G138675


Basic Information

Item Value
gene id G138675
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 14976262 ~ 14979677 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU204725
GTTTTCTTTCCCGccagtgtgttttattttgcataaatacatttcagcacAAGGATTTCAGCTTTGCAAAACTGCCTCCTAGTGTTAACTTGTGGTGTCGCACTTACAGAGAAATTTCTATCCAAATTTctcattgtaataataatattaataataatagaaaaccGCTTCGGAATTAGATGTTTATTCAACTATTTGCCTATAACTATTTGACCCCTAAACAgaatcacaatattacagtttatatataaataaccacGTACGCATTTCAATTgttcagttttcttttcatGGACATATTTCAACAGGTAAACATATCAGCATTATTCAAGAGTTCATTTAACTCAACATAGTACAATACCACTTGCACACAAAAAATGCTGCAATAGTGTAATATACATCAAATCTTTAACAATATAACGCCGCCATCAATGCTAGGCATCACAACGGTTTCAGTCCGCATACATTTCACTCAAGTTTGTGTGATGTTGACTTAAGCAGGAGAAAAACATCATTCTGTGCGCTGTGAGGAAATTAAACCACATCGATTCCAGAATCATCTAAAGAGTAAAAGTTGAAACATTCCAACTATTCTAAATCAGCTAAATAGTGATTATTGATGGAAAAAAAGAGCTTGATGCACTACTGGTATAAAATACCACATTAAATGATACTATTTGAGTAAATTAGTGAGTGACCTCAGATTAATGAGATAAAAATCCTTGCATTCATTTACAATCACAGTGGACCAGAACTGGTAAGCAGCACGTTTGGTGacggtatttttttttttttacagtgcttttacagaaaacaagctTAGATTGTTACAGTGACGTGTGACGTTTCATCAATTCATCATTCAAGAAAACATGTATTACCTTGAAAGGGCATTCATTGGTCAAGGTTTTAGCATTCGTGAATTTCATAGAAAGCGGAATCAGATCTGAATAATATTCACATGAAGTCCCataacaaaacacaagaaagaATATGCTGCTAAAGCCATATAACCAGGAactgttcacccaaaaatgacaatttgcCTAAAAATCACCCTTATGTCTTTCAAGATGTAGAcaagtttgttttaaatctgaatagATTTGAATCAATTTAGCAGAACCTGTTCACCAGAGGCTCctttgtagtgaatgggtgccatcggaatgagtttaaacagctgattaaaaacatcataataatccacatgactctaGTCCACCAATTAACATCTTGGAAAACGGAAAGCCGTGTCTGAGAGAAACAAATCATCATTAAGAcactatccataatattgctttttctAATTCAAGAGAGACATACGCACAGAttaagcactgtttacaagAGAAGACCAAAcgtgttggtgttttttttgtttttaggagaCAATAGCAGATGAACTTTTACTTTAGTTTAAACTTACAAACAGTGTTTCTTACAAAACACACAACTTTTCACCTCACAAGACATTTATTGTTGCTTACTTGTGGattaattgtgatgtttttatcagcagtttggactcttattttgacggcacccattaaTTGCAAAGGATCCATTGGTGGGCAAGTGTtgctaaatcaaaataaaacatcatgcTAATTTCTCCTGTTATGATAACTCATCTGCATATAGGATAGCCTGAGGGTGTGTAAATATTCAGgaggacattttcatttttgattgaactattccttcaaatAAACCATTTGGTCAGTGCTGCCTTGCACTTTTAATCAActtgtattttatatgttaacttaaatataatgtttgacTGGCTCTTAATGTGTGGCTTGAAtgagcataaataaataatgtacaattGCACTGCAGTGGCCTTTCGATCTCGTTTTTCCTACtgagaaaaataatgttaatatacatatactataATCTGTAACGTTCCATCCTAATTCACagtcaattttaaataaataatgattaagaaataatatttataagaaTCAGCAGGAAATAAGCCATTAAAGGCACCAAACACTGTTTAACAAGAACTGTCgattttggaaaatgaaattcAATATGTAAACGTAacataaatatggaaaaaaaaggtAGTCACTTCCTGTCCTCAGCACCAGCAGGACTTACTGGCGTCGTCGCTAACATTACACAATCCTTCCTGCTCCTCCAAAACGGCGAGACTGAACTCGTCGTTCATGGATCCTCCCAACAAATCAAGATCCTTCTTATTGGCTTGTAAGACTAATTCGGCCAATCGGGTGAAAGACTGTTAATAAAGGAAAGATAAAAAAACGTTAGCTGTAGATAATGCAAACGTGCAAACAAAAGAATCAAACGGTCGCGTGGCTTCACTAttactcatatttaaaaagaaacaatatataaaatacagaaacaacgagaagaaaaaacacaaaattggaCCTCTGTAATGTTGTGGTTGGTAAAGGCACTTGTCTCAAAAAAGTCCATTCCATAAGCCTTGGCAAGCTGGAGCGAAAAAGAAGATTAATGTCTGAAAAGTGTCAATATCAGTATGAATGAAAGACGCAGTTCACAGGAggatgatattatttatttaccttattTCCCTGTTCTGTAGCTACTTGTCTCTTCTGTTCTTCATCAGACTTGTTCCCAACAAGTATCTTCTGCACTTTTTCAGGGGCGTACTGATCAGAAACACAAcagacgaggaggaggagacaCTCAGTAGAGGCAAATTGATGGGGAAAAGCAGAAACAGACAAATATTATGAAACAGAGTTCATACTACAGAACCAATACGGTTTTTATGAAGCTtttttgatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatcaggACATACATTATTTCTCAGAAAGGGGACcaagttttaaatgtaacatgaaTAATACAGTGGGAtttgattatttctttatattttctaattttgtATATTACTAGTAAAAATTGGTAAAAAGTAATTAACTTGCTTAGTGTCCCAGAAATAAgtgcatattatattttttacatcatAATGCTTCtaagtttttcctttttcctaAATCCCTAAACGTTCAATTTCTGTTAATTCAATTCGATTTCAAGTCTAAAGCTGctgtaaagagagaaagaggggtgCGGTGGAATTTAAATAATGAGATATTAATAAGAAGCGGGTTATATTTAGTTACAGTAAGACAGCTATGCTTTAAACTCCACAGCCTCACCTCATCTACGTCGCTGGCCCACTTCATGATGTGCTGGAACGAGCGCTCGCTTGTGATGTCATACACCAGAAAAA
>TU204727
taagttttataaatgtttattccCCAGTTCTGAGTATTATATAACACTGTAAACACATTCATCGTCCCGTTTTCTTTCCCGccagtgtgttttattttgcataaatacatttcagcacAAGGATTTCAGCTTTGCAAAACTGCCTCCTAGTGTTAACTTGTGGTGTCGCACTTACAGAGAAATTTCTATCCAAATTTctcattgtaataataatattaataataatagaaaaccGCTTCGGAATTAGATGTTTATTCAACTATTTGCCTATAACTATTTGACCCCTAAACAgaatcacaatattacagtttatatataaataaccacGTACGCATTTCAATTgttcagttttcttttcatGGACATATTTCAACAGGTAAACATATCAGCATTATTCAAGAGTTCATTTAACTCAACATAGTACAATACCACTTGCACACAAAAAATGCTGCAATAGTGTAATATACATCAAATCTTTAACAATATAACGCCGCCATCAATGCTAGGCATCACAACGGTTTCAGTCCGCATACATTTCACTCAAGTTTGTGTGATGTTGACTTAAGCAGGAGAAAAACATCATTCTGTGCGCTGTGAGGAAATTAAACCACATCGATTCCAGAATCATCTAAAGAGTAAAAGTTGAAACATTCCAACTATTCTAAATCAGCTAAATAGTGATTATTGATGGAAAAAAAGAGCTTGATGCACTACTGGTATAAAATACCACATTAAATGATACTATTTGAGTAAATTAGTGAGTGACCTCAGATTAATGAGATAAAAATCCTTGCATTCATTTACAATCACAGTGGACCAGAACTGGTAAGCAGCACGTTTGGTGacggtatttttttttttttacagtgcttttacagaaaacaagctTAGATTGTTACAGTGACGTGTGACGTTTCATCAATTCATCATTCAAGAAAACATGTATTACCTTGAAAGGGCATTCATTGGTCAAGGTTTTAGCATTCGTGAATTTCATAGAAAGCGGAATCAGATCTGAATAATATTCACATGAAGTCCCataacaaaacacaagaaagaATATGCTGCTAAAGCCATATAACCAGGAactgttcacccaaaaatgacaatttgcCTAAAAATCACCCTTATGTCTTTCAAGATGTAGAcaagtttgttttaaatctgaatagATTTGAATCAATTTAGCAGAACCTGTTCACCAGAGGCTCctttgtagtgaatgggtgccatcggaatgagtttaaacagctgattaaaaacatcataataatccacatgactctaGTCCACCAATTAACATCTTGGAAAACGGAAAGCCGTGTCTGAGAGAAACAAATCATCATTAAGAcactatccataatattgctttttctAATTCAAGAGAGACATACGCACAGAttaagcactgtttacaagAGAAGACCAAAcgtgttggtgttttttttgtttttaggagaCAATAGCAGATGAACTTTTACTTTAGTTTAAACTTACAAACAGTGTTTCTTACAAAACACACAACTTTTCACCTCACAAGACATTTATTGTTGCTTACTTGTGGattaattgtgatgtttttatcagcagtttggactcttattttgacggcacccattaaTTGCAAAGGATCCATTGGTGGGCAAGTGTtgctaaatcaaaataaaacatcatgcTAATTTCTCCTGTTATGATAACTCATCTGCATATAGGATAGCCTGAGGGTGTGTAAATATTCAGgaggacattttcatttttgattgaactattccttcaaatAAACCATTTGGTCAGTGCTGCCTTGCACTTTTAATCAActtgtattttatatgttaacttaaatataatgtttgacTGGCTCTTAATGTGTGGCTTGAAtgagcataaataaataatgtacaattGCACTGCAGTGGCCTTTCGATCTCGTTTTTCCTACtgagaaaaataatgttaatatacatatactataATCTGTAACGTTCCATCCTAATTCACagtcaattttaaataaataatgattaagaaataatatttataagaaTCAGCAGGAAATAAGCCATTAAAGGCACCAAACACTGTTTAACAAGAACTGTCgattttggaaaatgaaattcAATATGTAAACGTAacataaatatggaaaaaaaaggtAGTCACTTCCTGTCCTCAGCACCAGCAGGACTTACTGGCGTCGTCGCTAACATTACACAATCCTTCCTGCTCCTCCAAAACGGCGAGACTGAACTCGTCGTTCATGGATCCTCCCAACAAATCAAGATCCTTCTTATTGGCTTGTAAGACTAATTCGGCCAATCGGGTGAAAGACTGTTAATAAAGGAAAGATAAAAAAACGTTAGCTGTAGATAATGCAAACGTGCAAACAAAAGAATCAAACGGTCGCGTGGCTTCACTAttactcatatttaaaaagaaacaatatataaaatacagaaacaacgagaagaaaaaacacaaaattggaCCTCTGTAATGTTGTGGTTGGTAAAGGCACTTGTCTCAAAAAAGTCCATTCCATAAGCCTTGGCAAGCTGGAGCGAAAAAGAAGATTAATGTCTGAAAAGTGTCAATATCAGTATGAATGAAAGACGCAGTTCACAGGAggatgatattatttatttaccttattTCCCTGTTCTGTAGCTACTTGTCTCTTCTGTTCTTCATCAGACTTGTTCCCAACAAGTATCTTCTGCACTTTTTCAGGGGCGTACTGATCAGAAACACAAcagacgaggaggaggagacaCTCAGTAGAGGCAAATTGATGGGGAAAAGCAGAAACAGACAAATATTATGAAACAGAGTTCATACTACAGAACCAATACGGTTTTTATGAAGCTtttttgatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatcaggACATACATTATTTCTCAGAAAGGGGACcaagttttaaatgtaacatgaaTAATACAGTGGGAtttgattatttctttatattttctaattttgtATATTACTAGTAAAAATTGGTAAAAAGTAATTAACTTGCTTAGTGTCCCAGAAATAAgtgcatattatattttttacatcatAATGCTTCtaagtttttcctttttcctaAATCCCTAAACGTTCAATTTCTGTTAATTCAATTCGATTTCAAGTCTAAAGCTGctgtaaagagagaaagaggggtgCGGTGGAATTTAAATAATGAGATATTAATAAGAAGCGGGTTATATTTAGTTACAGTAAGACAGCTATGCTTTAAACTCCACAGCCTCACCTCATCTACGTCGCTGGCCCACTTCATGATGTGCTGGAACGAGCGCTCGCTTGTGATGTCATACACCAGAAAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU204725 False 3304 lncRNA 0.34 2 14976330 14979677
TU204727 True 3376 lncRNA 0.34 2 14976262 14979677

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
dpf3 dpf3,LOC107562702,LOC107721322,LOC107659173,LOC107602065,LOC107668213,LOC107756570 coding upstream 131644 14814091 ~ 14844618 (+)
zfyve1 zfyve1,LOC107721321 coding upstream 168299 14800740 ~ 14807963 (+)
rhov rhov,LOC107602886,LOC107659156,LOC107721274,LOC107562688,LOC107668201 coding upstream 189133 14784795 ~ 14787129 (+)
chac1 chac1,LOC107739370,LOC107668209,LOC107721326,LOC107659180 coding upstream 233475 14740810 ~ 14742787 (+)
dll4 dll4,LOC107602157,LOC107721368,LOC107739369,LOC107668208,LOC107562694,LOC107659149 coding upstream 240107 14728275 ~ 14736155 (+)
fntb fntb,LOC107721314,LOC107671778,LOC107756604,LOC107668263,LOC108424508,LOC108257588,LOC106571088 coding downstream 5956 14985633 ~ 14996224 (+)
acot20 si:dkey-11e23.4,LOC107668224,LOC107756598 coding downstream 58060 15037737 ~ 15041884 (+)
gpr176 LOC107671784,LOC107721385,LOC107602001,LOC107668268,LOC107549088 coding downstream 63762 15043439 ~ 15052138 (+)
katnbl1 LOC107668266,LOC107721278,LOC107671774,LOC107756597,LOC107601956 coding downstream 179310 15158987 ~ 15162918 (+)
emc7b emc7,LOC107721381,LOC107549094,LOC107671783,LOC107756596,LOC107668257,LOC107601948 coding downstream 183847 15163524 ~ 15165910 (+)
LOC122324711 NA non-coding upstream 71751 14903324 ~ 14904511 (+)
G138606 NA non-coding upstream 181458 14794594 ~ 14794804 (+)
G138605 NA non-coding upstream 183330 14792621 ~ 14792932 (+)
G138604 NA non-coding upstream 187870 14788132 ~ 14788392 (+)
G138590 NA non-coding upstream 228282 14747062 ~ 14747980 (+)
LOC122325557 NA non-coding downstream 77539 15057216 ~ 15076661 (+)
G138726 NA non-coding downstream 279318 15258995 ~ 15278536 (+)
G138732 NA non-coding downstream 311809 15291486 ~ 15292209 (+)
G138743 LOC107693241,LOC107721299,LOC107549105,LOC107756581,LOC107668234,LOC107580993 non-coding downstream 388514 15368191 ~ 15368542 (+)
G138763 NA non-coding downstream 457771 15437448 ~ 15437736 (+)
LOC122324585 kif26aa,LOC107721264,LOC107602192,LOC107711661,LOC107668200,LOC107569886,LOC107659150 other upstream 705924 14210022 ~ 14270338 (+)
prima1 si:dkey-85n7.6,LOC107602279,LOC107659191,LOC107583807,LOC108424448,LOC103041400 other upstream 828349 14126015 ~ 14147913 (+)
si:dkey-85n7.8 si:dkey-85n7.8,LOC107602311 other upstream 866658 14108293 ~ 14109604 (+)
tmem251 tmem251 other upstream 921429 14051969 ~ 14054833 (+)
syne1a LOC107737324,LOC107665323,LOC107556168,LOC107659217,LOC107555741 other upstream 1304987 13571846 ~ 13671275 (+)
slc10a1 slc10a1,LOC107668231,LOC107671779,LOC107756602,LOC107721315 other downstream 23733 15003410 ~ 15015372 (+)
aven aven,LOC107549092,LOC107756595,LOC107671777,LOC107601941 other downstream 189678 15169355 ~ 15190219 (+)
LOC122325444 rps7,LOC107668222 other downstream 742184 15721861 ~ 15922280 (+)
G138869 LOC107732629,LOC107726464,LOC107693230,LOC107549112,LOC107601686 other downstream 783437 15763114 ~ 15797028 (+)
henmt1 henmt1,LOC107710559,LOC107698398,LOC107555628,LOC107601273,LOC107726462 other downstream 2517218 17496895 ~ 17502015 (+)

Expression


Co-expression Network