RNA id: XM_022681933.1



Basic Information


Item Value
RNA id XM_022681933.1
length 12009
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 11
gene id LOC103031091
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035917.1
NCBI id CM008320.1
chromosome length 21661149
location 13988809 ~ 14040245 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome
species mexican tetra
(Astyanax mexicanus)

Sequence


CTGGCAGCAGCGGCGCAGAGCGGAGCGACTGTACGGAGCCCGGGGGGAGAGAGCGCGCGGAGCGGCGGGGCTACAGCGGCGGAGACACACGGGACCACACACCTGTTTAAGGGCTGAGGAGGTGAAGAGCCGCGCGGAGCCGCGGAGAGAGAGCGGGGTGCGGACCACCTCTGTAAACAGGAGCGAAGTGGAGGAGGAAACTCTTCCTGTTCAGAAGAAGTCTGATCTGAGGAGTTCCAGcgctgagagagaggagatacagagagagacactgtgagTCTGAGGGTCTGTGAGGAATGGAGAGAAAGCACTGGACGACTAAAAATACTGACAAGTCAAAATGGACAACTAGCCACATGCTCCCCTGCTCCTCACCTTCATATTTATCCTGAAGATTTAGTTTTTGGATTTGTGGATATCCTTATACTCCTACCGTGTTGGACTTTGGACTCCATCAGTTTATCTTCTGTGAGATTTGAATGGTCAGCAGATCCTGGACctgtttttttggttctgaAGTTATAAATATAAGGCTAAAGGATAAACAATAAACACCCTCTCTAAAGAGCTTCGATAAGGCCTCAAATATGAGCAAACTTTCTAGGGTAGTACGCTAAATCGTATTTTTATCAATATTGTTTTTATGAACTCCTTGAATAGCTCCTTGAAAATTGCACTACCTGCTTGCAGCAACAGAGGCTAGTGCTGTATgatagtgtatttttaattgttattcTGATACACATTTTTGAACCAGCTTCGATAAAGCCTTGAATAtcagcagaataaaaaaaattgcattaccTGCAGACTGCTATGTCTGtacgataaatcgctttttaaaGTTAATCACAATAAGAGATTTCACGATAAACACCTgaggcaaacaaacaaaagagctGCGATAACTACTTAAATAACCCTGAATTGCATTGCTTGCTTGCAGCAACAGAGGACTGTAcgataaatcatattttcttCATTATCGCAATATGAGTTTTTAGAGTAAAGGGCTGTGAtaactttttaaataacagcAAACCCAAAATGCTTTATCTTTGTGCGGCACAAGAGGGAGTTCTTCCTGTTACAGGCTAGTAtgataaattagatttttagcATTATCGTGATATGAGAGATAAGGTTTATCGTAAGAGGCCCGATTGCAGCCAAGCCAAGTGCCAGAAACTAGTTTAATGGGATACACAACGGTGTTATCacacattgtgttttttgtctatATTGGGCTTCCGTATGTTCCTCCATTCCTCTCCATGTTCTTTCAGCTCTGTAAGAAGCAGAAGCTGAAGTGAGCTCAAGTACGTAAGTGCATGGAGACCAGTTGGTGTCCAGGTTCCAGGTTCTCCCACACACAACCCATTCTTTGGTTAACTTTCTTTTGGCCTAAAGCCTGACTAAAGCCTGCCCCAAACTTCCATGGAGCCGTAGGCCTGTGATATCCATGTCCACAGTTGTTGGGGTGTCATTGTGGAGTGCTCTGGCTGGCGATGGCTGTGTGACCTTGCACTGCTTGTGCTTGAAGCTGGATGCAGAAGGCCCTCATGAACCTTCCAGAGGGGTCGCATCGGGAGAGAGGCGACGGGAAGTACACAGTTCGACAAATCAAGTCGCCATTTAAACCACGTTGTGCACAGAGAACCACACATGGAGCCGCTGAAGAGCATATTTACCCGCGGCCCTCTGGTGCCCTGGAAAAGCCTGCAGGACTCTCAAAAAGGGAGCTTCAGCAACCCGGTGTGGACCGCTTTGTTCGATTATGAAGCATCAGGAAAGGATGAGCTGACCCTGCGCAAGGGAGATGTTGTGGAGGTCCTGTCTTTGGACTCTGAGGTGTCTGGAGACGAGGGCTGGTGGGCGGGCAAGGTGAACAACAAGGTGGGCATCTTCCCCTCCAATTATGTCTCGCTCAAGCCCAGTGGCTATGGTAAACTGCCCCCTAGTGTGGGCGACGTGGCCCACGAGCTACAGTTTGAGCCTGAGGTGGTGGATTTTCGGGAGTTGAGCCTAGAGGAGGTCATAGGGGTTGGAGGCTTTGGGAAAGTGTACCGGGGCACCTGGAGAGGCGGGCTGGTGGCCGTCAAGGCAGCTCGGCAGGATCCGGATGAGGATATTAGTGTGACTGCGCAGAATGTGCGCAACGAAGCAAGACTCTTCGCCATGCTTACGCATCCCAACATCATCGCCCTCAAAGGGGTGTGCCTGCAGGAGCCCAACCTGTGCCTCATCATGGAGTACGCTTCCGGTGGGCCGCTGAGCCGGGCCCTGGCCGGCAGACGCATCCCGCCGCACGTCCTGGTGAACTGGGCCGTGCAGATCGCTCGAGGGATGCTGTACCTGCACAATGAGGCCATAGTACCTGTCATCCACCGTGACCTCAAATCAAACAACATCCTGCTGGCTCAGCCGATAGAGATAGATGGTATTGAGGGTAAAACTCTGAAGATCACGGATTTCGGACTGGCCCGAGAGTGGCACAAGACCACCAAGATGAGCACGGCTGGCACCTACGCCTGGATGGCACCAGAAGTCATCAAATCCTCAACCTTCTCCAAGGGCAGTGATGTATGGAGttACGGTGTGCTGCTGTGGGAGCTGTTAACAGGTGAGGCGCCGTATAGAGGTATAGATGGTCTGGCTGTGGCATATGGAGTGGCCGTCAACAAGCTGACCCTTCCAATCCCCTCTACCTGCCCCGAACCATTCGCCCAACTCATGGCAGagtgctgggatCAGGACCCCCACCGCAGGCCAAGTTTTGCCTCTATCCTGTCTCAGCTGTGTGCTCTGGAGCAGCAGGTGATGGAGGAGATGCCCCAGGACTCCTTCCACTCACTGCAGGAGGACTGGAAACTGGAGATCCAGGACATGTTTGATGAGCTGCGTGCCAAggaaaagGAGCTGCGGTGTCGTGAGGAGGAGCTGAAACGTGCGGCTCTGGAGCAGAAGTCTCACGAGGAGTTCCTGCGTCTGCGAGAGCAGCAGCTGGCGCAGTGGGAGCAggatgtgtttgagagagaacTGTCTCTGCTCATCCTCCACCTCAACCAGAACCAGGAGAAACCCAATGTCAAGAAGCGAAAAGGCACCTTCAAGAAGCACAAACTGAAGAGCAAGAACGGAGAGAAGATCAGCATGCCACAAGattttatCCATAAGATCACAGTGCAGGCGTCTCCTAGACTGGAAAAGAGACGGAACTCTCCGGATTTGGGTTCTCCTTCAATTGGCCCTCGCTTCCGTGCTATCCAATTAGTCAGCCCTGGTGACAGTAAGTGGAACTCTGTCTGGCCCCTGGAGTCTCTTCCTCTGAAGCAGCCAAACGGGGAGCGCCGAGTACCCCCCCACTGGAGCCCCCAAAGTCCGAAGAGCCCTAAAAGCCCTAAAATGCTGCGCCTGAGCCCACAGGACAGCggtcTGTCTATGAGGGCCAGGCTTCTGGAGATGGACAGCAATGAAAACGGCGAGTTCAAAGATGATTTTGAGGAGTACAGACCCACCACGCCAGAACCAAGCCAAAACGGCTCCAGCTTAGGGAAAGAGCCTTCTTGGACAGCTCTTCCTGAAGAGGATTCTGGGAGTGAGGAGGGCTGTTTATCCCACCGCAGTTCCCCAAACCCGGACTGCCGCTCCAGCATGCCTGCTCACGTTAAAAGCACTCACCAGGCTTTGCTCAGCAGTGCCTCGCTGCTGGCCTCTGTGGCTCTGGGCCGTTATTTAGAGCCCCAGCTCCCACCAACTCCCCCTCCACGAACTGCCCCCAGGACTAAATCCCCTGCACTGGAGCGTGAGCTCCCCACAGTGGCTATAGAGTACATACCCACAGACCCAGCTGTGGTTGAGGATCTTATAACATTCAGTACAGACTCTCTGCCTCAAGAGATATTTGAAGCTCAACTGAAGCCACCAGAGACTAAACCCTTACCCCTGactcctcctccaccaaaccCCAGAGACAGGTCAGGTCGCAGAACCCCCCAGCACAGCTCCGCAGAGTGGATCACTCAGGCTAACGGAGAGACGGCAAGCGAAGTTGTGAGTCAACCTGGAGAAAGGAGGAGAAGATCAAGTCAAGGACTTTCCTCACAATTAGTGTTGGACCTACCCTTGTGCCAAGACACTATGGTGGACGCTGACGACAAATCCCCCACCCCATTCGCTCTGTATCCAGACCCTCGCCTTTGGAGCCCCAAAACCCGCCGCCTGGAGGTCAACATCATCCCCCGGCCCAGGCCATCCCCCATCCGTCCCCGGATCGATCCCTGGAGCTTCATTTCGGCTGGTGTGACCGAAAGAAGCAACTCGCGGAACAACCTCACTTCCAGCAGCCCCACAAGTCCGAGACAGGGGTTCCAGCCCTCACCCACCAATCCCTTTACGAACTGTGACCCATTTCCCTCACCTGACTGTGACCCTTTCAGCCTCAAGGCTGACCCCTCTGTGAATTCTGACCTTCCCTCCCCCTTTGACCCTTTTTCTGCACCTTTCCCTACGTCTCGCTCCGCACCGTGCTCCACTAACGGCAGTCCTAACCTCTCTCTCAGGGTTGCTCCACTGAATCCAGCTGACTCCCCACTCATTGACCTGGGCTGGGCAGGGGTCAGCAAGCCCCTAGCTATTGCCAAAGAAAAAGTTTGCCCTAAGAGAGTTCTGGGTTTAAGTCCCTTCAGTCCCCTTAGAGATGACAGATTCTGAACTTTAAAGAGGGATTGTTACCTGTCTAGTTCGGGGCACCCAAGCTGCAGTTGGCCTTGAGATTTGGTGCTTTGGAGGTCTCTTTGGAGTTCTCTTTGGTGTTCCTTGTGGAAAGAAATGGGAGGAAAATGCACAATCGccctagtttaaaaaaaaaaaagaaagaaaaaaaaaaaaaaaagtgccccaaacagtgtgtgtgtctgctctTTTATAATGTTGGCTTAAACAGAGTGAAACTTAATATTTACAAACCTTTATGCACTTCAGCAGCCAGAAAGGATTAT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Function


GO: NA

KEGG:

id description
K04419 MAP3K11, MLK3; mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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XR_002651527.1 lncRNA upstream 139860 14180105 ~ 14185344 (-) True LOC111195216
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XR_002651551.1 lncRNA upstream 913199 14953444 ~ 15001573 (-) False LOC111195232
XR_002651554.1 lncRNA upstream 913199 14953444 ~ 15001524 (-) False LOC111195232
XM_007230158.2 mRNA downstream 160993 13813398 ~ 13827899 (-) True LOC103028152
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XM_007230155.3 mRNA downstream 181566 13799521 ~ 13807326 (-) True LOC103027614
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XM_007230172.3 mRNA upstream 23399 14063644 ~ 14088334 (-) True LOC103032041
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XM_022681550.1 mRNA upstream 159978 14200223 ~ 14207686 (-) True LOC103033946
XM_015606302.2 mRNA upstream 298469 14338714 ~ 14340598 (-) True LOC103042598
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TU249404 other downstream 1792234 12195212 ~ 12196658 (-) True G184051
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TU250431 other upstream 1337122 15377367 ~ 15380444 (-) False smim18
XR_452782.3 other upstream 1337463 15377708 ~ 15381208 (-) False smim18

Expression Profile