 223072 10264841 ~ 10271997 (-)
si:dkeyp-82a1.6 LOC107550035 coding upstream 238534 10280303 ~ 10284362 (-)
zgc:112962 LOC107695265,LOC107745796 coding upstream 242723 10284492 ~ 10291110 (-)
G62576 NA non-coding downstream 263393 9731906 ~ 9732154 (-)
G62568 NA non-coding downstream 284551 9710646 ~ 9710996 (-)
G62567 NA non-coding downstream 286326 9708973 ~ 9709221 (-)
G62565 NA non-coding downstream 291949 9703376 ~ 9703598 (-)
G62564 NA non-coding downstream 292356 9702959 ~ 9703191 (-)
G62670 NA non-coding upstream 1419 10043188 ~ 10043398 (-)
G62749 mob3a,LOC107695254,LOC107585875,LOC104921817,LOC103368804,LOC107731185,LOC103137270 non-coding upstream 13282 10055051 ~ 10057928 (-)
G62768 NA non-coding upstream 35648 10077417 ~ 10077652 (-)
LOC122350767 NA non-coding upstream 86116 10127885 ~ 10150991 (-)
G62788 NA non-coding upstream 110470 10152239 ~ 10152905 (-)
mllt1a mllt1a,LOC107731200,LOC107676782,LOC107695250,LOC107549968,LOC107585916 other downstream 26062 9954681 ~ 9969485 (-)
fam78bb fam78bb,LOC107717547,LOC107676968,LOC107751100,LOC107550401,LOC107585866,LOC107695225 other downstream 286926 9700394 ~ 9708621 (-)
mindy4 LOC107699968,LOC107585839,LOC107548580 other downstream 732721 9257243 ~ 9262826 (-)
pola2 pola2,LOC107599808,LOC107657899 other downstream 1338261 8652304 ~ 8657286 (-)
mrps36 mrps36,LOC107657871,LOC107599810,LOC107699743,LOC107743861,LOC107548364,LOC107710901 other downstream 1345564 8647270 ~ 8649983 (-)
smim24 smim24,LOC107580287 other upstream 203427 10245196 ~ 10248156 (-)
G62760 gpr37l1b,LOC107585901,LOC107731282,LOC107668115,LOC107549203,LOC107695275,LOC107745785,LOC108441645 other upstream 347414 10389183 ~ 10392043 (-)
G62826 cry1ba,LOC108265656,LOC108441644,LOC103461922,LOC105026018,LOC102226488 other upstream 398995 10440764 ~ 10480051 (-)
trnar-ccg_26 NA other upstream 498450 10540219 ~ 10540291 (-)
cep104 cep104,LOC107668088,LOC107745778 other upstream 931536 10973305 ~ 10990735 (-)

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