G170223


Basic Information

Item Value
gene id G170223
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000034
NCBI id null
chromosome length 5914002
location 4550495 ~ 4562847 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU193399
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU193399 True 11534 lncRNA 0.35 3 4550495 4562847

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000034_04525428_04534655 NA coding upstream 14811 4525001 ~ 4535684 (+)
CI01000034_04473631_04513799 RFX1, RFX1A coding upstream 35950 4473631 ~ 4514545 (+)
CI01000034_04364393_04367046 S1PR5, S1PR5A coding upstream 183291 4364314 ~ 4367204 (+)
CI01000034_04282490_04284734 NA coding upstream 264959 4282490 ~ 4285536 (+)
CI01000034_04260286_04274615 NA coding upstream 275093 4260286 ~ 4275402 (+)
CI01000034_04641898_04648112 NA coding downstream 78179 4641026 ~ 4648150 (+)
CI01000034_04728112_04738169 GAA coding downstream 164002 4726849 ~ 4738327 (+)
CI01000034_04746797_04771378 TBC1D16 coding downstream 183950 4746797 ~ 4771931 (+)
CI01000034_04811319_04813561 CBX4 coding downstream 248472 4811319 ~ 4814665 (+)
CI01000034_04818587_04820434 CBX8A coding downstream 253838 4816685 ~ 4821234 (+)
G170178 NA non-coding upstream 103586 4443628 ~ 4446909 (+)
G170205 NA non-coding upstream 133644 4410355 ~ 4416851 (+)
G170232 NA non-coding upstream 141236 4405633 ~ 4409259 (+)
G170563 NA non-coding upstream 187373 4362728 ~ 4363122 (+)
G170562 NA non-coding upstream 189185 4360819 ~ 4361310 (+)
G170579 NA non-coding downstream 58992 4621839 ~ 4622328 (+)
G170620 NA non-coding downstream 144816 4707663 ~ 4707873 (+)
G170644 NA non-coding downstream 209459 4772306 ~ 4773521 (+)
G170645 NA non-coding downstream 210813 4773660 ~ 4777068 (+)
G170680 NA non-coding downstream 231399 4794246 ~ 4794445 (+)
CI01000034_04192675_04200041 NA other upstream 352294 4192311 ~ 4200636 (+)
CI01000034_04125435_04125780 RPRML other upstream 423684 4125100 ~ 4126825 (+)
CI01000034_03432846_03437608 NDUFA4, NDUFA4L other upstream 1098646 3432846 ~ 3438839 (+)
G169806 NA other upstream 2212805 2317973 ~ 2337690 (+)
CI01000034_01729413_01730790 EVE1 other upstream 2819318 1729413 ~ 1731179 (+)

Expression


Co-expression Network