G184975


Basic Information

Item Value
gene id G184975
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035917.1
NCBI id CM008320.1
chromosome length 21661149
location 16588066 ~ 16596250 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU250647
agggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgatggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatgtaaagctgtaatagttttaagggaaggt
>TU250648
aaggtgtaatagtgttgatggAAGGTATaatttaaaggtgtaatagtttaaagggaaggtgtaatattgttaagggaaggtataatgtaaaggtgtaatagttttaagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagttttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatgtaaagctgtaatagttttaagggaaggt
>TU250649
ggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgatggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagttttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatgtaaagctgtaatagttttaagggaaggt
>TU250650
ggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgatggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgtaaagctgtaatagttttaagggaaggt
>TU250651
aaggtgtaatagtgttgatggAAGGTATaatttaaaggtgtaatagtttaaagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatggtgtaatagttttgagggaaggtgtaatagtgttgagggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgatggaaggtgtaatgttaaaggtgtaatagtgttgagggaaggtataatattgttaagggaaggtgtaatgtaaagctgtaatagttttaagggaaggt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU250647 False 226 lncRNA 0.36 3 16588066 16588710
TU250648 False 226 lncRNA 0.33 4 16588066 16596250
TU250649 True 436 lncRNA 0.36 4 16588066 16595752
TU250650 False 338 lncRNA 0.37 4 16588066 16595752
TU250651 False 256 lncRNA 0.34 4 16588066 16596250

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnar-ucg_12 NA coding downstream 8291 16579703 ~ 16579775 (-)
trnar-acg_15 NA coding downstream 8394 16579600 ~ 16579672 (-)
trnar-ucg_11 NA coding downstream 8497 16579497 ~ 16579569 (-)
trnar-ucu_8 NA coding downstream 8599 16579395 ~ 16579467 (-)
trnar-ccg_15 NA coding downstream 8702 16579292 ~ 16579364 (-)
trnar-ccg_16 NA coding upstream 42161 16638411 ~ 16638483 (-)
trnar-ucu_9 NA coding upstream 42295 16638545 ~ 16638617 (-)
trnaq-cug_13 NA coding upstream 42741 16638991 ~ 16639063 (-)
trnar-ccg_17 NA coding upstream 42996 16639246 ~ 16639320 (-)
trnar-ucg_13 NA coding upstream 43100 16639350 ~ 16639423 (-)
G184962 NA non-coding downstream 24618 16562389 ~ 16563448 (-)
G184959 NA non-coding downstream 32388 16555254 ~ 16555678 (-)
G184958 NA non-coding downstream 33075 16554775 ~ 16554991 (-)
G184957 NA non-coding downstream 33754 16553999 ~ 16554312 (-)
G184946 NA non-coding downstream 86500 16498359 ~ 16501566 (-)
G184987 NA non-coding upstream 39240 16635490 ~ 16635935 (-)
G184990 NA non-coding upstream 47241 16643491 ~ 16643928 (-)
G184991 NA non-coding upstream 47747 16643997 ~ 16644276 (-)
G184993 NA non-coding upstream 51160 16647410 ~ 16703493 (-)
G184996 NA non-coding upstream 59547 16655797 ~ 16657592 (-)
smim14 smim14 other downstream 916112 15666111 ~ 15671954 (-)
smim18 smim18 other downstream 1206858 15376658 ~ 15381208 (-)
LOC103043525 tapt1,LOC108434341,LOC107702406,LOC107750443,LOC107671913,LOC105908524 other downstream 1247486 15309509 ~ 15340580 (-)
trnas-gcu_6 NA other downstream 2496476 14091509 ~ 14091590 (-)
trnas-gcu_5 NA other downstream 2498279 14089706 ~ 14089787 (-)
lrat lrat other upstream 301928 16898178 ~ 16901684 (-)
LOC103032582 NA other upstream 633835 17230085 ~ 17241027 (-)
G185295 NA other upstream 656017 17252267 ~ 17254633 (-)
G185311 emc4 other upstream 699251 17295501 ~ 17300782 (-)
nutm1 NA other upstream 717120 17313370 ~ 17328889 (-)

Expression


Co-expression Network