G151621


Basic Information

Item Value
gene id G151621
gene name NA
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035913.1
NCBI id CM008316.1
chromosome length 28317440
location 13600609 ~ 13633602 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU205446
GGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTATTAAGATTGTTGTAGTAGTTGTTGTTGAGTCGGTAGGTGTTGGAGTTGGGATTGTTGTAGTAGTTGTTGTTGATGTGGTAGAAGTTGGACTTGTTTGCTGTTGTATGCACTGTAGCATACATGTTGTAGTTTGCACAGTTGAGCCAGTAGGTGTAGTATACATGGATGAGCTGAGAGATGCTAGTAGTGTGGTAAGGATGACGTCTGG
>TU205447
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>TU205450
GGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTTGGTGGTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGTT
>TU205451
GGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTATTAAGATTGTTGTAGTAGTTGTTGTTGAGTCGGTAGGTGTTGGAGTTGGGATTGTTGTAGTAGTTGTTGTTGATGTGGTAGAAGTTGGACTTGTTTGCTGTTGTATGCACTGTAGCATACATGTTGTAGTTTGCACAGTTGAGCCAGTAGGTGTAGTATACATGGATGAGCTGAGAGATGCTAGTAGTGTGGTAAGGATGACGTCTGG
>TU205453
GGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTTGGTGGTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGTGCTTGTTGTAAATTCTGTTGTTATGCTGGTAGTTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGCAGTTGTTGGGGTTGTGCTTGTTGTGGTGGGTTCTGTTAGTGTGCTGGTAGGTGATGGATTTGGTATTGTTGTAGTTTCTGTTATTGTGCTGGTAGGTTTTGGAGTTGTGCTGGTAGGTTTTGGAGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGAGTTGTGCTGGTATGTGTTGTAGTTGAGCTTTTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTTGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGTTGGTAGGTGTTGTAGTTAAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTAGTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTAGTAGTTTCTGTTATTGTGCTGGTAGGTGTTGAGATTGTTGTACTGTCTGTTGTTGATTCAGTTGGAGTTGAGATTGTTGTAGTAGTTGTTGTTGAGTCGGTAGGTGTTGGAGTTGGGATTGTTGTAGTTGTTGTTGATGTGGTAGAAGTTGGACTTGTTTGCTGTTGTATGCACTGTAGCATACATGTTGTAGTTTGCACAGTTGAGCCAGTAGGTGTAGTATACATGGATGAGCTGAGAGATGCTAGTAGTGTGGTAAGGATGACGTCTGG
>TU205455
GGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTATTAAGATTGTTGTAGTAGTTGTTGTTGAGTCGGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGTTGGTAGGTGTTGTAGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGTAGGTGTTGTAGTTGTGCTTGTTGTAAATTCTGTTGTTATGCTGGTAGTTGTTGGGGTTGAGCTTGTTGTGGTGGTTTCTGTTGTTGTGCTGGCAGTTGTTGGGGTTGTGCTTGTTGTGGTGGGTTCTGTTAGTGTGCTGGTAGGTGATGGATTTGGTATTGTTGTAGTTTCTGTTATTGTGCTGGTAGGTATTAAGATTGTTGTAGTATATGTTGTTGAGTTGGTAGGTGATGGAGTTGGGATTTTTGTAGTAGCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU205446 False 264 lncRNA 0.44 3 13600874 13633602
TU205447 False 264 lncRNA 0.44 3 13600874 13633602
TU205450 False 236 lncRNA 0.47 3 13600609 13603058
TU205451 False 264 lncRNA 0.44 3 13600874 13633602
TU205453 True 1121 TUCP 0.45 6 13600609 13633602
TU205455 False 538 lncRNA 0.45 2 13600874 13601459

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103040694 pax3a,LOC108439877,LOC108280216,LOC107738801 coding upstream 56193 13504905 ~ 13544416 (+)
trnag-ccc_1 NA coding upstream 119570 13480969 ~ 13481039 (+)
trnai-aau_11 NA coding upstream 155740 13444796 ~ 13444869 (+)
trnap-agg_5 NA coding upstream 157697 13442841 ~ 13442912 (+)
c17h2orf82 cunh2orf82 coding upstream 159353 13430528 ~ 13441256 (+)
LOC103037413 foxl2 coding downstream 101207 13734809 ~ 13736617 (+)
LOC103043540 NA coding downstream 114056 13747658 ~ 13750852 (+)
nop53 NA coding downstream 361217 13994819 ~ 14002138 (+)
LOC103038690 LOC103038690,LOC108443093,LOC107567262,LOC107655289,LOC100331216,LOC105901416,LOC108280251 coding downstream 374577 14008179 ~ 14038002 (+)
dmac2 NA coding downstream 445428 14079030 ~ 14084542 (+)
G151614 NA non-coding upstream 36245 13562385 ~ 13564364 (+)
G151579 NA non-coding upstream 126741 13466553 ~ 13473868 (+)
G151570 NA non-coding upstream 147738 13446051 ~ 13452871 (+)
G151565 NA non-coding upstream 217122 13383238 ~ 13383487 (+)
G151561 LOC103036308 non-coding upstream 222635 13376367 ~ 13377974 (+)
LOC111194545 NA non-coding downstream 35289 13668891 ~ 13673126 (+)
G151632 NA non-coding downstream 45372 13678974 ~ 13683113 (+)
G151655 NA non-coding downstream 96222 13729824 ~ 13730114 (+)
G151633 NA non-coding downstream 107725 13741327 ~ 13744062 (+)
G151699 NA non-coding downstream 132053 13765655 ~ 13766027 (+)
LOC103039742 LOC108439864,LOC108280459 other upstream 265533 13297594 ~ 13335076 (+)
LOC107197015 NA other upstream 363872 13230102 ~ 13236737 (+)
LOC103033441 abhd8a,LOC108439870,LOC107696148,LOC107754588,LOC107687901,LOC107596234,LOC108280232,LOC103352801 other upstream 469156 13101394 ~ 13131453 (+)
LOC103033117 LOC108439884,LOC100333521,LOC107696163,LOC107750940 other upstream 491005 13103115 ~ 13109604 (+)
LOC103035375 LOC108427208,LOC108280686,LOC100331938,LOC107713688,LOC107600193,LOC107558294,LOC107729982 other upstream 1996568 11587909 ~ 11604041 (+)
G151634 NA other downstream 13078 13646680 ~ 13684847 (+)
pcp4 NA other downstream 124840 13758442 ~ 13762513 (+)
LOC103044755 LOC108443098 other downstream 286823 13920425 ~ 13943509 (+)
sirt2 sirt2,LOC107726128,LOC107655297 other downstream 454967 14088569 ~ 14095319 (+)
LOC107196904 NA other downstream 754813 14388415 ~ 14509200 (+)

Expression


Co-expression Network