G146747


Basic Information

Item Value
gene id G146747
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053125.1
NCBI id CM020922.1
chromosome length 39125861
location 28350866 ~ 28353668 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU198139
AACGTGTTTTGTAAATCAAACACTCTGCAGCAGCAGAGAACAGCACAGAACaacgtacacacacagaacgtatTTAACACAAACACTTTACATACATGGTGAAACTAAGTATCTGGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTTAGATCATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATCAAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATCAAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAAATTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAAAGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGCGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGCGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGCGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGATCGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGATCGTATTTAACATGATAGAATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGGGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTAGAGCAGAACGTGCGTCAGTGCGTGGAGCCGAAGCTGCCGTCTGGCGGCCGGTACAGTTTGGGGAAAGTGAGGAGCTGAACGCCGCTGAAGGCAAACTTCCTGCTGCCCACGTTCTTCTGCACGTTCTCCAGCCTGCAACCGTCCCTGggaacgcacacacagacacacacaacacacacacatacacacgcacagacacacacacaatacatacacacacacgcacagacacacacaatacatacacacacacgcatgcacagacacacacaatacatacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacaatacatacacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacaatacatacacacgcacacacagacacacacaatacatacacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacagacacacaatacatacacacgcacacacacacacacacaatacatacacacgcatgcac
>TU198142
AACGTGTTTTGTAAATCAAACACTCTGCAGCAGCAGAGAACAGCACAGAACaacgtacacacacagaacgtatTTAACACAAACACTTTACATACATGGTGAAACTAAGTATCTGGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTTAGATCATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATCAAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATCAAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAAATTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAAAGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGCGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGCGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGCGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGATCGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGATCGTATTTAACATGATAGAATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGGGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTAGAGCAGAACGTGCGTCAGTGCGTGGAGCCGAAGCTGCCGTCTGGCGGCCGGTACAGTTTGGGGAAAGTGAGGAGCTGAACGCCGCTGAAGGCAAACTTCCTGCTGCCCACGTTCTTCTGCACGTTCTCCAGCCTGCAACCGTCCCTGggaacgcacacacagacacacacaacacacacacatacacacgcacagacacacacacaatacatacacacacacgcacagacacacacaatacatacacacacacgcatgcacagacacacacaatacatacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacaatacatacacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacaatacatacacacgcacacacagacacacacaatacatacacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacagacacacaatacatacacacgcacacacacacacacacaatacatacacacgcatgcac
>TU198144
AACGTGTTTTGTAAATCAAACACTCTGCAGCAGCAGAGAACAGCACAGAACaacgtacacacacagaacgtatTTAACACAAACACTTTACATACATGGTGAAACTAAGTATCTGGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTTAGATCATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATCAAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATCAAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTAACGTGATAGAACATATGTACAGAACGTGTTAACGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTGTTTAAATTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGATAGAACATGTGTACAGAACGTATTAACGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTAAAGTGTTAGAACATGTGTACAGAACGTATTTAATGTGATAGAACATGTGTAGAGCAGAACGTGCGTCAGTGCGTGGAGCCGAAGCTGCCGTCTGGCGGCCGGTACAGTTTGGGGAAAGTGAGGAGCTGAACGCCGCTGAAGGCAAACTTCCTGCTGCCCACGTTCTTCTGCACGTTCTCCAGCCTGCAACCGTCCCTGggaacgcacacacagacacacacaacacacacacatacacacgcacagacacacacacaatacatacacacacacgcacagacacacacacaatacatacacacgcacacacagacacacacaatacatacacacgcacgcacagacacacacaatacatacacacgcacacacagacacacaatacatacacacgcacacacacacacacacaatacatacacacgcatgcac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU198139 True 2100 TUCP 0.38 3 28350866 28353668
TU198142 False 1850 TUCP 0.39 3 28350866 28353668
TU198144 False 1219 lncRNA 0.40 4 28350866 28353668

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120572284 LOC103373335 coding upstream 54884 28275398 ~ 28295982 (+)
LOC120572283 LOC103147980,LOC103369207,LOC106934234,LOC108243879 coding upstream 136834 28198923 ~ 28214032 (+)
LOC120572575 LOC108243880,LOC108243879,LOC108243890,LOC108243930,LOC108229645 coding upstream 167889 28175931 ~ 28182977 (+)
abce1 abce1 coding upstream 464457 27859806 ~ 27886409 (+)
LOC120572571 LOC108249162,LOC101468201,LOC107376820,LOC101171440,LOC102781423,LOC100704195 coding upstream 514609 27805878 ~ 27836257 (+)
LOC120572286 NA coding downstream 29287 28382955 ~ 28385310 (+)
txk txk,LOC108249159 coding downstream 55877 28409545 ~ 28446660 (+)
LOC120572276 cdkl2,LOC103363889,LOC102296890,LOC105921304 coding downstream 98325 28451993 ~ 28467121 (+)
LOC120572291 NA coding downstream 259108 28612776 ~ 28613543 (+)
LOC120572212 NA coding downstream 308952 28662620 ~ 28670821 (+)
LOC120572289 NA non-coding upstream 134998 28214699 ~ 28215868 (+)
G146703 NA non-coding upstream 268808 28075818 ~ 28082058 (+)
G146700 NA non-coding upstream 287573 28062803 ~ 28063293 (+)
G146699 NA non-coding upstream 297598 28051970 ~ 28053268 (+)
G146676 NA non-coding upstream 323515 27997612 ~ 28027351 (+)
G146756 NA non-coding downstream 76313 28429981 ~ 28453160 (+)
G146765 NA non-coding downstream 111775 28465443 ~ 28544749 (+)
G146778 NA non-coding downstream 167259 28520927 ~ 28529168 (+)
G146779 NA non-coding downstream 172617 28526285 ~ 28526703 (+)
LOC120572290 NA non-coding downstream 185677 28539345 ~ 28548694 (+)
G146739 NA other upstream 52590 28297774 ~ 28298276 (+)
LOC120572279 LOC103147982,LOC108243879,LOC108243930,LOC108243880,LOC103369207,LOC108243890 other upstream 77008 28218812 ~ 28273858 (+)
LOC120572278 NA other upstream 127735 28190844 ~ 28223131 (+)
LOC120572281 NA other upstream 182519 28158338 ~ 28168347 (+)
G146671 NA other upstream 236784 28060562 ~ 28114082 (+)
G146757 NA other downstream 45598 28399266 ~ 28401350 (+)
G146753 NA other downstream 201884 28555552 ~ 28585067 (+)
tec tec other downstream 264197 28617865 ~ 28651546 (+)
G147035 NA other downstream 675814 29029482 ~ 29065509 (+)
G147192 NA other downstream 915746 29269414 ~ 29480487 (+)

Expression


Co-expression Network