RNA id: TCONS_00017639


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00017639
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_008927
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 2265969 ~ 2266083 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tccggcagctagctctctgcaactctcacatggtcacctactaaagctaagcagggctgtgcctggtcagtacctggatgggagaccacatgagaaagctgGGTTGCTGATAGGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185617

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00017629 lncRNA downstream 380730 1855023 ~ 1885239 (-) True XLOC_008923
TCONS_00017624 lncRNA downstream 431147 1830270 ~ 1834822 (-) False XLOC_008922
TCONS_00017613 lncRNA downstream 540485 1721587 ~ 1725484 (-) False XLOC_008918
TCONS_00017607 lncRNA downstream 654276 1606849 ~ 1611693 (-) False XLOC_008915
TCONS_00017604 lncRNA downstream 675174 1589813 ~ 1590795 (-) False XLOC_008914
TCONS_00017640 lncRNA upstream 57583 2323666 ~ 2328145 (-) False XLOC_008928
TCONS_00019112 lncRNA upstream 57583 2323666 ~ 2328284 (-) True XLOC_008928
TCONS_00017644 lncRNA upstream 251700 2517783 ~ 2519603 (-) True XLOC_008930
TCONS_00018809 lncRNA upstream 324298 2590381 ~ 2596121 (-) True XLOC_008931
TCONS_00017646 lncRNA upstream 332721 2598804 ~ 2611170 (-) True XLOC_008932
TCONS_00017636 mRNA downstream 77547 2182103 ~ 2188422 (-) False XLOC_008926
TCONS_00017638 mRNA downstream 77637 2182691 ~ 2188332 (-) True XLOC_008926
TCONS_00017637 mRNA downstream 81331 2182540 ~ 2184638 (-) False XLOC_008926
TCONS_00017635 mRNA downstream 213710 2051128 ~ 2052259 (-) True XLOC_008925
TCONS_00017630 mRNA downstream 255043 1897375 ~ 2010926 (-) False XLOC_008924
TCONS_00017641 mRNA upstream 224121 2490204 ~ 2497568 (-) False XLOC_008929
TCONS_00017642 mRNA upstream 224152 2490235 ~ 2493771 (-) True XLOC_008929
TCONS_00017643 mRNA upstream 244678 2510761 ~ 2519640 (-) False XLOC_008930
TCONS_00017645 mRNA upstream 323866 2589949 ~ 2596125 (-) False XLOC_008931
TCONS_00017648 mRNA upstream 365338 2631421 ~ 2632891 (-) True XLOC_008934
TCONS_00017627 other downstream 428086 1834971 ~ 1837883 (-) True XLOC_008922
TCONS_00017597 other downstream 944063 1321790 ~ 1321906 (-) True XLOC_008910
TCONS_00017537 other downstream 1840213 425695 ~ 425756 (-) True XLOC_008873
TCONS_00017535 other downstream 1916402 349451 ~ 349567 (-) True XLOC_008870
TCONS_00017647 other upstream 358945 2625028 ~ 2625663 (-) True XLOC_008933
TCONS_00017655 other upstream 470300 2736383 ~ 2736498 (-) True XLOC_008940
TCONS_00017689 other upstream 1838325 4104408 ~ 4104526 (-) True XLOC_008968
TCONS_00017694 other upstream 2099075 4365158 ~ 4365272 (-) True XLOC_008973
TCONS_00017700 other upstream 2160411 4426494 ~ 4482147 (-) False XLOC_008974

Expression Profile

//