CI01000021_06746518_06768316 (CPEB2)


Basic Information

Item Value
gene id CI01000021_06746518_06768316
gene name CPEB2
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000021
NCBI id null
chromosome length 7014339
location 6743219 ~ 6771079 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

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Function

symbol description
cpeb2 Predicted to enable mRNA 3'-UTR binding activity and translation regulator activity. Predicted to act upstream of or within regulation of translation. Orthologous to human CPEB2 (cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2).

GO:

id name namespace
GO:1990124 messenger ribonucleoprotein complex cellular_component

KEGG:

id description
K02602 CPEB, ORB; cytoplasmic polyadenylation element-binding protein

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000021_06746518_06768316.mRNA False 1743 mRNA 0.56 14 6746518 6768340
TU135910 True 17066 lncRNA 0.39 7 6743219 6771079

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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CI01000021_06266751_06267607 NA coding upstream 478360 6264966 ~ 6268158 (+)
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CI01000021_06798250_06824148 CC2D2A coding downstream 29910 6798250 ~ 6824486 (+)
CI01000021_06906415_06933563 NA coding downstream 138075 6906415 ~ 6934141 (+)
CI01000021_06938981_06939825 NA coding downstream 170481 6938821 ~ 6939825 (+)
G119693 NA non-coding upstream 10140 6736161 ~ 6736378 (+)
G119692 NA non-coding upstream 12822 6733328 ~ 6733696 (+)
G119690 NA non-coding upstream 15794 6730482 ~ 6730724 (+)
G119689 NA non-coding upstream 16705 6729596 ~ 6729813 (+)
G119646 NA non-coding upstream 46453 6679261 ~ 6700065 (+)
G119724 NA non-coding downstream 111412 6879752 ~ 6880618 (+)
G119730 NA non-coding downstream 181133 6949473 ~ 6951481 (+)
G119731 NA non-coding downstream 184387 6952727 ~ 6952936 (+)
G119747 NA non-coding downstream 207447 6975787 ~ 6976016 (+)
CI01000021_04886787_04893309 PLAGL2 other upstream 1857010 4886337 ~ 4893474 (+)
G117493 NA other upstream 2710842 4033000 ~ 4035676 (+)
G117484 NA other upstream 2788766 3956146 ~ 3957752 (+)
G117202 NA other upstream 3418285 3269144 ~ 3328233 (+)
G117237 NA other upstream 3503154 3237854 ~ 3243364 (+)
G119701 NA other downstream 31804 6800144 ~ 6860606 (+)

Expression


Co-expression Network