LOC103042298 (slc35d2)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103042298
gene name slc35d2
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035902.1
NCBI id CM008305.1
chromosome length 52532229
location 26558406 ~ 26569939 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU73603
AAGTGTGGGGCTCAGGCTAACTTCCTGCACACAGCAGTACCGTGTTTaccagtgttaaataaaccctCTCAGGGTTCAGTAACCGCCGGGCTCAGCTTCCTGAAACACGGGGGGGATGTATCTCTGTACACCCGCTCTTCAGCAGGACAGAACCAGCGGAACAGCTGCGCTCTGTACACAACATTAACCCGAGCTACAGGTTACCGGAAGAGCCGCGCTGTAGATCCAGGagcaccatgtccagaagaacCTCTTCCTTCACTTCTTCTCCTCcgtctccctctccctctccttctgTCTCCTTTCCTTTATTCAGTCCTGCTCACAGAGACGGGAGACTGCTGAAGCtcgtttctgctgttttttatgcTGTCAGTTCATTTCTAATCATCGTTATCAACAAGACTGTTCTCACCAACTACAGATTTCCTTCATACACATTCCTTGGGATTGGACAGATGGCATTCACCATCATCATTCTCTATTTAGCTAAATCATTCAAAGCTGTCAGTTTTCAGGACTTTGACAAAAGCATACCTGTAAAGATGTTTCCTTTACCGTTACTCTACGTTGGAAATCATGTCACAGGTCTGGGAAGCACAAAGAAATTAagCTTACCCATGTTCACCGTGCTCAGAAAATTCACTATTCTCCTCACAATGATAATGGAGACCAAAATATTAAGGCTAGATCTGTAAAACCTGTTTAACCTTACAGAAAGACGTTTTCACCTCAGCTGGTGTGCAGTGTACTGGCCATTGTGTTCGGGGCTCTGATCGCTGCAAGCTCTGACCTTGCTTTTGATGCAGAGGGATACACTTTTGTTCTCCTCAATGATGTCTTTACAGCTGCCAGCGGCGTTTATACGAAGAAGAAATTAGGAATAGAGGTATGTGCCTAATAAGGATATATGGATAAATTAAATTGGTTGACCTAGAGTTGCAAACATGTTGAATTGTTTATGGAGACCatgttctgtttcaaagatacatgtaaaaaaaaaatttaacttacaaaatttttgttttagtttagggTAAATCTAGTTTAATACATTGTTGCACTGTGTTTTTgtgaaatttaaacaactacactgcaaaaaactaaatcttagcaagtgattttttttatttaaggcagtaaatcttattttcttctctgataagactttttgtcttactaagtgattattttgcttattttagggataattatcttaatcattcttactcagaatttgtaccttattttaagtaatttgaactcaaaaaatGGGCACAATCAAGCAggaatcaagttattctgattcttgtgtccaaaaacagtgacttttttttgcttgatttaggtgttgcttcactcattttgagactttgtcattgctttttgtaagaaatcttactaagaaaattttgcttaccccattggcagatttattttacttaatatacatatatttgtcttaatttgcctgtattttgtctagtttttgccaattgattttttgcagtgtatgctgtggacacaaaaggcacattatattaatattaatctatataaTAATTCATCCTGAGTATTCAGCATCATCCTTCGAAATCATTAACTGTTTACATAATATGAGCTAATTCCCAATACATGGGCCTGTAGGAACAGTCCAAAGGACCTTTAAATAGAACATTGTTAGATTAATGTACACATAAGATGAGGTTAAACTActatttgtactatttttactgtatctTAGGCCAATCTGATTGGCTCTATTCTGCAGATATTTCCATGTCcttgttttattgtaaatttatttattatggttGAATATTGCAAAGCATATTGTTTTCCAATTTATGTTCTTCTTCTTTCGTTTTCTGATTCTTcttgttcttatttttcttctggATTTTCGACACGTAACTCAAAACACAGCTCACGAGGTACTGACACTATTCCAACTCAAGATTTTTCTATTTGAGTGTGTGATTTGGGCTTATACTCATTCACCTGCAGCATTCATTTTCACCCCTTCATAGCATCACTTTTTTATGGCCATCTCCTGTAATTGTGCTGGTACTTTTTACTTTCATTCGCCCCCATtccacaaccccccccccagTGCCGACGGCCTAGAGATTTATTTGCCAAGCAGACACCAAACTGCATATACTCCTTCAGGATAAGTCTCTAAGCTTTAATTCTCAGCTGTACTTACCTGCACTCCTCTGTTTATCATTTCTCTTGTTTGGTCTatgttgtgtaattttttttttaaatatatggaaGAAATATAAAAGTAGGAAAAGTCAGGAAACGCACAGATGTACAAAAAACTTGGCAGTGATCATATATTCAATCAGCCACTTAAAGACCAAATTTAATTGGTGGAAACATTTTATATGTAGATGGTTCTCtttgaaacttaaaaaaaaaagattctttaTAACACTAAAACAGATTTCACTATCGCTACGAGGTAAACAGCGCCATTTGCTGGGAATGTAAAAACCAGTGGAAACAGGTCCTGAAAGCATGTAGGGCCTTTCCCATTAAGTAAACACTGGATTTATCTGTCACCTATTAACTCTGCCGTTACATCGGGTTGATGTATTTCTCTGCTTTCAATAGGGCCTTGGCAAGTACGGGCTTTTGTTCTATAATGCGTTCATCATCATTATACCCACTATTTTGGCAAGTGCCTACACCGGAGACTTGGAAAAGGCCATCATGTTTAAAGGCTGGATGTCTCTgagttttattgtatattttatgatGTCTTGTGCCATGGGGTTTGTATTGATGTACTCCATTGTTCTGTGTAGTCATTACAACAGTGCCTTAACCACCACAGTCATTGGGGCAATTAAGAATGTTGCTGTAGCCTACATCGGGATGTTCATTGGTGGAGACTACGTCTTCTCATGGCCAAACTTTGTTGGACTGAATATATGTATCTCTGGTGGCTTGGTGTACTCATATCTGACCTTTCATGGTGGGTCTTCTGCACAAACAGCAACCCAGGAAGAGAGCAGACTGAGAGTTCATGTGGTAGAAGAAAACACAGAAGAGAAAAGCCAGTTCTCAGATATACTAACACTACAGTCTGTTAAACCTCCAATCTGAGAGTGGATCATTACAGGGTATGAAGTTACTATCAGGGATTGTATTGTTTACAGTAAATGTGTAGTTTTTCCCCTGTGTAGATGAAGAATTTCTGCTCACTTATTTTGAACCAAATGCAATATTGTTAAGCTTCAGAAAATTGATATACGAATATTCGATATATGAAGGTAAAGTGTTAACTTATTAGTTTAAGTTTATTGTGTCCAATCCATGTGACCAATCTAGCAATAACAGACATTTTTATACACAGTAGCTTCATTACGGGGACGAACAgaaaagtacagtatattttactgtacattaaGGGACAGTTCCCCTGACAGAGATTATGCCTAGTCTTGGACTGTACTGTATTTCTAATGTAGATTtctactgaaaataaaatataatctagATTAGATTAGCCCTAGTTTTTGTCCAGGAACCTGACTCAAAGTGAAGTaaaattgagcaaaaaaatgCACAAGCGAAAATGGAAGGACCTTGACACTGaaacatatttaagtttttaaggTGCTATATTTGGTAATATGGTAATTAATTGGTTGTACTGATCCTAACAGAAAGATTAAGTTGCTTAattgttggtgatattattttaatcctcctgttatgttctgggtcaaattgacctgttttaagatcagtttaaagatctagtaaaaacagttaaaagtatttgttctgtatgaaacttcttctgtttgccttaattagtgtaatcaacatatagtAGGAATATGGTTCATCTCATATTCGCAaccaactaaaacaaaattgcaatgttatgtttcattgttatgtaaaactattgatttttatatgttggtcttttaaaagtaaaaacgtAGTGAAAtgtcaaaaaacattttaaaaagtattgtttttatgaaaaacaagttaaaaatcCTAACTGAactattacctgttagaggtaagaaacTCCAAATAATGATTaacaatatttacactgcttggtGCTGGTTTCACACACcactgctgttcctgacaaatgaatgTACAAGTAGGGTTAAATAGTATAAATTTAAATTGGCGTTATTATAGTTATAATTAATCTAACTTGTAACTTATTGGCAGGAGAAAAGAAACATCTCCTGGTACTTTGAATGTTTAAATGAAggtcaataaaagtatttaattttaataatactttgttttaatattatagaAACAAAGGTATAAATAATTCTATTAGTAGTTACATGGTTCTTGGTTGGTTGTGTGTTGCAGAATTAGTGATCCTATTTTTGACGTCTGCTGTTGTCTCTCAATCACACCTTTAACATTTGTTTAACATTGTTGGCTTGTATTTTAACCTAGCATGGGCATGTGGATCAGGCCTCGCTCCAGCTCATATCATTGATATCACCTTGATAGTAatacactggccagtgttcagcctcactctgAATGTAAACACTCACACATCAGGTGTGAATTTACATGCTgcttttggcatatcagtgtgcTTGTGTCAGatactacataaaataaaatgcctTTACTAAATAACTACATGTTTATATGTTAACTGCTTAGATTTATAAAAATGGCCGGTCCATTAGCTTATAGCACAATCACCGCTAACAATACTAAAGCAAATATACAGAATTTTAAAGCCAAAAATGGAATGCTTTTGTATGGTTAAGTCTATATGGATGTTCTTGGACTCCCACATTTCTGTTACACTGGATTTGATgaggttgttgttttgttgtcaGTGCCGCCAAAGATGCGTTGCAGATTTTATTGAACTTGCACTTAAAACCTCCAAATGTGATTATCGTCATTTCAGTTCAACCTggaaacaatgtaaatataccaaaaatcagatttggtctGGCAGTGTGAACATAGCCAAA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>XM_007254067.3
CTGAGTGTAAGTGTGGGGCTCAGGCTAACTTCCTGCACACAGCAGTACCGTGTTTaccagtgttaaataaaccctCTCAGGGTTCAGTAACCGCCGGGCTCAGCTTCCTGAAACACGGGGGGGATGTATCTCTGTACACCCGCTCTTCAGCAGGACAGAACCAGCGGAACAGCTGCGCTCTGTACACAACATTAACCCGAGCTACAGGTTACCGGAAGAGCCGCGCTGTAGATCCAGGagcaccatgtccagaagaacCTCTTCCTTCACTTCTTCTCCTCcgtctccctctccctctccttctgTCTCCTTTCCTTTATTCAGTCCTGCTCACAGAGACGGGAGACTGCTGAAGCtcgtttctgctgttttttatgcTGTCAGTTCATTTCTAATCATCGTTATCAACAAGACTGTTCTCACCAACTACAGATTTCCTTCATACACATTCCTTGGGATTGGACAGATGGCATTCACCATCATCATTCTCTATTTAGCTAAATCATTCAAAGCTGTCAGTTTTCAGGACTTTGACAAAAGCATACCTGTAAAGATGTTTCCTTTACCGTTACTCTACGTTGGAAATCATGTCACAGGTCTGGGAAGCACAAAGAAATTAagCTTACCCATGTTCACCGTGCTCAGAAAATTCACTATTCTCCTCACAATGATAATGGAGACCAAAATATTAAGAAAGACGTTTTCACCTCAGCTGGTGTGCAGTGTACTGGCCATTGTGTTCGGGGCTCTGATCGCTGCAAGCTCTGACCTTGCTTTTGATGCAGAGGGATACACTTTTGTTCTCCTCAATGATGTCTTTACAGCTGCCAGCGGCGTTTATACGAAGAAGAAATTAGGAATAGAGGGCCTTGGCAAGTACGGGCTTTTGTTCTATAATGCGTTCATCATCATTATACCCACTATTTTGGCAAGTGCCTACACCGGAGACTTGGAAAAGGCCATCATGTTTAAAGGCTGGATGTCTCTgagttttattgtatattttatgatGTCTTGTGCCATGGGGTTTGTATTGATGTACTCCATTGTTCTGTGTAGTCATTACAACAGTGCCTTAACCACCACAGTCATTGGGGCAATTAAGAATGTTGCTGTAGCCTACATCGGGATGTTCATTGGTGGAGACTACGTCTTCTCATGGCCAAACTTTGTTGGACTGAATATATGTATCTCTGGTGGCTTGGTGTACTCATATCTGACCTTTCATGGTGGGTCTTCTGCACAAACAGCAACCCAGGAAGAGAGCAGACTGAGAGTTCATGTGGTAGAAGAAAACACAGAAGAGAAAAGCCAGTTCTCAGATATACTAACACTACAGTCTGTTAAACCTCCAATCTGAGAGTGGATCATTACAGGGTATGAAGTTACTATCAGGGATTGTATTGTTTACAGTAAATGTGTAGTTTTTCCCCTGTGTAGATGAAGAATTTCTGCTCACTTATTTTGAACCAAATGCAATATTGTTAAGCTTCAGAAAATTGATATACGAATATTCGATATATGAAGGTAAAGTGTTAACTTATTAGTTTAAGTTTATTGTGTCCAATCCATGTGACCAATCTAGCAATAACAGACATTTTTATACACAGTAGCTTCATTACGGGGACGAACAgaaaagtacagtatattttactgtacattaaGGGACAGTTCCCCTGACAGAGATTATGCCTAGTCTTGGACTGTACTGTATTTCTAATGTAGATTtctactgaaaataaaatataatctagATTAGATTAGCCCTAGTTTTTGTCCAGGAACCTGACTCAAAGTGAAGTaaaattgagcaaaaaaatgCACAAGCGAAAATGGAAGGACCTTGACACTGaaacatatttaagtttttaaggTGCTATATTTGGTAATATGGTAATTAATTGGTTGTACTGATCCTAACAGAAAGATTAAGTTGCTTAattgttggtgatattattttaatcctcctgttatgttctgggtcaaattgacctgttttaagatcagtttaaagatctagtaaaaacagttaaaagtatttgttctgtatgaaacttcttctgtttgccttaattagtgtaatcaacatatagtAGGAATATGGTTCATCTCATATTCGCAaccaactaaaacaaaattgcaatgttatgtttcattgttatgtaaaactattgatttttatatgttggtcttttaaa

Function

symbol description
slc35d2 Predicted to enable antiporter activity and pyrimidine nucleotide-sugar transmembrane transporter activity. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in Golgi apparatus. Orthologous to human SLC35D2 (solute carrier family 35 member D2).

NR:

description
PREDICTED: UDP-N-acetylglucosamine/UDP-glucose/GDP-mannose transporter

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU73603 True 5450 TUCP 0.36 11 26558406 26569931
XM_007254067.3 False 2198 mRNA 0.40 12 26559901 26569939

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
fbxl17 fbxl17,LOC107570989 coding downstream 29202 26095111 ~ 26529204 (-)
efna5 efna5,LOC108265807,LOC108430322,LOC106585191,LOC100702629 coding downstream 592341 25780429 ~ 25966065 (-)
lrrc2 lrrc2 coding downstream 937141 25612122 ~ 25621265 (-)
LOC103035302 NA coding downstream 1013879 25541306 ~ 25544527 (-)
LOC103036837 NA coding downstream 1018007 25532060 ~ 25540399 (-)
ubox5 NA coding upstream 24401 26594340 ~ 26599322 (-)
lzts3 lzts3,LOC108265122,LOC107712591 coding upstream 31524 26601463 ~ 26614549 (-)
LOC111192646 NA coding upstream 51718 26621657 ~ 26627863 (-)
LOC103043953 fabp1,LOC103043953,LOC108430333,LOC107704576,LOC107573351,LOC107726869 coding upstream 70562 26640501 ~ 26643368 (-)
LOC103043649 LOC103043649,LOC108430332 coding upstream 78600 26648539 ~ 26653586 (-)
G54592 cdc14b non-coding downstream 6870 26546072 ~ 26551536 (-)
G54580 NA non-coding downstream 237913 26314592 ~ 26320493 (-)
G54574 NA non-coding downstream 381259 26139316 ~ 26177147 (-)
G54572 NA non-coding downstream 535302 26022850 ~ 26023104 (-)
G54524 NA non-coding downstream 563733 25939702 ~ 25994673 (-)
G54613 mrps27 non-coding upstream 101969 26671908 ~ 26676623 (-)
G54623 NA non-coding upstream 130657 26700596 ~ 26701882 (-)
LOC111192648 NA non-coding upstream 156712 26726651 ~ 26734830 (-)
G54651 NA non-coding upstream 179137 26749076 ~ 26749279 (-)
G54656 LOC108430339,LOC108265827,LOC107699644,LOC107560275,LOC107552154,LOC107714550 non-coding upstream 234662 26804601 ~ 26810668 (-)
fam240a LOC108441996 other downstream 996267 25549350 ~ 25562139 (-)
jcad NA other downstream 1560286 24950612 ~ 24998120 (-)
svil NA other downstream 1637816 24786251 ~ 24920590 (-)
G54205 kif5b,kif5bb,LOC108430866,LOC107753262 other downstream 2206470 24341400 ~ 24351936 (-)
G53996 NA other downstream 3466431 23091306 ~ 23091975 (-)
ccl28 NA other upstream 3461 26573400 ~ 26576425 (-)
LOC103024953 rnf165b,rnf165,LOC108430336,LOC108265796,LOC107726876,LOC107569673,LOC107712483 other upstream 191193 26761132 ~ 26779714 (-)
G54854 dhx37 other upstream 596747 27166686 ~ 27168510 (-)
G54873 NA other upstream 899279 27469218 ~ 27473347 (-)
G54947 NA other upstream 1158772 27728711 ~ 27731079 (-)

Expression


Co-expression Network