bend5 (bend5,LOC107707580,LOC107757978,LOC107700377,LOC106584333)



Basic Information


Item Value
gene id bend5
gene name bend5,LOC107707580,LOC107757978,LOC107700377,LOC106584333
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056706.1
NCBI id CM032075.1
chromosome length 24299999
location 7750415 ~ 7763209 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043247643.1
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>XM_043247644.1
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Function


symbol description
bend5 Predicted to enable DNA binding activity. Predicted to be involved in negative regulation of transcription, DNA-templated. Orthologous to human BEND5 (BEN domain containing 5).

NR:

description
BEN domain-containing protein 5-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043247643.1 True 6987 mRNA 0.41 6 7750415 7763209
XM_043247644.1 False 6837 mRNA 0.41 6 7750415 7762298

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122350884 NA coding downstream 367603 7380546 ~ 7382812 (-)
LOC122350680 LOC107599044,LOC107700337,LOC107757981 coding downstream 372658 7375035 ~ 7377757 (-)
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lhx4 lhx4,LOC107699337,LOC107550233,LOC107758007,LOC107599001,LOC107755297,LOC107665078 other downstream 647422 7091450 ~ 7102993 (-)
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LOC122350671 fibcd1,LOC107739453,LOC108428067,LOC102776889,LOC107596897,LOC107700935,LOC105015243,LOC106936583 other downstream 1307433 6423742 ~ 6442982 (-)
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