G169254


Basic Information

Item Value
gene id G169254
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000034
NCBI id null
chromosome length 5914002
location 804693 ~ 816630 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU192273
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU192273 True 10626 lncRNA 0.36 3 804693 816630

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000034_00785411_00801907 NA coding upstream 2634 784545 ~ 803844 (+)
CI01000034_00735558_00738466 DESI1A, DESI1 coding upstream 65218 735487 ~ 739475 (+)
CI01000034_00683973_00725610 EP300, EP300B coding upstream 78788 683973 ~ 725905 (+)
CI01000034_00661553_00677752 XPP3, XPNPEP3 coding upstream 126216 661553 ~ 679148 (+)
CI01000034_00643011_00645310 RBX1 coding upstream 159383 642901 ~ 645310 (+)
CI01000034_00821815_00825192 NA coding downstream 3965 820595 ~ 825205 (+)
CI01000034_00860887_00862727 NA coding downstream 44257 860887 ~ 862901 (+)
CI01000034_00943362_00945523 NA coding downstream 126732 943362 ~ 945631 (+)
CI01000034_00951238_00955839 NA coding downstream 133837 950467 ~ 956087 (+)
CI01000034_01124686_01125224 NA coding downstream 308056 1124686 ~ 1126197 (+)
G169250 NA non-coding upstream 33577 770743 ~ 771116 (+)
G169245 NA non-coding upstream 40577 763886 ~ 764116 (+)
G169203 NA non-coding upstream 70600 733755 ~ 734093 (+)
G169205 NA non-coding upstream 71245 732615 ~ 733448 (+)
G169210 NA non-coding downstream 55372 872002 ~ 872400 (+)
G169259 NA non-coding downstream 58147 874777 ~ 875411 (+)
G169260 NA non-coding downstream 60180 876810 ~ 877053 (+)
G169262 NA non-coding downstream 76989 893619 ~ 910887 (+)
G169275 NA non-coding downstream 95371 912001 ~ 912287 (+)
G169309 NA other downstream 152631 969261 ~ 969921 (+)
G169357 NA other downstream 286910 1053543 ~ 1119019 (+)
G169394 NA other downstream 333667 1150297 ~ 1193560 (+)
G169340 NA other downstream 433589 1250219 ~ 1310878 (+)
CI01000034_01729413_01730790 EVE1 other downstream 909880 1729413 ~ 1731179 (+)

Expression


Co-expression Network