rbm47 (rbm47,LOC107702361,LOC107754149,LOC107746010,LOC107656158)


Basic Information

Item Value
gene id rbm47
gene name rbm47,LOC107702361,LOC107754149,LOC107746010,LOC107656158
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035917.1
NCBI id CM008320.1
chromosome length 21661149
location 17606105 ~ 17652838 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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TATTTACAGTCTTGCTATTCTTCTAAAGAgcttattttatgtatatttccGAATTAAATTAATCTAGTAGTTTAATTCCTCATTTATGTCAGTAGGCTGTCCGTccagaagctttttttttgtattttacgtTTGgggtttctattttttttatatttttctgtcaTGTGATGtgctgtatttttcttttatttgacaCTCCATATGGTACCGTGtgtggtagatttttgtttCTGACATTCTGACATTGTAGTAAGGTGCACTTAAACGTATTTTAAAACAGGAGAGTCGCTTAGAGTATGTGAATACAATTAAAATGCAAGTGCCTTTAGTATGTATACATGCATTTGGGCTGAACtgggcacttttttttttccttcattgtaTTTGgttaatttttgtatttaaagttttttaaaattgtttccCCTGAAATTAATGGGACCAAACTGGAAGCAAGACTTTAAATTAAGTGTTGTGCATCATAATTATACTTTCTAAAAGCTGCTACATGTCACCACTGTGCCTCCCTAAGTGATgtccatgttaaaaaaaatagtaattacaAGCTAGCTACGACTGACAAGTAAATAAGAGCTAGAAAAGGTGCAAAatagtaactataactactgTATTGACTACTGTATTTAACTAGAAGCTAGGCTAAGCTATTTTTTAACAGCCAGCAAACATGTGACTCGCAATGGGCTACGATGAATAGCATCTACACAGCAGAGGTTCCAGTGTTAAATCagcactgttagtgttaaattaacacaaaaacTGCTGATTTAAGTctgaaaaaaatgctgtaaataaatctAGTCACTATAGCCAATAATTGCTAGTCTGTAGCTGCTAGTTACATGTTTAACCCAGTGTATAACCCAGTTCACTGGCTAGCAAACTAATAATTACTATGCAGCTACTACTGTCACTGGATATTGACTAGCAACCTACTAGTAACTACTAACAAAACTAGTAACTAGCATTTAGCAAGCTGTAGCTAGTAACTAGTTACTTGTCACCATAATGTATCCCAAAGTCAGTGGCTTTTTCACACTCCCAGTGTAGAGACAGTGGTAGGGCTTGCTACTCCTATTCCTTTACTTTGCAATCATAAACAAGATGGCAGCTTCCATTTCTGCCATATTTGAGCTTTAAAATGTTGCAATGTGAAAGAATGAAGAGACATTATACACTCTAATACAAATGTTGGAATTTCCTAGTTCTGATTGGGAAGTTTTAACTGGAACGCTTCTACAGGTTGTATTTTTTACTGGGAAAGTTTGGGAGAGCCTTACCAACACGTTTCAGAATTCAGAATCCAGGATGGGTGGCCTTAACTTTGACTGTAAAGCAGTAAAACAGTAGTATCACACAGTTTATTATAAAGCACTTCTATTTATTAGTGTTTCATTAAATcagtcatacacacagtactgtccaacTTCTATCTTATCTGTGGACATGTTTCAGTGAGGTTtggatgcacaaaatactgcaTAGTATGTTGTTATCCACTGGCAGTGCAAACATTGATATTCAAATCAGCTGGAGCGACACCTGAGGTAAATGGAACGCAGCGGAAaattttaaacataataaacagtCTATGGTGCCACTCCCTTTATAATGGCTCTACTGAGGACCATTACTTGGTCAATGACTGTGCTAAAAGGGTGTGATTACTTTATGTTTTTACTCAGTGGTGCCGTgttcttttaaaacatgcaaCTTCCACAGTAGATATCTTTATGATTTGATAACATGAGAGCCTGCTTTAACATCATTTTATCTAATTTACTCTGTGGATTGTTCTAAAACATCAGGgtagtttcccagacagggattaatctTAGTCTaagactacacagcatttttattggagcctaagactaggcttaatccttgtcCGGAAAAAAACAACCCTCATagtgtagcctactttataaCCACTGAGAGACTATGTCATGTATTCCTAACTACTGCACTATTCCactattatataattaataactcCTTGTGAATTTGAAGGGTAGTGTGAGTGTAGGGTTTGGCAGAGGAGGCCTCGCTCCTTTGTTCTTTTGTTCGTTCTTTTCATCATCTCTTCTTTAGTGCTTTTCATACTCAAGGTGAaggatttttgtgtgtgtgtgtttttttgttatatcattttcctgtaagattttttttgtggaggGCGGGTGGGTTGCTACATCTAACCTTTTTTTGTCATTGCTTATGTTTggcttattattaatattattataaaatatgatttatgttttattgagCATAAACTGCGTGTTAAGACTGAGCAACACTTACATTGGGAAGGCTAGGCTACTTAAATTAACTTTCTGGCCATACAAGCAACGtttctgcaataaaaaacaaaaaaacaagagtaACAGCTAGACACTTATGCTGTAACtgcatgaacacacacatcCTAAAAGTGTGTGTACATGGTCATTGCAGGAGTGCAAACACACTCTGCTGTTGAACGCTGGTCCTTAAGTTGAGCTTTCCTTTCTGTAGGATTCTATTTGTCTCCTTAGAGTCTTTTATTATGGCCCGAAGGTCaggatatatttaatatatatacattgcaTTGTTTTGTGTATGAAGTAAGAAGAAATGCTATAATATATTTGAAGTGAaacattttttcctttctttataTGCGACTTGTTTAGAGAGTTTTTGCCAAAGTGTTCAATAGTGTtcttaaaacctaaaaaaaaaaaaaaaaatgaaaaccacaaaaaaagaaaaatatgttttagttgtgttttttgttgttgttgttgttgttattgtttttttcagttataCTGGACAGAGCTGGCCAGTTCTAACTGAATGCTGACCCGACATGGGCTCAAGCATCCACTGAAAACAATTTGCTCTCTATCGCGATCATTTCATTAACACTACATATGTAGTTTTAGGTGACTTTTATTCTTCTTGCTACTTCAGAACTAAACGGACAAGTTGTTTGATGGTTGCAGATGTTTTCAAGCTCTTGCCAAAATGTTTCTAACCGTCTCTTTGTAGAACTTTTTTAGAACTGTTTTCTAGCACACACTATTTGTAAGAGGCTTTTTTTGGCATTGTGTAGGCTATTTATAGTGGTTCGGTAGCtgaataaagcattttaaaaaaagaga

Function

symbol description
rbm47 Predicted to enable mRNA binding activity. Acts upstream of or within head development and regulation of anterior head development. Predicted to be active in nucleus. Orthologous to human RBM47 (RNA binding motif protein 47).

NR:

description
PREDICTED: RNA-binding protein 47 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K25083 RBM47; RNA-binding protein 47

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022682049.1 False 8382 mRNA 0.42 6 17606105 17652838
XM_022682050.1 False 8176 mRNA 0.41 5 17606105 17652836

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network